Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CED6

Protein Details
Accession A0A550CED6    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MDGPKFTKKRKITDKSIPNTVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
542-553KLKTSKKEKERK
690-741KRTESRGESRPPSRAPSRPGSSLGRKRADSNVTAGGKEDKEKDKDKDRSRKM
754-755KK
818-827SPKPPPPPRI
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027267  AH/BAR_dom_sf  
IPR004148  BAR_dom  
IPR036028  SH3-like_dom_sf  
IPR001452  SH3_domain  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF03114  BAR  
PF00018  SH3_1  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51021  BAR  
PS50002  SH3  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd00174  SH3  
cd10568  SWIB_like  
Amino Acid Sequences MDGPKFTKKRKITDKSIPNTVAQNPDFAEDSRMYTDLLEMERRLDWTMTRKKAEVQDALSRNVTTTRTLRIFLSHTVSDQPWQTGGIGPEGANFETGEGIPAWAFRIEGRLLESSTSRAKDKVMQRKFSTFIKRMVIELDRDPSSYPDGNIIEWPKAPGAHNPVMDGFTVRRTGDTPTNIRVVLYLDHQPEQFKVQEGLANIIGVRQDSRLGVIQAMWNYIKINQLQDKADRTMIHLDEPLKMLLQGRSDLAFAMIPAFVNKFLQPPDPILLRYTLDPGMFPPERPTAWDVEVKLEDTGMKGRMHTAVAPSKEHLAALVKLDEEISLHVQSLHNAHLKRTFLTSFAEDPAKFIQTWLESQSRDLENILGSGPSMGATLRTEELRRSEFFKLPWVQELGKLRQWAGEVIASREKTTVSDELQELELDIELRRNGAKRLAYAADGFHHFLAKKKVNEAIDSSEKLLPIDTLGEFESAYGDALTKLGRAHCKIATLQETFALQFEDTYVASLKSLLDDIREYDVQRKKLESRRLSYDAAHAKLEKLKTSKKEKERKEAEEELERAQFRFEEAEEDVRAHIHQIQESEASLLREVTAFLDSEIKYVKHWLEILEETREEWPETKSILSTPSNHTRTTSTSRSSHTRQASSLSRATSSALSRSASKRSEKPPSIDSSEEEDNTKSRSRATSLSHKRTESRGESRPPSRAPSRPGSSLGRKRADSNVTAGGKEDKEKDKDKDRSRKMSVSGWASSLGRSKKKLPDESDEKEPVMGRDERKKFSSLENLGKEDDTDAPSRGLPIVGRKHSNKSMKSMISKSPTASPKPPPPPRILKAPSQRGNKYARALYDFSGAADELSFHAGDEIAVVSEVLDEWWMGELAGRRGLFPTSYVEVIEAPSASHPRIAPQPSSPEASDFEDEDLNSRPMEHNDAGISSGPFFSVGASKRDSFAPSITSSVDGDEDRGLLRPRDSDFEDGGGLLAAAPAITRRLTTSDAGKRAPPPPPPPRRMTGSSSAIPPSSASSSSLALGLRPQQRCVWSEPECSGHDYDVSPFESAQDLDTVTPGKNGCTAFKQNPFKPQGFCNNCFQYHT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.84
3 0.85
4 0.77
5 0.69
6 0.64
7 0.59
8 0.57
9 0.47
10 0.42
11 0.34
12 0.33
13 0.33
14 0.28
15 0.28
16 0.2
17 0.23
18 0.22
19 0.22
20 0.2
21 0.18
22 0.19
23 0.17
24 0.19
25 0.2
26 0.18
27 0.19
28 0.2
29 0.22
30 0.22
31 0.2
32 0.22
33 0.28
34 0.38
35 0.44
36 0.47
37 0.47
38 0.52
39 0.59
40 0.63
41 0.59
42 0.55
43 0.56
44 0.56
45 0.58
46 0.53
47 0.45
48 0.38
49 0.35
50 0.31
51 0.26
52 0.25
53 0.29
54 0.3
55 0.31
56 0.31
57 0.32
58 0.34
59 0.33
60 0.36
61 0.29
62 0.28
63 0.31
64 0.31
65 0.31
66 0.29
67 0.26
68 0.21
69 0.21
70 0.2
71 0.19
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.17
77 0.19
78 0.18
79 0.15
80 0.13
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.16
97 0.17
98 0.18
99 0.19
100 0.2
101 0.2
102 0.25
103 0.26
104 0.25
105 0.24
106 0.26
107 0.32
108 0.41
109 0.48
110 0.52
111 0.58
112 0.61
113 0.66
114 0.67
115 0.67
116 0.67
117 0.61
118 0.58
119 0.56
120 0.52
121 0.47
122 0.48
123 0.43
124 0.36
125 0.35
126 0.34
127 0.28
128 0.28
129 0.28
130 0.25
131 0.27
132 0.25
133 0.22
134 0.23
135 0.23
136 0.23
137 0.27
138 0.27
139 0.24
140 0.23
141 0.24
142 0.2
143 0.21
144 0.22
145 0.23
146 0.29
147 0.32
148 0.32
149 0.32
150 0.32
151 0.31
152 0.29
153 0.25
154 0.18
155 0.15
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.21
161 0.26
162 0.31
163 0.33
164 0.34
165 0.36
166 0.35
167 0.34
168 0.3
169 0.25
170 0.2
171 0.18
172 0.21
173 0.21
174 0.23
175 0.24
176 0.24
177 0.24
178 0.26
179 0.24
180 0.2
181 0.19
182 0.18
183 0.2
184 0.19
185 0.21
186 0.18
187 0.17
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.16
202 0.16
203 0.18
204 0.16
205 0.14
206 0.14
207 0.16
208 0.18
209 0.17
210 0.23
211 0.25
212 0.29
213 0.32
214 0.35
215 0.38
216 0.37
217 0.38
218 0.32
219 0.3
220 0.32
221 0.3
222 0.27
223 0.26
224 0.25
225 0.23
226 0.25
227 0.22
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.12
239 0.1
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.07
247 0.09
248 0.09
249 0.11
250 0.13
251 0.16
252 0.17
253 0.19
254 0.22
255 0.22
256 0.23
257 0.21
258 0.21
259 0.19
260 0.18
261 0.19
262 0.17
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.2
267 0.19
268 0.19
269 0.2
270 0.21
271 0.21
272 0.24
273 0.25
274 0.21
275 0.23
276 0.27
277 0.23
278 0.24
279 0.25
280 0.23
281 0.21
282 0.17
283 0.15
284 0.13
285 0.15
286 0.14
287 0.13
288 0.12
289 0.14
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.19
294 0.22
295 0.24
296 0.25
297 0.24
298 0.25
299 0.24
300 0.23
301 0.18
302 0.15
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.13
319 0.15
320 0.18
321 0.18
322 0.2
323 0.23
324 0.24
325 0.24
326 0.26
327 0.23
328 0.19
329 0.21
330 0.22
331 0.19
332 0.21
333 0.24
334 0.2
335 0.21
336 0.22
337 0.2
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.14
342 0.15
343 0.18
344 0.2
345 0.18
346 0.19
347 0.24
348 0.22
349 0.21
350 0.2
351 0.16
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.1
368 0.12
369 0.15
370 0.18
371 0.18
372 0.21
373 0.25
374 0.26
375 0.26
376 0.32
377 0.32
378 0.3
379 0.32
380 0.3
381 0.26
382 0.28
383 0.33
384 0.3
385 0.29
386 0.29
387 0.26
388 0.25
389 0.25
390 0.21
391 0.16
392 0.15
393 0.12
394 0.14
395 0.19
396 0.17
397 0.17
398 0.17
399 0.16
400 0.14
401 0.17
402 0.16
403 0.13
404 0.15
405 0.15
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.12
410 0.09
411 0.08
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.09
419 0.11
420 0.15
421 0.16
422 0.15
423 0.19
424 0.2
425 0.19
426 0.19
427 0.18
428 0.15
429 0.15
430 0.15
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.14
435 0.22
436 0.26
437 0.25
438 0.27
439 0.32
440 0.31
441 0.32
442 0.31
443 0.29
444 0.27
445 0.26
446 0.26
447 0.23
448 0.21
449 0.2
450 0.17
451 0.12
452 0.08
453 0.09
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.05
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.09
471 0.12
472 0.14
473 0.17
474 0.17
475 0.19
476 0.19
477 0.22
478 0.24
479 0.21
480 0.2
481 0.17
482 0.17
483 0.15
484 0.15
485 0.12
486 0.07
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.06
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.1
504 0.11
505 0.11
506 0.18
507 0.23
508 0.25
509 0.26
510 0.28
511 0.32
512 0.39
513 0.48
514 0.46
515 0.45
516 0.5
517 0.53
518 0.51
519 0.45
520 0.44
521 0.39
522 0.35
523 0.31
524 0.24
525 0.21
526 0.23
527 0.23
528 0.2
529 0.19
530 0.23
531 0.3
532 0.4
533 0.47
534 0.54
535 0.62
536 0.65
537 0.72
538 0.74
539 0.72
540 0.69
541 0.66
542 0.58
543 0.54
544 0.49
545 0.4
546 0.36
547 0.31
548 0.24
549 0.19
550 0.16
551 0.11
552 0.1
553 0.09
554 0.08
555 0.09
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.1
561 0.1
562 0.08
563 0.09
564 0.08
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.1
569 0.1
570 0.11
571 0.09
572 0.09
573 0.08
574 0.07
575 0.07
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.1
583 0.09
584 0.1
585 0.11
586 0.11
587 0.1
588 0.13
589 0.13
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.13
594 0.14
595 0.16
596 0.15
597 0.15
598 0.14
599 0.15
600 0.15
601 0.12
602 0.12
603 0.11
604 0.1
605 0.11
606 0.1
607 0.1
608 0.1
609 0.14
610 0.14
611 0.16
612 0.21
613 0.3
614 0.32
615 0.31
616 0.32
617 0.3
618 0.33
619 0.36
620 0.35
621 0.3
622 0.31
623 0.34
624 0.39
625 0.41
626 0.44
627 0.42
628 0.39
629 0.35
630 0.38
631 0.39
632 0.37
633 0.36
634 0.29
635 0.25
636 0.23
637 0.24
638 0.21
639 0.17
640 0.15
641 0.14
642 0.14
643 0.17
644 0.19
645 0.23
646 0.25
647 0.29
648 0.34
649 0.39
650 0.48
651 0.48
652 0.5
653 0.49
654 0.49
655 0.49
656 0.43
657 0.38
658 0.33
659 0.32
660 0.29
661 0.25
662 0.21
663 0.18
664 0.19
665 0.2
666 0.15
667 0.15
668 0.16
669 0.18
670 0.22
671 0.27
672 0.35
673 0.43
674 0.52
675 0.54
676 0.54
677 0.54
678 0.52
679 0.54
680 0.5
681 0.47
682 0.46
683 0.48
684 0.53
685 0.54
686 0.56
687 0.51
688 0.49
689 0.48
690 0.47
691 0.46
692 0.47
693 0.48
694 0.45
695 0.47
696 0.47
697 0.51
698 0.54
699 0.57
700 0.53
701 0.5
702 0.5
703 0.52
704 0.49
705 0.41
706 0.36
707 0.35
708 0.31
709 0.3
710 0.28
711 0.26
712 0.23
713 0.24
714 0.26
715 0.24
716 0.28
717 0.34
718 0.39
719 0.46
720 0.54
721 0.62
722 0.68
723 0.71
724 0.74
725 0.74
726 0.74
727 0.67
728 0.63
729 0.59
730 0.53
731 0.45
732 0.37
733 0.33
734 0.28
735 0.26
736 0.27
737 0.27
738 0.26
739 0.28
740 0.34
741 0.4
742 0.48
743 0.55
744 0.54
745 0.57
746 0.61
747 0.63
748 0.64
749 0.58
750 0.5
751 0.43
752 0.39
753 0.3
754 0.27
755 0.26
756 0.24
757 0.31
758 0.37
759 0.39
760 0.41
761 0.43
762 0.39
763 0.4
764 0.46
765 0.42
766 0.46
767 0.46
768 0.45
769 0.44
770 0.42
771 0.37
772 0.28
773 0.24
774 0.18
775 0.16
776 0.15
777 0.15
778 0.15
779 0.15
780 0.14
781 0.12
782 0.11
783 0.17
784 0.24
785 0.28
786 0.34
787 0.37
788 0.43
789 0.51
790 0.59
791 0.54
792 0.52
793 0.55
794 0.55
795 0.58
796 0.55
797 0.54
798 0.5
799 0.49
800 0.45
801 0.45
802 0.45
803 0.44
804 0.45
805 0.45
806 0.5
807 0.59
808 0.66
809 0.62
810 0.64
811 0.69
812 0.67
813 0.7
814 0.63
815 0.62
816 0.64
817 0.69
818 0.7
819 0.69
820 0.68
821 0.64
822 0.67
823 0.62
824 0.58
825 0.51
826 0.45
827 0.42
828 0.41
829 0.36
830 0.33
831 0.28
832 0.23
833 0.21
834 0.17
835 0.12
836 0.1
837 0.09
838 0.06
839 0.08
840 0.08
841 0.06
842 0.07
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.06
847 0.04
848 0.04
849 0.04
850 0.04
851 0.04
852 0.04
853 0.04
854 0.04
855 0.03
856 0.04
857 0.05
858 0.05
859 0.05
860 0.07
861 0.1
862 0.12
863 0.17
864 0.16
865 0.16
866 0.17
867 0.19
868 0.16
869 0.15
870 0.18
871 0.16
872 0.16
873 0.16
874 0.16
875 0.15
876 0.15
877 0.15
878 0.1
879 0.08
880 0.1
881 0.12
882 0.12
883 0.15
884 0.14
885 0.17
886 0.24
887 0.28
888 0.28
889 0.3
890 0.36
891 0.36
892 0.4
893 0.37
894 0.32
895 0.31
896 0.32
897 0.29
898 0.23
899 0.22
900 0.2
901 0.19
902 0.19
903 0.2
904 0.16
905 0.15
906 0.15
907 0.16
908 0.17
909 0.23
910 0.22
911 0.2
912 0.2
913 0.2
914 0.2
915 0.2
916 0.18
917 0.12
918 0.12
919 0.1
920 0.09
921 0.09
922 0.09
923 0.12
924 0.14
925 0.17
926 0.21
927 0.22
928 0.23
929 0.26
930 0.27
931 0.24
932 0.23
933 0.23
934 0.21
935 0.22
936 0.21
937 0.2
938 0.18
939 0.17
940 0.17
941 0.14
942 0.13
943 0.12
944 0.12
945 0.11
946 0.14
947 0.16
948 0.17
949 0.18
950 0.2
951 0.22
952 0.27
953 0.3
954 0.31
955 0.29
956 0.28
957 0.27
958 0.23
959 0.21
960 0.15
961 0.12
962 0.07
963 0.06
964 0.04
965 0.03
966 0.03
967 0.04
968 0.06
969 0.06
970 0.07
971 0.09
972 0.13
973 0.16
974 0.19
975 0.28
976 0.35
977 0.39
978 0.41
979 0.44
980 0.46
981 0.49
982 0.52
983 0.51
984 0.53
985 0.59
986 0.67
987 0.7
988 0.71
989 0.71
990 0.72
991 0.69
992 0.66
993 0.63
994 0.59
995 0.55
996 0.53
997 0.49
998 0.42
999 0.37
1000 0.3
1001 0.26
1002 0.22
1003 0.2
1004 0.18
1005 0.18
1006 0.19
1007 0.19
1008 0.2
1009 0.16
1010 0.14
1011 0.17
1012 0.22
1013 0.29
1014 0.3
1015 0.32
1016 0.35
1017 0.39
1018 0.42
1019 0.44
1020 0.45
1021 0.41
1022 0.45
1023 0.45
1024 0.45
1025 0.42
1026 0.43
1027 0.39
1028 0.32
1029 0.29
1030 0.25
1031 0.24
1032 0.23
1033 0.23
1034 0.2
1035 0.18
1036 0.18
1037 0.18
1038 0.17
1039 0.16
1040 0.13
1041 0.12
1042 0.12
1043 0.14
1044 0.14
1045 0.13
1046 0.16
1047 0.15
1048 0.15
1049 0.19
1050 0.21
1051 0.23
1052 0.29
1053 0.37
1054 0.42
1055 0.52
1056 0.6
1057 0.6
1058 0.69
1059 0.72
1060 0.69
1061 0.64
1062 0.64
1063 0.65
1064 0.64
1065 0.63
1066 0.62
1067 0.62