Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550C5C8

Protein Details
Accession A0A550C5C8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-189APPVQPRPRLPRPRPSRPVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-186KGKGKLAAPPVQPRPRLPRPRPSR
207-213GRRKRKR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 9, mito 7, cyto 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000608  UBQ-conjugat_E2  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
Pfam View protein in Pfam  
PF00179  UQ_con  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50127  UBC_2  
CDD cd00195  UBCc  
Amino Acid Sequences MPPPGLSSQMTVRRIHREIADLKKEDLNGIKLAPDEANIYLWKAVIPGPEGSVYEGGLFDVEIHLPADYPFSAPKLAFKTRIYHMNISDTGNICLDILKGNWSPALSLFKVILSLSSLLTDPNPDDPLVPTIAQQYKKDRKHHDDIARSWTRQYASGRGTVDKGKGKLAAPPVQPRPRLPRPRPSRPVPSSDIIVVDDSDDEHATPGRRKRKRAAAVGEGDVIDLVDEDDEPARKRPANGTGGPSDVPGDRARGDSPILIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.43
4 0.42
5 0.47
6 0.52
7 0.56
8 0.5
9 0.51
10 0.5
11 0.48
12 0.44
13 0.4
14 0.33
15 0.26
16 0.24
17 0.23
18 0.2
19 0.21
20 0.18
21 0.14
22 0.13
23 0.12
24 0.14
25 0.13
26 0.14
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.14
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.06
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.11
61 0.15
62 0.2
63 0.23
64 0.26
65 0.28
66 0.31
67 0.33
68 0.41
69 0.41
70 0.39
71 0.37
72 0.37
73 0.37
74 0.34
75 0.34
76 0.27
77 0.23
78 0.19
79 0.17
80 0.13
81 0.11
82 0.1
83 0.07
84 0.06
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.15
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.12
98 0.11
99 0.09
100 0.06
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.12
119 0.17
120 0.18
121 0.2
122 0.28
123 0.36
124 0.43
125 0.51
126 0.55
127 0.58
128 0.63
129 0.7
130 0.69
131 0.67
132 0.62
133 0.64
134 0.59
135 0.52
136 0.45
137 0.39
138 0.31
139 0.29
140 0.28
141 0.25
142 0.23
143 0.27
144 0.28
145 0.26
146 0.27
147 0.25
148 0.28
149 0.26
150 0.25
151 0.23
152 0.24
153 0.23
154 0.26
155 0.29
156 0.31
157 0.31
158 0.37
159 0.45
160 0.49
161 0.5
162 0.51
163 0.54
164 0.58
165 0.65
166 0.64
167 0.66
168 0.69
169 0.77
170 0.81
171 0.79
172 0.79
173 0.72
174 0.73
175 0.67
176 0.6
177 0.51
178 0.44
179 0.37
180 0.28
181 0.24
182 0.17
183 0.12
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.1
191 0.12
192 0.19
193 0.27
194 0.36
195 0.43
196 0.5
197 0.58
198 0.67
199 0.73
200 0.76
201 0.76
202 0.74
203 0.72
204 0.67
205 0.6
206 0.49
207 0.39
208 0.29
209 0.21
210 0.12
211 0.07
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.07
217 0.1
218 0.12
219 0.16
220 0.21
221 0.23
222 0.26
223 0.31
224 0.38
225 0.43
226 0.45
227 0.48
228 0.46
229 0.46
230 0.43
231 0.38
232 0.31
233 0.24
234 0.22
235 0.18
236 0.18
237 0.17
238 0.19
239 0.19
240 0.2
241 0.21