FuNGI

A0A550C686

Protein Details

Accession

A0A550C686

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-86	LESPSPLARKRKQKDGLDEEPE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, pero 6, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MPFRSKDDRPPADGDKFYYENTIPSQTYDGSISDLLEPPSSSGSSTAVSQFSDSTNRQGVKMPALESPSPLARKRKQKDGLDEEPEMLWRSAKTVKIEEGSSAGPSTDNDDVVLLAWEPSVQQTIDDYDLSIGVQWEIARLLSMKRITYNALTPEKLSALRGEIPPIAWAELDTEIETLKLDPEAGLGNSTVKPGWYGGKVVFPLKVKPKRVDRSGKGPITGYHIVLDHATLSSSTRFARKSGSAAFIRVKVAMDILRSNAGMMVDLFLKPFVLWDRVFRAFFAKDDNVFLYCTNETMGESGMLRTIDNGRQSLLDFVEFHNPLREGDKQLLCKWASRMALGLSNSVPGPRIDPRDIFETPDIVSTDGTNSDLTDGCGSAIQFRLGGMKGLLLQQPHSTISDRPQVTYRPSQLKIRGQPEHPSHLTIDLLRTSRMRTSVSISAEVIRNLEDNGVPRRALADLFRARITEVMEGLTNWEVGPKWDAQALGNARTARWRAQPAACHRSKRRSTRPGLGGGFDRPCADEEDDDDEPDELGFDPGLQRRSVAWVPDYESGCPSRLEETVMSLLDSGFTPDNSSICRAKLQEIYRSRARILTSKIKFTVPQSASAFVVPDPCGVLGPNEIHIKASRPAFKMEDGLEADIVVGDVLITRNPCKVPSDVRAVDHPELASYVDVIVVSAHPSTQRLLELLAGGDYDGDTCIVIWDQQIVAPFKNSDIKYATPPAGMLQGQFTRDNTTVDKFIRTHNAVQDNERKVAEIQRYLLSNLRDMTQLGMYSSFHENAIITHGYSNPRTVRLAHMFNTLMDSAKTGYSLTRAAWQDDFHKHFHKVGPKYRELASTRRRKKLEHPSDEYVTRSERSPYHRNSKEIMDYLVNVAEQEYNKLCIQMDEKFKALHLGDYENGIPPTRISRSPGSTRRSVIFEEAHIRRLAASYAYVHDWKEKRPFANSIVGDGWSRFPWNVAFRELCHIKADAVGYSKTVMMSFYERFKLAKM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.51
3	0.47
4	0.42
5	0.4
6	0.34
7	0.3
8	0.31
9	0.32
10	0.26
11	0.26
12	0.28
13	0.24
14	0.25
15	0.24
16	0.2
17	0.18
18	0.18
19	0.17
20	0.17
21	0.19
22	0.18
23	0.18
24	0.17
25	0.16
26	0.18
27	0.17
28	0.15
29	0.13
30	0.14
31	0.14
32	0.16
33	0.17
34	0.16
35	0.16
36	0.17
37	0.17
38	0.17
39	0.23
40	0.23
41	0.25
42	0.31
43	0.32
44	0.32
45	0.37
46	0.38
47	0.38
48	0.4
49	0.36
50	0.32
51	0.37
52	0.36
53	0.32
54	0.33
55	0.33
56	0.34
57	0.39
58	0.45
59	0.48
60	0.58
61	0.63
62	0.7
63	0.73
64	0.77
65	0.82
66	0.81
67	0.82
68	0.77
69	0.72
70	0.63
71	0.54
72	0.46
73	0.38
74	0.29
75	0.22
76	0.15
77	0.17
78	0.21
79	0.25
80	0.28
81	0.29
82	0.34
83	0.35
84	0.36
85	0.33
86	0.31
87	0.27
88	0.24
89	0.2
90	0.15
91	0.13
92	0.12
93	0.16
94	0.14
95	0.13
96	0.12
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.12
101	0.08
102	0.07
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.07
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.1
111	0.12
112	0.14
113	0.14
114	0.13
115	0.12
116	0.12
117	0.11
118	0.11
119	0.08
120	0.07
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.1
129	0.15
130	0.18
131	0.18
132	0.2
133	0.22
134	0.24
135	0.26
136	0.3
137	0.31
138	0.34
139	0.33
140	0.32
141	0.32
142	0.31
143	0.28
144	0.25
145	0.18
146	0.17
147	0.21
148	0.21
149	0.22
150	0.21
151	0.2
152	0.21
153	0.2
154	0.17
155	0.12
156	0.11
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.09
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.11
176	0.11
177	0.12
178	0.12
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.15
183	0.13
184	0.15
185	0.16
186	0.2
187	0.22
188	0.23
189	0.25
190	0.23
191	0.29
192	0.37
193	0.44
194	0.46
195	0.53
196	0.62
197	0.66
198	0.74
199	0.78
200	0.73
201	0.75
202	0.78
203	0.73
204	0.64
205	0.57
206	0.48
207	0.46
208	0.42
209	0.32
210	0.23
211	0.21
212	0.2
213	0.18
214	0.17
215	0.1
216	0.08
217	0.07
218	0.06
219	0.07
220	0.08
221	0.1
222	0.11
223	0.15
224	0.16
225	0.17
226	0.22
227	0.22
228	0.26
229	0.28
230	0.33
231	0.3
232	0.33
233	0.35
234	0.32
235	0.31
236	0.27
237	0.23
238	0.16
239	0.17
240	0.15
241	0.14
242	0.13
243	0.13
244	0.13
245	0.13
246	0.13
247	0.12
248	0.1
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.06
256	0.07
257	0.06
258	0.07
259	0.09
260	0.12
261	0.13
262	0.16
263	0.21
264	0.25
265	0.26
266	0.25
267	0.27
268	0.23
269	0.23
270	0.26
271	0.23
272	0.2
273	0.22
274	0.23
275	0.19
276	0.19
277	0.19
278	0.16
279	0.13
280	0.12
281	0.11
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.11
294	0.14
295	0.16
296	0.16
297	0.15
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.14
302	0.12
303	0.1
304	0.11
305	0.18
306	0.18
307	0.18
308	0.19
309	0.19
310	0.19
311	0.21
312	0.22
313	0.18
314	0.25
315	0.29
316	0.29
317	0.3
318	0.35
319	0.33
320	0.33
321	0.31
322	0.3
323	0.27
324	0.24
325	0.23
326	0.18
327	0.21
328	0.19
329	0.19
330	0.14
331	0.14
332	0.13
333	0.12
334	0.12
335	0.08
336	0.11
337	0.13
338	0.18
339	0.2
340	0.21
341	0.24
342	0.28
343	0.29
344	0.28
345	0.25
346	0.21
347	0.18
348	0.19
349	0.17
350	0.12
351	0.12
352	0.09
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.09
372	0.08
373	0.09
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.1
378	0.12
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.12
383	0.13
384	0.13
385	0.13
386	0.13
387	0.16
388	0.23
389	0.23
390	0.23
391	0.24
392	0.26
393	0.29
394	0.33
395	0.35
396	0.34
397	0.36
398	0.4
399	0.44
400	0.49
401	0.52
402	0.53
403	0.52
404	0.47
405	0.53
406	0.51
407	0.51
408	0.44
409	0.38
410	0.32
411	0.28
412	0.27
413	0.19
414	0.17
415	0.13
416	0.13
417	0.12
418	0.12
419	0.13
420	0.14
421	0.15
422	0.15
423	0.14
424	0.18
425	0.21
426	0.22
427	0.22
428	0.21
429	0.21
430	0.2
431	0.19
432	0.15
433	0.1
434	0.09
435	0.08
436	0.08
437	0.07
438	0.09
439	0.12
440	0.13
441	0.12
442	0.12
443	0.13
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.16
448	0.17
449	0.19
450	0.19
451	0.19
452	0.18
453	0.19
454	0.19
455	0.11
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.09
461	0.07
462	0.06
463	0.05
464	0.06
465	0.05
466	0.06
467	0.08
468	0.07
469	0.07
470	0.08
471	0.09
472	0.08
473	0.14
474	0.15
475	0.15
476	0.17
477	0.17
478	0.16
479	0.18
480	0.19
481	0.17
482	0.2
483	0.2
484	0.21
485	0.24
486	0.3
487	0.35
488	0.43
489	0.44
490	0.47
491	0.48
492	0.54
493	0.6
494	0.63
495	0.66
496	0.66
497	0.69
498	0.71
499	0.7
500	0.67
501	0.6
502	0.51
503	0.42
504	0.35
505	0.3
506	0.22
507	0.18
508	0.12
509	0.12
510	0.13
511	0.13
512	0.1
513	0.11
514	0.16
515	0.16
516	0.15
517	0.14
518	0.12
519	0.11
520	0.11
521	0.09
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.06
527	0.09
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.15
533	0.17
534	0.16
535	0.14
536	0.14
537	0.17
538	0.22
539	0.22
540	0.18
541	0.18
542	0.18
543	0.18
544	0.17
545	0.14
546	0.11
547	0.11
548	0.12
549	0.11
550	0.12
551	0.12
552	0.12
553	0.11
554	0.09
555	0.09
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.06
560	0.06
561	0.07
562	0.07
563	0.08
564	0.08
565	0.12
566	0.11
567	0.12
568	0.15
569	0.15
570	0.18
571	0.24
572	0.26
573	0.31
574	0.35
575	0.4
576	0.41
577	0.42
578	0.39
579	0.35
580	0.34
581	0.31
582	0.32
583	0.37
584	0.35
585	0.37
586	0.38
587	0.36
588	0.36
589	0.33
590	0.37
591	0.28
592	0.32
593	0.29
594	0.29
595	0.28
596	0.26
597	0.25
598	0.15
599	0.16
600	0.11
601	0.09
602	0.08
603	0.08
604	0.08
605	0.07
606	0.08
607	0.07
608	0.08
609	0.11
610	0.12
611	0.12
612	0.12
613	0.13
614	0.15
615	0.17
616	0.22
617	0.24
618	0.25
619	0.28
620	0.29
621	0.29
622	0.29
623	0.26
624	0.25
625	0.2
626	0.19
627	0.16
628	0.14
629	0.12
630	0.09
631	0.08
632	0.04
633	0.03
634	0.02
635	0.03
636	0.03
637	0.04
638	0.05
639	0.06
640	0.09
641	0.1
642	0.11
643	0.14
644	0.17
645	0.21
646	0.25
647	0.33
648	0.32
649	0.33
650	0.35
651	0.38
652	0.36
653	0.32
654	0.27
655	0.18
656	0.17
657	0.16
658	0.12
659	0.07
660	0.06
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.04
665	0.04
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.06
670	0.07
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.08
675	0.09
676	0.09
677	0.09
678	0.08
679	0.07
680	0.06
681	0.05
682	0.05
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.04
687	0.03
688	0.03
689	0.04
690	0.04
691	0.05
692	0.05
693	0.06
694	0.06
695	0.07
696	0.11
697	0.12
698	0.13
699	0.14
700	0.14
701	0.15
702	0.23
703	0.22
704	0.21
705	0.23
706	0.24
707	0.27
708	0.31
709	0.3
710	0.23
711	0.23
712	0.2
713	0.2
714	0.19
715	0.15
716	0.14
717	0.15
718	0.17
719	0.18
720	0.18
721	0.2
722	0.2
723	0.22
724	0.21
725	0.21
726	0.23
727	0.24
728	0.27
729	0.23
730	0.26
731	0.32
732	0.33
733	0.35
734	0.37
735	0.43
736	0.41
737	0.46
738	0.51
739	0.47
740	0.46
741	0.42
742	0.36
743	0.3
744	0.35
745	0.34
746	0.28
747	0.27
748	0.27
749	0.28
750	0.28
751	0.31
752	0.26
753	0.24
754	0.21
755	0.2
756	0.18
757	0.17
758	0.17
759	0.15
760	0.14
761	0.11
762	0.12
763	0.11
764	0.13
765	0.16
766	0.14
767	0.13
768	0.13
769	0.13
770	0.12
771	0.16
772	0.13
773	0.11
774	0.11
775	0.14
776	0.18
777	0.19
778	0.24
779	0.22
780	0.24
781	0.25
782	0.25
783	0.3
784	0.33
785	0.36
786	0.33
787	0.35
788	0.33
789	0.32
790	0.33
791	0.26
792	0.2
793	0.16
794	0.15
795	0.12
796	0.11
797	0.11
798	0.09
799	0.09
800	0.1
801	0.12
802	0.12
803	0.18
804	0.19
805	0.22
806	0.23
807	0.24
808	0.28
809	0.35
810	0.38
811	0.35
812	0.38
813	0.38
814	0.4
815	0.45
816	0.48
817	0.48
818	0.55
819	0.59
820	0.58
821	0.6
822	0.58
823	0.6
824	0.54
825	0.56
826	0.56
827	0.59
828	0.64
829	0.7
830	0.7
831	0.67
832	0.73
833	0.75
834	0.76
835	0.75
836	0.73
837	0.71
838	0.73
839	0.7
840	0.62
841	0.53
842	0.45
843	0.36
844	0.3
845	0.27
846	0.28
847	0.34
848	0.41
849	0.47
850	0.55
851	0.59
852	0.62
853	0.61
854	0.62
855	0.61
856	0.53
857	0.48
858	0.39
859	0.34
860	0.31
861	0.29
862	0.22
863	0.15
864	0.14
865	0.14
866	0.13
867	0.16
868	0.16
869	0.18
870	0.19
871	0.2
872	0.19
873	0.19
874	0.22
875	0.25
876	0.32
877	0.32
878	0.33
879	0.32
880	0.32
881	0.35
882	0.32
883	0.29
884	0.22
885	0.23
886	0.22
887	0.25
888	0.25
889	0.23
890	0.23
891	0.2
892	0.18
893	0.16
894	0.21
895	0.22
896	0.24
897	0.26
898	0.32
899	0.39
900	0.49
901	0.56
902	0.56
903	0.58
904	0.59
905	0.58
906	0.54
907	0.49
908	0.45
909	0.39
910	0.37
911	0.4
912	0.38
913	0.38
914	0.35
915	0.32
916	0.28
917	0.26
918	0.24
919	0.16
920	0.16
921	0.15
922	0.17
923	0.21
924	0.22
925	0.22
926	0.3
927	0.31
928	0.36
929	0.44
930	0.48
931	0.48
932	0.52
933	0.56
934	0.52
935	0.59
936	0.52
937	0.47
938	0.42
939	0.39
940	0.34
941	0.3
942	0.28
943	0.2
944	0.21
945	0.17
946	0.17
947	0.22
948	0.27
949	0.28
950	0.32
951	0.33
952	0.33
953	0.42
954	0.43
955	0.38
956	0.35
957	0.32
958	0.27
959	0.28
960	0.27
961	0.21
962	0.23
963	0.22
964	0.2
965	0.2
966	0.2
967	0.18
968	0.16
969	0.14
970	0.13
971	0.18
972	0.2
973	0.24
974	0.27
975	0.28

A0A550C686

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer