Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CJX1

Protein Details
Accession A0A550CJX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-318SGMSKAMEKRKREREERQRMLEAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-59GVKRPEKKSTAWLRANK
290-325KANEGSGMSKAMEKRKREREERQRMLEAKRRKVRGE
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10.5, cyto_mito 8, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025066  CCDC174-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF13300  DUF4078  
Amino Acid Sequences MSKAKAKSFAASSLLDLKAELAQQEAEAKTRRAAGGKEYVAGGVKRPEKKSTAWLRANKGVKARAERDLQMEALDRPTLESSRARLEEKARMYDKLKRGQTAGLDTAQYDALLVDFDAKGYQAHSDDEDESLTIPRVPDEANDPIVEYVDDLGRTRSARKSEVPREFMFQFEEGGAEDSDEDIIIRNPDGFFPTYQPTAERVTQIEEEFAEQGRTEAHYDARGENRARGAAFYAFSADEEERKRQMEELRAARDETRTVRTEMGVTEVGVGEVEGMRVGDEEGDGKQKGKANEGSGMSKAMEKRKREREERQRMLEAKRRKVRGEPAPEEPVRAPASSNTVRDPLEALEAQSGVAKRDEADAFLAALETELRGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.27
3 0.23
4 0.2
5 0.18
6 0.19
7 0.16
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.17
12 0.16
13 0.19
14 0.22
15 0.23
16 0.24
17 0.28
18 0.29
19 0.29
20 0.3
21 0.31
22 0.36
23 0.36
24 0.35
25 0.31
26 0.3
27 0.29
28 0.28
29 0.24
30 0.23
31 0.3
32 0.36
33 0.39
34 0.43
35 0.44
36 0.47
37 0.54
38 0.57
39 0.6
40 0.62
41 0.66
42 0.67
43 0.72
44 0.74
45 0.67
46 0.63
47 0.59
48 0.56
49 0.57
50 0.54
51 0.52
52 0.51
53 0.49
54 0.47
55 0.43
56 0.37
57 0.3
58 0.28
59 0.22
60 0.19
61 0.17
62 0.14
63 0.13
64 0.15
65 0.14
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.25
70 0.28
71 0.28
72 0.3
73 0.34
74 0.38
75 0.39
76 0.45
77 0.39
78 0.41
79 0.43
80 0.47
81 0.5
82 0.51
83 0.51
84 0.46
85 0.45
86 0.44
87 0.44
88 0.4
89 0.35
90 0.28
91 0.24
92 0.22
93 0.21
94 0.18
95 0.14
96 0.09
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.08
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.12
143 0.16
144 0.18
145 0.21
146 0.27
147 0.36
148 0.44
149 0.5
150 0.52
151 0.49
152 0.5
153 0.47
154 0.42
155 0.34
156 0.25
157 0.18
158 0.12
159 0.12
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.17
186 0.17
187 0.16
188 0.14
189 0.16
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.08
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.16
209 0.2
210 0.2
211 0.21
212 0.21
213 0.21
214 0.19
215 0.17
216 0.17
217 0.13
218 0.12
219 0.1
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.11
224 0.1
225 0.12
226 0.15
227 0.18
228 0.19
229 0.2
230 0.2
231 0.22
232 0.26
233 0.29
234 0.35
235 0.38
236 0.4
237 0.4
238 0.41
239 0.38
240 0.35
241 0.31
242 0.26
243 0.25
244 0.23
245 0.24
246 0.24
247 0.23
248 0.23
249 0.2
250 0.2
251 0.15
252 0.13
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.08
257 0.08
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.15
274 0.2
275 0.21
276 0.26
277 0.3
278 0.29
279 0.34
280 0.36
281 0.35
282 0.31
283 0.32
284 0.26
285 0.25
286 0.27
287 0.31
288 0.35
289 0.39
290 0.49
291 0.58
292 0.67
293 0.72
294 0.79
295 0.81
296 0.85
297 0.88
298 0.85
299 0.83
300 0.79
301 0.78
302 0.76
303 0.75
304 0.74
305 0.73
306 0.71
307 0.67
308 0.69
309 0.7
310 0.71
311 0.72
312 0.67
313 0.65
314 0.68
315 0.65
316 0.6
317 0.51
318 0.47
319 0.38
320 0.33
321 0.27
322 0.21
323 0.29
324 0.3
325 0.32
326 0.3
327 0.32
328 0.32
329 0.31
330 0.31
331 0.23
332 0.24
333 0.22
334 0.2
335 0.18
336 0.17
337 0.17
338 0.19
339 0.18
340 0.15
341 0.15
342 0.15
343 0.13
344 0.19
345 0.2
346 0.17
347 0.19
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.1
353 0.09
354 0.08