Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550CHG0

Protein Details
Accession A0A550CHG0    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-204RLDNRKPTWKLKRWITRSRNRIRELRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 8cyto_nucl 8, nucl 7, cyto 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF12937  F-box-like  
Amino Acid Sequences MSWELLRKDGIQQYKKRKYAEAAVLFTKAIEQGGQKEYTLYDARAATNEQLGDIKHGLLDAKQVIDLAPAQWQGYCRAARLFFRANRFEEAAKMADRAIARLSVGDTSRRVEMVNLKQSALDERRRTQDHTARLPVELLGEVFRFVVDADFALLLPILTVCTRWRGVAEANPSLWTVLRLDNRKPTWKLKRWITRSRNRIRELRFGPALGDKLDWSFDALADLDWERMRILRIACWRAATFLERIGRSHILANLLELEVIDETPSAYCSGLLANEASSLRSLKLRSLAIPQSLEDGLRALRGLEHLHLDSPISPVHILLDMCDSALQTLVVECAMRPLTNLPLPDEGSVRVLPALTRLELAGPVGIDWLIRALDIRAVQRLSITREVVELTVPLFHLASLSSASLKLTHIAIDRCSFAAPALVHLLAVSPSLQSLELRSIADVANTVLEHLEAPRPGKRTRSDRLICPKLRRVVVANCPDVKTGPVLRMVGSRLPRGTATSGAQTPGDTVVQAASGSLPQTPSNALARKISDSLARASSNSLAQAPSDFRTKEPSSEGGEAGQESEGGVAEPVVEKIRELVLDGCPEIEAEHLPWLKERVRHVSCMYMSKKVAAWKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.78
3 0.74
4 0.73
5 0.69
6 0.7
7 0.71
8 0.67
9 0.62
10 0.58
11 0.55
12 0.49
13 0.42
14 0.33
15 0.23
16 0.15
17 0.13
18 0.13
19 0.17
20 0.22
21 0.23
22 0.22
23 0.22
24 0.22
25 0.25
26 0.26
27 0.21
28 0.21
29 0.22
30 0.22
31 0.23
32 0.25
33 0.22
34 0.22
35 0.22
36 0.18
37 0.18
38 0.18
39 0.2
40 0.18
41 0.17
42 0.13
43 0.14
44 0.14
45 0.13
46 0.17
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.15
54 0.11
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.16
60 0.17
61 0.23
62 0.23
63 0.21
64 0.25
65 0.28
66 0.3
67 0.36
68 0.41
69 0.4
70 0.48
71 0.52
72 0.5
73 0.51
74 0.51
75 0.45
76 0.38
77 0.36
78 0.31
79 0.26
80 0.23
81 0.19
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.16
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.15
92 0.17
93 0.17
94 0.18
95 0.2
96 0.19
97 0.18
98 0.18
99 0.26
100 0.31
101 0.38
102 0.37
103 0.36
104 0.36
105 0.37
106 0.41
107 0.39
108 0.39
109 0.36
110 0.4
111 0.47
112 0.5
113 0.53
114 0.55
115 0.56
116 0.56
117 0.58
118 0.6
119 0.54
120 0.51
121 0.47
122 0.38
123 0.31
124 0.23
125 0.16
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.17
154 0.21
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.25
159 0.25
160 0.22
161 0.2
162 0.15
163 0.11
164 0.15
165 0.21
166 0.24
167 0.28
168 0.36
169 0.4
170 0.47
171 0.5
172 0.55
173 0.59
174 0.64
175 0.7
176 0.71
177 0.77
178 0.78
179 0.85
180 0.85
181 0.83
182 0.85
183 0.86
184 0.85
185 0.8
186 0.79
187 0.73
188 0.73
189 0.66
190 0.62
191 0.53
192 0.44
193 0.4
194 0.34
195 0.3
196 0.21
197 0.18
198 0.12
199 0.11
200 0.12
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.11
217 0.11
218 0.15
219 0.22
220 0.24
221 0.25
222 0.26
223 0.25
224 0.24
225 0.24
226 0.21
227 0.15
228 0.17
229 0.2
230 0.18
231 0.19
232 0.21
233 0.21
234 0.2
235 0.21
236 0.18
237 0.16
238 0.15
239 0.15
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.08
244 0.07
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.2
274 0.22
275 0.21
276 0.21
277 0.2
278 0.18
279 0.17
280 0.16
281 0.11
282 0.09
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.08
304 0.07
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.1
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.15
331 0.16
332 0.15
333 0.13
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.09
341 0.09
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.06
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.04
360 0.06
361 0.08
362 0.09
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.15
368 0.18
369 0.19
370 0.19
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.14
376 0.1
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.12
397 0.13
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.14
404 0.1
405 0.13
406 0.11
407 0.11
408 0.12
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.06
420 0.05
421 0.07
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.1
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.1
439 0.1
440 0.13
441 0.17
442 0.21
443 0.23
444 0.3
445 0.37
446 0.42
447 0.48
448 0.56
449 0.57
450 0.62
451 0.71
452 0.74
453 0.72
454 0.72
455 0.72
456 0.68
457 0.65
458 0.59
459 0.54
460 0.52
461 0.55
462 0.54
463 0.52
464 0.48
465 0.47
466 0.45
467 0.4
468 0.32
469 0.28
470 0.22
471 0.19
472 0.2
473 0.2
474 0.2
475 0.22
476 0.23
477 0.24
478 0.26
479 0.27
480 0.24
481 0.25
482 0.25
483 0.25
484 0.25
485 0.23
486 0.22
487 0.22
488 0.23
489 0.23
490 0.22
491 0.19
492 0.18
493 0.16
494 0.14
495 0.1
496 0.09
497 0.08
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.09
506 0.09
507 0.11
508 0.12
509 0.15
510 0.21
511 0.24
512 0.25
513 0.27
514 0.29
515 0.31
516 0.31
517 0.3
518 0.27
519 0.25
520 0.27
521 0.28
522 0.26
523 0.23
524 0.24
525 0.25
526 0.22
527 0.21
528 0.19
529 0.15
530 0.15
531 0.17
532 0.18
533 0.18
534 0.23
535 0.22
536 0.22
537 0.3
538 0.31
539 0.32
540 0.34
541 0.35
542 0.35
543 0.37
544 0.36
545 0.29
546 0.28
547 0.25
548 0.22
549 0.17
550 0.11
551 0.09
552 0.08
553 0.07
554 0.06
555 0.06
556 0.05
557 0.05
558 0.06
559 0.07
560 0.1
561 0.1
562 0.09
563 0.11
564 0.13
565 0.13
566 0.14
567 0.15
568 0.16
569 0.19
570 0.19
571 0.18
572 0.16
573 0.16
574 0.14
575 0.13
576 0.11
577 0.1
578 0.17
579 0.18
580 0.19
581 0.22
582 0.27
583 0.3
584 0.34
585 0.39
586 0.43
587 0.45
588 0.5
589 0.5
590 0.54
591 0.52
592 0.57
593 0.54
594 0.5
595 0.48
596 0.45
597 0.46