Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550BXA6

Protein Details
Accession A0A550BXA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-71GGASGKPPPAKKRKGQHKKARNQHWDDPGNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-62ASGKPPPAKKRKGQHKKAR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MALRPDPRASRPVLAYDDISLPYDDAHASGGPAPTAEAQRNGGASGKPPPAKKRKGQHKKARNQHWDDPGNSTTAPPPATSSAPSREGNSSSALPHAVSSSAPPENRVQDVVEESRELTYEEIWDDSALIDAWDAANQEYEAYHGKGKSWKDEPIRKWYNVPPAKLESQPTTHGPTTAAAAAHGVAQNGLQPLNYDTFVASHDASLGEGDERQDGVDIVTHPPEAADGLGRVSDSMFPDTAALRGLGVTQDDAFSRAMNAMYWTGYWTAVYHSNRGSQAAKTGKKRDAQDMEEGEEEVDEEVNEEEAMDDVQDGFVSSQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.36
3 0.33
4 0.31
5 0.26
6 0.25
7 0.2
8 0.16
9 0.14
10 0.14
11 0.11
12 0.09
13 0.1
14 0.08
15 0.09
16 0.12
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.17
23 0.18
24 0.18
25 0.19
26 0.21
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.18
31 0.18
32 0.23
33 0.28
34 0.32
35 0.37
36 0.46
37 0.54
38 0.62
39 0.68
40 0.72
41 0.76
42 0.82
43 0.88
44 0.89
45 0.9
46 0.92
47 0.93
48 0.94
49 0.93
50 0.89
51 0.87
52 0.85
53 0.8
54 0.71
55 0.66
56 0.56
57 0.47
58 0.39
59 0.32
60 0.24
61 0.21
62 0.2
63 0.14
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.19
68 0.22
69 0.23
70 0.27
71 0.28
72 0.28
73 0.28
74 0.28
75 0.27
76 0.26
77 0.22
78 0.18
79 0.18
80 0.16
81 0.14
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.11
88 0.14
89 0.14
90 0.16
91 0.19
92 0.21
93 0.22
94 0.22
95 0.18
96 0.16
97 0.19
98 0.19
99 0.16
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.1
132 0.12
133 0.17
134 0.18
135 0.22
136 0.23
137 0.29
138 0.35
139 0.43
140 0.45
141 0.5
142 0.54
143 0.5
144 0.51
145 0.49
146 0.52
147 0.47
148 0.45
149 0.38
150 0.36
151 0.38
152 0.35
153 0.33
154 0.25
155 0.23
156 0.24
157 0.23
158 0.24
159 0.22
160 0.21
161 0.19
162 0.17
163 0.16
164 0.15
165 0.12
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.08
221 0.09
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.1
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.11
256 0.19
257 0.2
258 0.23
259 0.24
260 0.29
261 0.29
262 0.33
263 0.32
264 0.25
265 0.31
266 0.37
267 0.43
268 0.46
269 0.53
270 0.56
271 0.6
272 0.63
273 0.65
274 0.64
275 0.6
276 0.6
277 0.56
278 0.53
279 0.47
280 0.43
281 0.33
282 0.25
283 0.21
284 0.13
285 0.1
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06