Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CA97

Protein Details
Accession A0A550CA97    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24LDPPRSSRKGKEREVPAPRDGBasic
963-989LSSRRQPRTTASRPRARRTQTARQPLKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-71GPIRKDRTDRPERPAAPARPEKSPKL
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12, cyto 8, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF10373  EST1_DNA_bind  
PF13638  PIN_4  
CDD cd09880  PIN_Smg5-6-like  
Amino Acid Sequences MSALDPPRSSRKGKEREVPAPRDGQKEIQVTDIDKRLLAFQRRTAGPIRKDRTDRPERPAAPARPEKSPKLPSSSAQKASSAASPRRQHQAPSVVVRPPEADPDDFSRRLKISASPSPGPGRVSAARNDASKLYNPDRDPIPIRRTAEPDTLSDTSSSYVPRGVQHNKHGHHRDGGARQLFDHKKDNPILFSVLARPPGGKAPTPQSSMDHFSASSASSYAPSISSSFTLSSTTDGSSNSSALFDGKSGHHEESGNNQFGAQLKRLYRNITDLEAKVKQDELDDAAESNSRVRLKGKESASSEDAEHEKWRRQITDHKRLIDRMHDMLQMTLSPSVPASLRNIPKKYNLITRLWMFGFHRLLENLRAASLRSPVAMEHLQDFILFAYTYYTGLYEETTVDAFRSEWLEALGDLARYRMAVAAMVTRNTGGTPAALTTAALTEAAGTSPNGTLAPPAAPEAKSVSDAPAARIDDSPSPSIGVAAARALEIEPEKERWRTIARDWYASGLADQPGNGKLHHHLGLLSREAEGEDLRSMYHFIKSLNALHPFATTRESILQTWSPQAQVRRAQPDARVPDLFVLLHGMLFTNIQLDDFQPTLARLLERLSIDGAEEREWIMMAVSNVGALLEYGKATGILRRVGAVRTREATTTGVSAAAVRLAKRTAAEEDKMEVDGDQPSPILAEPETGVPVSLTLAMQLTFSMLSVVLRQPIRKPTIFARKTLNPYLSIILTFLATMVKNEKALRVLERHVPWTDLADFFQTVPRSVMEAQGLLSREESGEWRWSTLTAGCAPPLAEDWCLRGMEWVARKVWERGYWRSGEDRRPEMEILDAEEAEAAMEDGRIEDDEEAAVHQKADGQRWTRVVRSAVEMSNVIDGLTWVRGTREWRVEGALAAKSAAWQEEERAEREAEARRLAGSRWTDDSMEVDEASDDLSEETDDEDEDESDEVKALKTRRHQLEGMLSSRRQPRTTASRPRARRTQTARQPLKVVAGHSILVVDTNILLSSLDAFCKLVESHRWTIVVPLPVIMELDGMVSGGSELASTASAAVEYITAGVRSHSASLKVQTSRGNYLATLSIRTEEIDFAGAERSMDDLILKAALWQQAHWADRSAFLQGGAIEDARAEKVVLLTLDRNLRMKSRSRELPAASERDLAGILAAAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.74
3 0.79
4 0.85
5 0.81
6 0.75
7 0.74
8 0.71
9 0.67
10 0.61
11 0.56
12 0.54
13 0.52
14 0.48
15 0.43
16 0.4
17 0.37
18 0.4
19 0.39
20 0.32
21 0.28
22 0.28
23 0.3
24 0.36
25 0.42
26 0.41
27 0.42
28 0.5
29 0.5
30 0.53
31 0.56
32 0.57
33 0.57
34 0.63
35 0.63
36 0.64
37 0.69
38 0.74
39 0.76
40 0.78
41 0.76
42 0.73
43 0.77
44 0.7
45 0.72
46 0.73
47 0.69
48 0.68
49 0.7
50 0.65
51 0.65
52 0.69
53 0.67
54 0.67
55 0.7
56 0.65
57 0.64
58 0.64
59 0.6
60 0.63
61 0.66
62 0.63
63 0.56
64 0.52
65 0.45
66 0.44
67 0.44
68 0.43
69 0.41
70 0.43
71 0.47
72 0.5
73 0.58
74 0.57
75 0.55
76 0.55
77 0.57
78 0.54
79 0.56
80 0.56
81 0.52
82 0.5
83 0.48
84 0.42
85 0.34
86 0.34
87 0.3
88 0.27
89 0.26
90 0.33
91 0.38
92 0.39
93 0.38
94 0.37
95 0.35
96 0.35
97 0.33
98 0.33
99 0.34
100 0.39
101 0.46
102 0.43
103 0.46
104 0.49
105 0.49
106 0.45
107 0.38
108 0.35
109 0.33
110 0.35
111 0.34
112 0.35
113 0.36
114 0.36
115 0.37
116 0.34
117 0.31
118 0.32
119 0.36
120 0.37
121 0.41
122 0.41
123 0.43
124 0.43
125 0.45
126 0.46
127 0.47
128 0.47
129 0.46
130 0.49
131 0.49
132 0.52
133 0.51
134 0.52
135 0.46
136 0.42
137 0.42
138 0.39
139 0.35
140 0.3
141 0.26
142 0.2
143 0.19
144 0.18
145 0.12
146 0.14
147 0.14
148 0.18
149 0.26
150 0.33
151 0.38
152 0.47
153 0.56
154 0.58
155 0.67
156 0.69
157 0.65
158 0.61
159 0.59
160 0.57
161 0.53
162 0.57
163 0.52
164 0.45
165 0.43
166 0.48
167 0.47
168 0.44
169 0.46
170 0.4
171 0.43
172 0.49
173 0.5
174 0.42
175 0.41
176 0.39
177 0.32
178 0.31
179 0.28
180 0.25
181 0.25
182 0.23
183 0.21
184 0.2
185 0.25
186 0.27
187 0.24
188 0.25
189 0.31
190 0.36
191 0.39
192 0.39
193 0.36
194 0.37
195 0.41
196 0.38
197 0.31
198 0.26
199 0.23
200 0.22
201 0.19
202 0.15
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.08
232 0.1
233 0.1
234 0.14
235 0.17
236 0.18
237 0.19
238 0.2
239 0.21
240 0.27
241 0.33
242 0.31
243 0.27
244 0.26
245 0.26
246 0.29
247 0.31
248 0.25
249 0.24
250 0.25
251 0.32
252 0.35
253 0.37
254 0.35
255 0.36
256 0.36
257 0.35
258 0.36
259 0.3
260 0.33
261 0.32
262 0.31
263 0.27
264 0.25
265 0.22
266 0.18
267 0.18
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.14
277 0.13
278 0.14
279 0.16
280 0.21
281 0.25
282 0.32
283 0.34
284 0.37
285 0.4
286 0.44
287 0.43
288 0.39
289 0.35
290 0.31
291 0.29
292 0.23
293 0.25
294 0.23
295 0.26
296 0.3
297 0.33
298 0.32
299 0.34
300 0.43
301 0.49
302 0.57
303 0.58
304 0.59
305 0.58
306 0.59
307 0.58
308 0.54
309 0.47
310 0.4
311 0.36
312 0.32
313 0.29
314 0.27
315 0.24
316 0.18
317 0.15
318 0.13
319 0.1
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.12
326 0.19
327 0.26
328 0.34
329 0.37
330 0.38
331 0.43
332 0.47
333 0.47
334 0.48
335 0.46
336 0.42
337 0.44
338 0.43
339 0.41
340 0.36
341 0.35
342 0.27
343 0.28
344 0.26
345 0.22
346 0.22
347 0.19
348 0.2
349 0.2
350 0.21
351 0.15
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.12
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.05
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.1
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.12
447 0.11
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.15
452 0.15
453 0.16
454 0.17
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.17
459 0.17
460 0.19
461 0.18
462 0.14
463 0.14
464 0.13
465 0.12
466 0.11
467 0.08
468 0.06
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.05
473 0.04
474 0.05
475 0.05
476 0.07
477 0.08
478 0.11
479 0.13
480 0.14
481 0.14
482 0.16
483 0.2
484 0.21
485 0.24
486 0.31
487 0.3
488 0.32
489 0.32
490 0.31
491 0.27
492 0.24
493 0.2
494 0.12
495 0.11
496 0.09
497 0.08
498 0.08
499 0.1
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.14
505 0.15
506 0.14
507 0.13
508 0.15
509 0.17
510 0.17
511 0.16
512 0.13
513 0.12
514 0.11
515 0.11
516 0.08
517 0.07
518 0.06
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.07
523 0.08
524 0.09
525 0.09
526 0.08
527 0.1
528 0.12
529 0.15
530 0.17
531 0.19
532 0.19
533 0.18
534 0.19
535 0.17
536 0.17
537 0.16
538 0.12
539 0.1
540 0.12
541 0.14
542 0.13
543 0.15
544 0.15
545 0.14
546 0.15
547 0.15
548 0.13
549 0.14
550 0.16
551 0.19
552 0.23
553 0.26
554 0.29
555 0.31
556 0.32
557 0.32
558 0.36
559 0.35
560 0.33
561 0.29
562 0.24
563 0.22
564 0.21
565 0.18
566 0.11
567 0.09
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.05
589 0.06
590 0.09
591 0.09
592 0.1
593 0.09
594 0.08
595 0.09
596 0.1
597 0.09
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.03
614 0.03
615 0.03
616 0.03
617 0.03
618 0.03
619 0.04
620 0.04
621 0.06
622 0.08
623 0.09
624 0.09
625 0.1
626 0.11
627 0.12
628 0.17
629 0.17
630 0.17
631 0.19
632 0.2
633 0.19
634 0.19
635 0.19
636 0.15
637 0.13
638 0.11
639 0.09
640 0.08
641 0.08
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.08
647 0.08
648 0.09
649 0.09
650 0.11
651 0.13
652 0.15
653 0.16
654 0.16
655 0.17
656 0.17
657 0.17
658 0.15
659 0.11
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.08
664 0.07
665 0.06
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.06
673 0.07
674 0.06
675 0.06
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.04
681 0.04
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.05
693 0.06
694 0.1
695 0.11
696 0.13
697 0.16
698 0.22
699 0.27
700 0.26
701 0.28
702 0.33
703 0.43
704 0.43
705 0.43
706 0.43
707 0.44
708 0.5
709 0.52
710 0.45
711 0.35
712 0.35
713 0.34
714 0.28
715 0.21
716 0.15
717 0.11
718 0.09
719 0.08
720 0.06
721 0.06
722 0.05
723 0.06
724 0.08
725 0.09
726 0.11
727 0.12
728 0.13
729 0.14
730 0.15
731 0.18
732 0.19
733 0.21
734 0.26
735 0.27
736 0.29
737 0.27
738 0.27
739 0.24
740 0.23
741 0.22
742 0.16
743 0.15
744 0.13
745 0.13
746 0.12
747 0.16
748 0.14
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.14
754 0.15
755 0.12
756 0.12
757 0.11
758 0.13
759 0.14
760 0.12
761 0.12
762 0.1
763 0.09
764 0.1
765 0.11
766 0.1
767 0.15
768 0.15
769 0.15
770 0.15
771 0.15
772 0.16
773 0.16
774 0.16
775 0.13
776 0.14
777 0.13
778 0.13
779 0.13
780 0.12
781 0.12
782 0.11
783 0.1
784 0.1
785 0.12
786 0.13
787 0.14
788 0.13
789 0.12
790 0.12
791 0.16
792 0.19
793 0.2
794 0.19
795 0.21
796 0.23
797 0.25
798 0.27
799 0.28
800 0.3
801 0.33
802 0.37
803 0.37
804 0.37
805 0.43
806 0.45
807 0.46
808 0.47
809 0.46
810 0.42
811 0.43
812 0.42
813 0.33
814 0.3
815 0.23
816 0.2
817 0.16
818 0.14
819 0.11
820 0.11
821 0.1
822 0.07
823 0.07
824 0.04
825 0.03
826 0.03
827 0.03
828 0.03
829 0.04
830 0.04
831 0.05
832 0.05
833 0.05
834 0.05
835 0.06
836 0.06
837 0.08
838 0.08
839 0.07
840 0.07
841 0.11
842 0.13
843 0.17
844 0.23
845 0.25
846 0.28
847 0.34
848 0.37
849 0.35
850 0.37
851 0.35
852 0.31
853 0.32
854 0.32
855 0.28
856 0.27
857 0.25
858 0.21
859 0.2
860 0.18
861 0.12
862 0.08
863 0.08
864 0.07
865 0.07
866 0.07
867 0.06
868 0.07
869 0.1
870 0.13
871 0.2
872 0.25
873 0.26
874 0.27
875 0.28
876 0.28
877 0.27
878 0.27
879 0.21
880 0.15
881 0.13
882 0.12
883 0.11
884 0.11
885 0.11
886 0.1
887 0.09
888 0.11
889 0.17
890 0.2
891 0.21
892 0.22
893 0.22
894 0.2
895 0.24
896 0.29
897 0.25
898 0.25
899 0.23
900 0.23
901 0.23
902 0.23
903 0.26
904 0.23
905 0.23
906 0.25
907 0.27
908 0.26
909 0.25
910 0.27
911 0.22
912 0.2
913 0.17
914 0.13
915 0.11
916 0.1
917 0.1
918 0.08
919 0.06
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.06
925 0.06
926 0.06
927 0.07
928 0.07
929 0.07
930 0.08
931 0.08
932 0.08
933 0.08
934 0.09
935 0.08
936 0.08
937 0.13
938 0.15
939 0.21
940 0.28
941 0.38
942 0.44
943 0.5
944 0.5
945 0.51
946 0.58
947 0.57
948 0.53
949 0.49
950 0.43
951 0.44
952 0.5
953 0.5
954 0.41
955 0.38
956 0.42
957 0.47
958 0.56
959 0.61
960 0.63
961 0.69
962 0.75
963 0.81
964 0.83
965 0.78
966 0.78
967 0.76
968 0.77
969 0.78
970 0.81
971 0.8
972 0.74
973 0.71
974 0.63
975 0.6
976 0.51
977 0.42
978 0.35
979 0.3
980 0.26
981 0.23
982 0.21
983 0.14
984 0.12
985 0.11
986 0.07
987 0.05
988 0.05
989 0.05
990 0.05
991 0.05
992 0.04
993 0.07
994 0.08
995 0.09
996 0.09
997 0.09
998 0.09
999 0.11
1000 0.12
1001 0.13
1002 0.2
1003 0.27
1004 0.31
1005 0.34
1006 0.35
1007 0.33
1008 0.37
1009 0.38
1010 0.34
1011 0.27
1012 0.23
1013 0.21
1014 0.2
1015 0.2
1016 0.16
1017 0.11
1018 0.06
1019 0.06
1020 0.05
1021 0.05
1022 0.04
1023 0.04
1024 0.04
1025 0.04
1026 0.04
1027 0.03
1028 0.03
1029 0.04
1030 0.04
1031 0.04
1032 0.05
1033 0.05
1034 0.05
1035 0.05
1036 0.05
1037 0.04
1038 0.04
1039 0.05
1040 0.06
1041 0.06
1042 0.06
1043 0.07
1044 0.08
1045 0.1
1046 0.13
1047 0.14
1048 0.17
1049 0.2
1050 0.25
1051 0.31
1052 0.32
1053 0.34
1054 0.37
1055 0.4
1056 0.42
1057 0.4
1058 0.37
1059 0.3
1060 0.3
1061 0.32
1062 0.27
1063 0.25
1064 0.2
1065 0.2
1066 0.19
1067 0.2
1068 0.18
1069 0.14
1070 0.14
1071 0.13
1072 0.12
1073 0.11
1074 0.13
1075 0.12
1076 0.11
1077 0.1
1078 0.1
1079 0.09
1080 0.09
1081 0.09
1082 0.07
1083 0.08
1084 0.08
1085 0.08
1086 0.08
1087 0.12
1088 0.16
1089 0.16
1090 0.16
1091 0.22
1092 0.27
1093 0.29
1094 0.29
1095 0.29
1096 0.26
1097 0.29
1098 0.3
1099 0.26
1100 0.2
1101 0.18
1102 0.19
1103 0.15
1104 0.16
1105 0.15
1106 0.14
1107 0.11
1108 0.11
1109 0.12
1110 0.11
1111 0.11
1112 0.09
1113 0.09
1114 0.09
1115 0.12
1116 0.12
1117 0.14
1118 0.15
1119 0.2
1120 0.26
1121 0.28
1122 0.3
1123 0.3
1124 0.35
1125 0.38
1126 0.45
1127 0.49
1128 0.52
1129 0.59
1130 0.62
1131 0.68
1132 0.66
1133 0.7
1134 0.68
1135 0.65
1136 0.58
1137 0.51
1138 0.44
1139 0.37
1140 0.34
1141 0.24
1142 0.16