Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CCX8

Protein Details
Accession A0A550CCX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
464-487FSGRGNGKRGRGRGRGRGRGGRGYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-187RRQREAAQRKARAEHEREAERAAAEQRQKAKAQSKKAQAQDKR
467-485RGNGKRGRGRGRGRGRGGR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002110  Ankyrin_rpt  
IPR036770  Ankyrin_rpt-contain_sf  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR036869  J_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13637  Ank_4  
PF00226  DnaJ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50297  ANK_REP_REGION  
PS50088  ANK_REPEAT  
PS50076  DNAJ_2  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MRGDTLETVKTKYKQVALRTHPDKNPDNPDATARFQEVSEAYNVLLKHLDTSTPEPRHYHPFGYNDDDSEDEYDEYEDEYDDDYYSDDEEMDFYMYLFEELMHNRASRFAHAHFFHAFKPRQETPEEFQARVRHQREEQVAAEARRQREAAQRKARAEHEREAERAAAEQRQKAKAQSKKAQAQDKRVKAETAARNQKQQVQQKRSAVFAAARAGQVDVVKKGIWEDSVDPTGGEVKPGCDDFVVKLPQDRQETLLHIAAKDGNLELVEWLDAHSADPEERNAAGHTAFHVALQQGHIPIATHFFEAYPPGEEDHEGVYSIPDEAQSSLLLAVQANEPELVFQLFENKQATPTDAQQALAYARSSAGRSIMLGLGKGQPKPVTQEKYGDTLELLVRYGGTKTVPGSDSESEDSDASSAKDAASSDGLQSNGYVPPRQNGQHARAPSQQFRANEEPSRPSSQQSFSGRGNGKRGRGRGRGRGRGGRGYAYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.55
3 0.61
4 0.62
5 0.69
6 0.71
7 0.73
8 0.7
9 0.72
10 0.69
11 0.67
12 0.68
13 0.62
14 0.59
15 0.52
16 0.54
17 0.51
18 0.48
19 0.42
20 0.36
21 0.31
22 0.27
23 0.29
24 0.24
25 0.21
26 0.19
27 0.17
28 0.15
29 0.17
30 0.17
31 0.15
32 0.15
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.16
37 0.17
38 0.24
39 0.32
40 0.35
41 0.38
42 0.39
43 0.42
44 0.49
45 0.48
46 0.47
47 0.43
48 0.44
49 0.46
50 0.5
51 0.47
52 0.39
53 0.37
54 0.33
55 0.29
56 0.25
57 0.22
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.08
87 0.09
88 0.11
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.17
93 0.18
94 0.19
95 0.22
96 0.22
97 0.29
98 0.29
99 0.33
100 0.31
101 0.32
102 0.32
103 0.37
104 0.38
105 0.33
106 0.39
107 0.4
108 0.4
109 0.43
110 0.45
111 0.4
112 0.48
113 0.48
114 0.41
115 0.42
116 0.44
117 0.45
118 0.5
119 0.48
120 0.42
121 0.42
122 0.48
123 0.48
124 0.47
125 0.43
126 0.39
127 0.41
128 0.36
129 0.4
130 0.37
131 0.34
132 0.31
133 0.31
134 0.27
135 0.33
136 0.41
137 0.45
138 0.51
139 0.56
140 0.57
141 0.62
142 0.65
143 0.64
144 0.61
145 0.57
146 0.53
147 0.5
148 0.47
149 0.44
150 0.38
151 0.3
152 0.26
153 0.22
154 0.2
155 0.2
156 0.24
157 0.28
158 0.31
159 0.32
160 0.36
161 0.43
162 0.45
163 0.51
164 0.55
165 0.59
166 0.63
167 0.68
168 0.71
169 0.68
170 0.72
171 0.72
172 0.7
173 0.66
174 0.59
175 0.53
176 0.45
177 0.49
178 0.45
179 0.46
180 0.5
181 0.46
182 0.5
183 0.51
184 0.56
185 0.55
186 0.57
187 0.57
188 0.54
189 0.59
190 0.6
191 0.6
192 0.54
193 0.47
194 0.39
195 0.3
196 0.24
197 0.2
198 0.15
199 0.13
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.14
234 0.16
235 0.21
236 0.24
237 0.23
238 0.21
239 0.21
240 0.23
241 0.23
242 0.24
243 0.19
244 0.16
245 0.16
246 0.14
247 0.12
248 0.11
249 0.08
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.12
331 0.12
332 0.15
333 0.17
334 0.16
335 0.18
336 0.18
337 0.21
338 0.17
339 0.19
340 0.22
341 0.21
342 0.21
343 0.19
344 0.2
345 0.18
346 0.17
347 0.15
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.11
352 0.1
353 0.11
354 0.09
355 0.1
356 0.11
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.12
361 0.17
362 0.19
363 0.2
364 0.21
365 0.21
366 0.22
367 0.28
368 0.36
369 0.36
370 0.35
371 0.41
372 0.4
373 0.43
374 0.42
375 0.36
376 0.27
377 0.24
378 0.23
379 0.17
380 0.15
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.09
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.15
390 0.15
391 0.16
392 0.21
393 0.21
394 0.25
395 0.25
396 0.26
397 0.22
398 0.22
399 0.2
400 0.15
401 0.15
402 0.12
403 0.11
404 0.1
405 0.08
406 0.1
407 0.1
408 0.12
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.17
413 0.17
414 0.16
415 0.16
416 0.16
417 0.17
418 0.18
419 0.2
420 0.18
421 0.22
422 0.28
423 0.3
424 0.37
425 0.4
426 0.44
427 0.48
428 0.51
429 0.53
430 0.55
431 0.6
432 0.58
433 0.57
434 0.57
435 0.51
436 0.55
437 0.56
438 0.54
439 0.53
440 0.52
441 0.51
442 0.5
443 0.56
444 0.49
445 0.47
446 0.46
447 0.45
448 0.49
449 0.48
450 0.48
451 0.43
452 0.51
453 0.53
454 0.53
455 0.59
456 0.56
457 0.59
458 0.62
459 0.68
460 0.68
461 0.71
462 0.75
463 0.76
464 0.8
465 0.82
466 0.83
467 0.84
468 0.81
469 0.8
470 0.75