FuNGI

A0A550CSG2

Protein Details

Accession

A0A550CSG2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MARRKCPVCGSKQWHKEPSS	Hydrophilic
44-69	MNTTHVLRRRRMKTGREKKKARGGAD	Basic
587-608	VEKYERRFVRWWQTERRRSRGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
51-70	RRRRMKTGREKKKARGGADP
243-252	RKKRGQGARR

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto_nucl 7.5, nucl 7, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033599 TAF1B/Rrn7
Gene Ontology	GO:0070860 C:RNA polymerase I core factor complex GO:0046872 F:metal ion binding GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding

Amino Acid Sequences

MARRKCPVCGSKQWHKEPSSGLVACSEGHILQNYRNETNEADEMNTTHVLRRRRMKTGREKKKARGGADPKLYHGARGRFHYFQCQQLILRRQISELRALWDLPPEFEAICRDLWALHLSLLPTPPSPEPYIHAQELSGESELRGAEPTTLAAAGPITQDGSLVSPAKPPNNGEDSDSNDSGNSDEDGVNGSDESDGAPLEDDPELAAMLREASIASSSSEDEDDNEDGHGASAGDFPSETPRKKRGQGARRRYEAPPSTIAVLALTCWVLRVPAMYLDFIRLIQSYDLTYLDPLRFLPAEMLRHLTKHSVQALSPPFPPTTLALHSLTSRLAKLAGARYGIHVPEANAAPVLWRVTKYMGGTPVLYHLTKRLAGVLSLPLTAHRSMAPGLEAVKKHDPESHDYDDVPPEVALLAATIVVLKMVYGLDGNMRTADADDDQACALPRLDDYLAHLRKMEDEETCETDGLFGARSVATFDDASVDAYLAFCEKALLGPRDEGSGRLAEFFPRAPRESGLGAGKPERREEGRVLRAGIASHGASEARPGEQYPVYNARDVLGTLPGPLGLVVARGAQWVGVPETYVGGVVEKYERRFVRWWQTERRRSRGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.76
3	0.72
4	0.66
5	0.63
6	0.61
7	0.52
8	0.43
9	0.36
10	0.34
11	0.29
12	0.26
13	0.21
14	0.12
15	0.13
16	0.17
17	0.17
18	0.21
19	0.28
20	0.32
21	0.32
22	0.33
23	0.33
24	0.31
25	0.34
26	0.32
27	0.26
28	0.23
29	0.22
30	0.21
31	0.22
32	0.23
33	0.19
34	0.21
35	0.25
36	0.3
37	0.37
38	0.46
39	0.5
40	0.58
41	0.66
42	0.72
43	0.78
44	0.83
45	0.86
46	0.87
47	0.89
48	0.87
49	0.89
50	0.86
51	0.79
52	0.78
53	0.75
54	0.74
55	0.76
56	0.68
57	0.6
58	0.61
59	0.57
60	0.5
61	0.49
62	0.46
63	0.4
64	0.46
65	0.49
66	0.45
67	0.47
68	0.52
69	0.48
70	0.48
71	0.48
72	0.44
73	0.41
74	0.45
75	0.51
76	0.48
77	0.48
78	0.42
79	0.41
80	0.44
81	0.43
82	0.41
83	0.35
84	0.31
85	0.29
86	0.29
87	0.27
88	0.28
89	0.26
90	0.2
91	0.19
92	0.17
93	0.16
94	0.16
95	0.18
96	0.13
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.11
101	0.13
102	0.14
103	0.12
104	0.11
105	0.12
106	0.12
107	0.14
108	0.15
109	0.15
110	0.13
111	0.15
112	0.16
113	0.18
114	0.2
115	0.19
116	0.21
117	0.27
118	0.31
119	0.29
120	0.28
121	0.24
122	0.24
123	0.25
124	0.23
125	0.17
126	0.12
127	0.11
128	0.12
129	0.12
130	0.11
131	0.1
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.05
146	0.06
147	0.06
148	0.07
149	0.09
150	0.1
151	0.1
152	0.15
153	0.18
154	0.2
155	0.22
156	0.22
157	0.26
158	0.28
159	0.29
160	0.28
161	0.28
162	0.32
163	0.35
164	0.34
165	0.28
166	0.24
167	0.24
168	0.2
169	0.18
170	0.12
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.05
186	0.04
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.03
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.09
214	0.09
215	0.08
216	0.08
217	0.07
218	0.05
219	0.05
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.13
226	0.19
227	0.21
228	0.25
229	0.32
230	0.37
231	0.41
232	0.5
233	0.52
234	0.58
235	0.66
236	0.72
237	0.74
238	0.73
239	0.73
240	0.66
241	0.64
242	0.57
243	0.5
244	0.42
245	0.34
246	0.3
247	0.26
248	0.25
249	0.16
250	0.12
251	0.09
252	0.06
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.09
266	0.1
267	0.09
268	0.09
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.07
281	0.07
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.09
286	0.1
287	0.12
288	0.12
289	0.15
290	0.14
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.14
295	0.16
296	0.18
297	0.16
298	0.16
299	0.22
300	0.24
301	0.24
302	0.24
303	0.22
304	0.19
305	0.18
306	0.19
307	0.14
308	0.14
309	0.13
310	0.16
311	0.15
312	0.15
313	0.15
314	0.15
315	0.15
316	0.13
317	0.11
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.1
322	0.12
323	0.12
324	0.13
325	0.13
326	0.14
327	0.16
328	0.15
329	0.14
330	0.11
331	0.1
332	0.12
333	0.12
334	0.1
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.09
344	0.12
345	0.13
346	0.14
347	0.15
348	0.16
349	0.15
350	0.14
351	0.16
352	0.16
353	0.15
354	0.12
355	0.12
356	0.14
357	0.14
358	0.14
359	0.14
360	0.12
361	0.12
362	0.13
363	0.14
364	0.12
365	0.11
366	0.11
367	0.09
368	0.12
369	0.12
370	0.11
371	0.09
372	0.09
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.08
377	0.1
378	0.14
379	0.14
380	0.17
381	0.23
382	0.23
383	0.24
384	0.27
385	0.27
386	0.29
387	0.36
388	0.36
389	0.32
390	0.31
391	0.32
392	0.3
393	0.28
394	0.22
395	0.15
396	0.1
397	0.08
398	0.08
399	0.06
400	0.04
401	0.04
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.02
409	0.03
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.04
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.07
423	0.09
424	0.09
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.1
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.07
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.15
437	0.24
438	0.25
439	0.25
440	0.26
441	0.23
442	0.26
443	0.29
444	0.25
445	0.17
446	0.19
447	0.23
448	0.25
449	0.26
450	0.23
451	0.2
452	0.18
453	0.17
454	0.13
455	0.1
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.1
466	0.1
467	0.11
468	0.1
469	0.1
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.07
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.08
479	0.15
480	0.17
481	0.18
482	0.2
483	0.21
484	0.23
485	0.24
486	0.22
487	0.17
488	0.18
489	0.16
490	0.16
491	0.16
492	0.15
493	0.16
494	0.18
495	0.22
496	0.24
497	0.27
498	0.27
499	0.28
500	0.29
501	0.29
502	0.31
503	0.29
504	0.27
505	0.27
506	0.31
507	0.35
508	0.34
509	0.35
510	0.36
511	0.35
512	0.37
513	0.42
514	0.46
515	0.49
516	0.5
517	0.49
518	0.45
519	0.43
520	0.39
521	0.32
522	0.25
523	0.17
524	0.14
525	0.14
526	0.12
527	0.1
528	0.13
529	0.13
530	0.12
531	0.12
532	0.13
533	0.16
534	0.19
535	0.2
536	0.23
537	0.3
538	0.31
539	0.32
540	0.31
541	0.28
542	0.26
543	0.26
544	0.21
545	0.16
546	0.14
547	0.13
548	0.13
549	0.12
550	0.11
551	0.1
552	0.09
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.07
557	0.07
558	0.08
559	0.08
560	0.07
561	0.08
562	0.1
563	0.11
564	0.1
565	0.11
566	0.11
567	0.12
568	0.11
569	0.11
570	0.09
571	0.08
572	0.08
573	0.09
574	0.15
575	0.19
576	0.21
577	0.3
578	0.31
579	0.35
580	0.4
581	0.47
582	0.52
583	0.58
584	0.64
585	0.67
586	0.77
587	0.82
588	0.86

A0A550CSG2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer