FuNGI

A0A550C0A4

Protein Details

Accession

A0A550C0A4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
327-355	IRPQTRPQIKRIKRAQRRRGQREPTSKEI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
327-349	IRPQTRPQIKRIKRAQRRRGQRE

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 6.5, cyto_mito 6.5, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding

Amino Acid Sequences

CKCLRETHDVKSVREALNLVNDILEYQEHIAEQGCQCVRCHAWQRRGCPHPHACAVEAKTKLLDKLPSKWDPRVPNRGSRKLTDAETEANESATQEGGRLIFDPELQEEDTVSEGMRIFDKAMNQQMPPLQDGHMDQPERTYTVVYIAESEIQALEINPSARSEIRHRGAGWWRLGDTTDQRHHRVKPALAPRNAALLTAALDTVRAVGDDTNLEIVVLSKTIVEAVTRRLRQNEDKGWRDVPNKNLMMTLVARMRSRPARTAWRVGNKNEAGMVEARTLAEEAVRMPQPTTRSVLVNRREVRGMPLHKITQKSAYQQVRPIPKEAIRPQTRPQIKRIKRAQRRRGQREPTSKEIWKAISATEFRKNVAEFMYKTAHNANKCGKFWSHLDGYQERTYCVECSTATNKVVETIDHIMLRCKAPARKRLWKAAEDICEERGIKWEHLSMGVILSSGLRRIERGDKPCKGDMRLYRILMSECTYMVWLARNERVIKFEGRREDCPGGEVAVKRLKSILRRRKQIEI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.42
3	0.35
4	0.38
5	0.38
6	0.29
7	0.22
8	0.2
9	0.18
10	0.18
11	0.15
12	0.09
13	0.09
14	0.1
15	0.09
16	0.1
17	0.11
18	0.14
19	0.15
20	0.21
21	0.22
22	0.23
23	0.23
24	0.29
25	0.31
26	0.35
27	0.45
28	0.47
29	0.55
30	0.6
31	0.69
32	0.73
33	0.78
34	0.74
35	0.74
36	0.71
37	0.69
38	0.69
39	0.63
40	0.55
41	0.55
42	0.54
43	0.51
44	0.44
45	0.38
46	0.34
47	0.34
48	0.34
49	0.31
50	0.35
51	0.32
52	0.38
53	0.45
54	0.51
55	0.54
56	0.58
57	0.61
58	0.63
59	0.68
60	0.71
61	0.68
62	0.69
63	0.74
64	0.78
65	0.75
66	0.68
67	0.65
68	0.58
69	0.56
70	0.5
71	0.43
72	0.37
73	0.34
74	0.34
75	0.29
76	0.25
77	0.22
78	0.19
79	0.16
80	0.13
81	0.11
82	0.07
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.09
87	0.1
88	0.09
89	0.1
90	0.11
91	0.11
92	0.14
93	0.14
94	0.13
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.11
99	0.09
100	0.08
101	0.08
102	0.09
103	0.1
104	0.09
105	0.1
106	0.12
107	0.15
108	0.18
109	0.24
110	0.26
111	0.25
112	0.27
113	0.29
114	0.28
115	0.27
116	0.24
117	0.17
118	0.17
119	0.19
120	0.21
121	0.24
122	0.23
123	0.22
124	0.23
125	0.23
126	0.22
127	0.21
128	0.17
129	0.11
130	0.13
131	0.14
132	0.12
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.11
137	0.11
138	0.08
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.06
143	0.07
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.1
148	0.11
149	0.13
150	0.18
151	0.26
152	0.28
153	0.31
154	0.31
155	0.36
156	0.43
157	0.46
158	0.43
159	0.35
160	0.33
161	0.3
162	0.3
163	0.27
164	0.24
165	0.25
166	0.3
167	0.32
168	0.36
169	0.41
170	0.43
171	0.48
172	0.49
173	0.44
174	0.46
175	0.52
176	0.57
177	0.53
178	0.53
179	0.46
180	0.44
181	0.41
182	0.32
183	0.22
184	0.13
185	0.12
186	0.1
187	0.1
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.05
211	0.04
212	0.05
213	0.11
214	0.18
215	0.21
216	0.22
217	0.25
218	0.29
219	0.35
220	0.42
221	0.45
222	0.46
223	0.47
224	0.49
225	0.49
226	0.49
227	0.49
228	0.45
229	0.4
230	0.4
231	0.37
232	0.34
233	0.32
234	0.27
235	0.23
236	0.19
237	0.18
238	0.12
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.17
243	0.21
244	0.22
245	0.23
246	0.24
247	0.32
248	0.36
249	0.42
250	0.44
251	0.48
252	0.5
253	0.48
254	0.52
255	0.42
256	0.39
257	0.33
258	0.28
259	0.2
260	0.16
261	0.16
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.06
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.07
272	0.08
273	0.09
274	0.09
275	0.11
276	0.13
277	0.15
278	0.17
279	0.15
280	0.17
281	0.21
282	0.29
283	0.32
284	0.39
285	0.39
286	0.38
287	0.38
288	0.36
289	0.35
290	0.35
291	0.32
292	0.27
293	0.29
294	0.31
295	0.34
296	0.35
297	0.33
298	0.32
299	0.32
300	0.32
301	0.37
302	0.39
303	0.38
304	0.4
305	0.45
306	0.47
307	0.46
308	0.44
309	0.39
310	0.37
311	0.44
312	0.45
313	0.49
314	0.46
315	0.49
316	0.51
317	0.57
318	0.62
319	0.56
320	0.59
321	0.6
322	0.61
323	0.67
324	0.73
325	0.74
326	0.76
327	0.84
328	0.86
329	0.85
330	0.89
331	0.89
332	0.89
333	0.88
334	0.87
335	0.87
336	0.83
337	0.8
338	0.75
339	0.68
340	0.6
341	0.54
342	0.45
343	0.36
344	0.3
345	0.24
346	0.23
347	0.24
348	0.25
349	0.29
350	0.28
351	0.27
352	0.3
353	0.29
354	0.24
355	0.25
356	0.26
357	0.2
358	0.23
359	0.26
360	0.23
361	0.24
362	0.3
363	0.31
364	0.28
365	0.33
366	0.37
367	0.4
368	0.41
369	0.43
370	0.38
371	0.36
372	0.37
373	0.38
374	0.34
375	0.29
376	0.34
377	0.33
378	0.38
379	0.39
380	0.37
381	0.31
382	0.28
383	0.27
384	0.22
385	0.2
386	0.16
387	0.12
388	0.17
389	0.2
390	0.23
391	0.23
392	0.23
393	0.22
394	0.23
395	0.23
396	0.18
397	0.19
398	0.18
399	0.2
400	0.2
401	0.21
402	0.21
403	0.23
404	0.24
405	0.22
406	0.24
407	0.29
408	0.35
409	0.45
410	0.51
411	0.59
412	0.64
413	0.72
414	0.73
415	0.7
416	0.68
417	0.66
418	0.63
419	0.58
420	0.53
421	0.44
422	0.4
423	0.37
424	0.31
425	0.31
426	0.28
427	0.24
428	0.24
429	0.26
430	0.23
431	0.24
432	0.25
433	0.18
434	0.15
435	0.14
436	0.11
437	0.09
438	0.09
439	0.08
440	0.09
441	0.11
442	0.1
443	0.11
444	0.16
445	0.25
446	0.32
447	0.4
448	0.48
449	0.53
450	0.59
451	0.65
452	0.66
453	0.61
454	0.61
455	0.6
456	0.6
457	0.6
458	0.56
459	0.51
460	0.48
461	0.46
462	0.39
463	0.35
464	0.27
465	0.2
466	0.19
467	0.17
468	0.15
469	0.14
470	0.17
471	0.17
472	0.21
473	0.25
474	0.3
475	0.34
476	0.35
477	0.37
478	0.36
479	0.41
480	0.42
481	0.46
482	0.51
483	0.52
484	0.54
485	0.58
486	0.59
487	0.51
488	0.47
489	0.41
490	0.33
491	0.32
492	0.3
493	0.29
494	0.32
495	0.31
496	0.3
497	0.33
498	0.36
499	0.41
500	0.51
501	0.55
502	0.58
503	0.69

A0A550C0A4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer