Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C9C1

Protein Details
Accession A0A550C9C1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-104ASGIGKRKKGGRRGPRTGPPLSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-99IGKRKKGGRRGPRT
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10, cyto 7, pero 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039340  Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PF13174  TPR_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MFYEEDLSDGLTDDDEEVGAYDESDSEDSSDDALDEPENDQDFDRLVQNIRQNAKGESSGIAQNWDLQLEAQNAEFRDDLKAASGIGKRKKGGRRGPRTGPPLSHQVRTLLGDGNQAYVDADLPLAIRLMSEAIRIEPRAAPAWTVLAQCYADLGQPTPALHLRIMAAHLRRDPDEWARLAVQSREAGLVQQALYCYAKLAQAEPENVDALWDRAALARSCGDLRAARASLVALLRRVPHDLSVLAELRPVLIELGDLGTCAGLYDGALEHYMHAVPAGVGSPFSMMEILVLADLHNALGAHAREPSAHERAVHAIRKGMRWLQGRADQSYWDAVPDDREFDPPPPDGPTRAVGEGEMAPGYFSLDVNTRQRLAVARIRMGDVDEGKIHATIVLSEDPTDYAVLFGEIADAYFDRELWAEARPIYEVLGGDVATSSIQVLMQAAACYHMLGELQEAAEVYESVIQADPTLNDAKMKLANIYEATGEVHKAYDLVCQVIDSRKRRPRDPGASVEGSAEPASASLFQEQGVTTSTRKGKQRTGLTRAQLLELEVQREKEAAQGWNRVRDLWGAAVAAAAKQDTGAADNVDEGAASRDAALREWMLEAEKLIEMFRETRRLFTTDRHSDFKGLFRMGKRRKRTAQETEAEEDRMASRLQLDLEGDSVRKVKGGAKNTNEKVEHFRTIHFDDWLRMTMQYCFFVTREGDYALAEEILRHMMLSNAYVALERQNTLRIALATCAIAAKRYDTVVEQTRKIIYVHQFNTEPIRLLLAALSSGMRPTDAFIRSTLQKFFFREMKLRDAAVNAPDQVRWVPNRRWTYAGAAGKGAEEDEEDKDADGKDGAGVKDRPALPKVYNPVNMIAYGMTCVAAKSYQSALVYLLHAYDYSPDDPVLCLLLAIASFGRAMQRQADNRHHLIVQGLAFLSKYRAARRGVRGSSGEADYNFGRAFQQLGLFSQAVTHYERVLKRAEEGENVVFVREAAYNLSLIYSVTGARPLAEALYRKWLVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.07
9 0.07
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.14
25 0.15
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.16
30 0.17
31 0.19
32 0.17
33 0.19
34 0.24
35 0.29
36 0.36
37 0.39
38 0.42
39 0.41
40 0.41
41 0.42
42 0.38
43 0.33
44 0.27
45 0.27
46 0.26
47 0.24
48 0.24
49 0.2
50 0.22
51 0.21
52 0.19
53 0.16
54 0.13
55 0.17
56 0.17
57 0.18
58 0.15
59 0.18
60 0.18
61 0.2
62 0.2
63 0.17
64 0.18
65 0.18
66 0.17
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.2
71 0.24
72 0.28
73 0.36
74 0.41
75 0.43
76 0.51
77 0.59
78 0.63
79 0.69
80 0.72
81 0.75
82 0.78
83 0.84
84 0.85
85 0.83
86 0.79
87 0.72
88 0.66
89 0.66
90 0.6
91 0.54
92 0.46
93 0.42
94 0.38
95 0.36
96 0.34
97 0.27
98 0.24
99 0.26
100 0.25
101 0.23
102 0.2
103 0.18
104 0.16
105 0.12
106 0.12
107 0.07
108 0.07
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.11
121 0.14
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.2
126 0.22
127 0.21
128 0.2
129 0.18
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.12
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.16
146 0.17
147 0.18
148 0.16
149 0.17
150 0.15
151 0.16
152 0.18
153 0.2
154 0.21
155 0.23
156 0.26
157 0.28
158 0.29
159 0.29
160 0.31
161 0.32
162 0.34
163 0.31
164 0.3
165 0.29
166 0.29
167 0.31
168 0.27
169 0.24
170 0.2
171 0.2
172 0.18
173 0.17
174 0.15
175 0.14
176 0.14
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.17
189 0.2
190 0.22
191 0.22
192 0.23
193 0.21
194 0.2
195 0.19
196 0.14
197 0.11
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.09
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.14
211 0.17
212 0.2
213 0.2
214 0.18
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.13
221 0.15
222 0.16
223 0.17
224 0.2
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.18
231 0.18
232 0.15
233 0.15
234 0.14
235 0.12
236 0.12
237 0.1
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.14
293 0.19
294 0.19
295 0.19
296 0.19
297 0.2
298 0.25
299 0.31
300 0.31
301 0.26
302 0.28
303 0.29
304 0.3
305 0.33
306 0.31
307 0.32
308 0.33
309 0.35
310 0.36
311 0.4
312 0.41
313 0.4
314 0.37
315 0.3
316 0.27
317 0.26
318 0.21
319 0.15
320 0.13
321 0.1
322 0.13
323 0.13
324 0.15
325 0.13
326 0.16
327 0.17
328 0.18
329 0.21
330 0.18
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.2
335 0.21
336 0.21
337 0.21
338 0.2
339 0.19
340 0.15
341 0.16
342 0.14
343 0.12
344 0.1
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.07
353 0.11
354 0.14
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.17
359 0.18
360 0.21
361 0.23
362 0.23
363 0.23
364 0.23
365 0.24
366 0.23
367 0.22
368 0.19
369 0.15
370 0.13
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.08
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.08
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.08
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.07
483 0.08
484 0.13
485 0.19
486 0.2
487 0.29
488 0.35
489 0.39
490 0.42
491 0.49
492 0.54
493 0.56
494 0.59
495 0.55
496 0.54
497 0.52
498 0.49
499 0.42
500 0.32
501 0.24
502 0.18
503 0.12
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.13
519 0.17
520 0.21
521 0.26
522 0.3
523 0.34
524 0.4
525 0.49
526 0.52
527 0.55
528 0.56
529 0.53
530 0.53
531 0.48
532 0.41
533 0.31
534 0.24
535 0.22
536 0.17
537 0.18
538 0.14
539 0.14
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.11
544 0.13
545 0.14
546 0.16
547 0.23
548 0.25
549 0.3
550 0.3
551 0.28
552 0.26
553 0.23
554 0.21
555 0.14
556 0.13
557 0.08
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.06
562 0.05
563 0.04
564 0.03
565 0.03
566 0.04
567 0.03
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.04
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.07
582 0.08
583 0.08
584 0.09
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.07
590 0.07
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.09
599 0.11
600 0.18
601 0.18
602 0.2
603 0.23
604 0.26
605 0.26
606 0.29
607 0.37
608 0.38
609 0.42
610 0.43
611 0.41
612 0.4
613 0.4
614 0.39
615 0.34
616 0.27
617 0.27
618 0.27
619 0.37
620 0.45
621 0.53
622 0.55
623 0.6
624 0.67
625 0.71
626 0.76
627 0.76
628 0.74
629 0.71
630 0.68
631 0.63
632 0.56
633 0.48
634 0.39
635 0.3
636 0.21
637 0.17
638 0.12
639 0.08
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.08
646 0.09
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.1
651 0.09
652 0.09
653 0.1
654 0.15
655 0.21
656 0.29
657 0.36
658 0.41
659 0.51
660 0.52
661 0.58
662 0.53
663 0.49
664 0.48
665 0.44
666 0.43
667 0.35
668 0.34
669 0.33
670 0.36
671 0.35
672 0.3
673 0.26
674 0.22
675 0.23
676 0.23
677 0.18
678 0.15
679 0.15
680 0.16
681 0.17
682 0.17
683 0.15
684 0.15
685 0.15
686 0.16
687 0.16
688 0.14
689 0.14
690 0.14
691 0.13
692 0.12
693 0.12
694 0.1
695 0.1
696 0.08
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.05
702 0.05
703 0.06
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.07
711 0.09
712 0.1
713 0.1
714 0.1
715 0.13
716 0.13
717 0.14
718 0.15
719 0.13
720 0.13
721 0.13
722 0.13
723 0.1
724 0.1
725 0.1
726 0.09
727 0.09
728 0.09
729 0.1
730 0.1
731 0.11
732 0.12
733 0.12
734 0.17
735 0.25
736 0.29
737 0.28
738 0.29
739 0.3
740 0.3
741 0.29
742 0.3
743 0.27
744 0.32
745 0.33
746 0.35
747 0.35
748 0.35
749 0.4
750 0.35
751 0.3
752 0.21
753 0.2
754 0.16
755 0.15
756 0.14
757 0.09
758 0.08
759 0.07
760 0.07
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.06
766 0.07
767 0.13
768 0.14
769 0.15
770 0.16
771 0.2
772 0.25
773 0.28
774 0.3
775 0.28
776 0.31
777 0.33
778 0.37
779 0.39
780 0.38
781 0.42
782 0.43
783 0.45
784 0.43
785 0.41
786 0.37
787 0.33
788 0.32
789 0.27
790 0.25
791 0.2
792 0.19
793 0.17
794 0.18
795 0.17
796 0.19
797 0.22
798 0.28
799 0.32
800 0.41
801 0.47
802 0.48
803 0.5
804 0.47
805 0.48
806 0.49
807 0.47
808 0.39
809 0.34
810 0.31
811 0.28
812 0.26
813 0.2
814 0.11
815 0.08
816 0.09
817 0.1
818 0.11
819 0.11
820 0.12
821 0.13
822 0.13
823 0.13
824 0.11
825 0.1
826 0.11
827 0.15
828 0.15
829 0.19
830 0.2
831 0.21
832 0.27
833 0.3
834 0.31
835 0.29
836 0.33
837 0.29
838 0.35
839 0.4
840 0.4
841 0.42
842 0.4
843 0.41
844 0.38
845 0.36
846 0.29
847 0.23
848 0.16
849 0.12
850 0.11
851 0.08
852 0.07
853 0.07
854 0.07
855 0.08
856 0.08
857 0.1
858 0.11
859 0.14
860 0.15
861 0.15
862 0.15
863 0.16
864 0.17
865 0.14
866 0.13
867 0.1
868 0.09
869 0.09
870 0.1
871 0.12
872 0.12
873 0.13
874 0.13
875 0.13
876 0.14
877 0.14
878 0.13
879 0.09
880 0.08
881 0.07
882 0.07
883 0.06
884 0.07
885 0.06
886 0.05
887 0.05
888 0.06
889 0.09
890 0.1
891 0.12
892 0.17
893 0.25
894 0.32
895 0.4
896 0.49
897 0.53
898 0.55
899 0.56
900 0.5
901 0.44
902 0.38
903 0.34
904 0.25
905 0.2
906 0.17
907 0.14
908 0.14
909 0.14
910 0.14
911 0.15
912 0.19
913 0.22
914 0.28
915 0.33
916 0.42
917 0.51
918 0.59
919 0.57
920 0.59
921 0.56
922 0.55
923 0.54
924 0.48
925 0.41
926 0.31
927 0.31
928 0.26
929 0.26
930 0.21
931 0.17
932 0.15
933 0.13
934 0.15
935 0.13
936 0.16
937 0.15
938 0.16
939 0.2
940 0.19
941 0.19
942 0.19
943 0.18
944 0.17
945 0.2
946 0.19
947 0.17
948 0.25
949 0.27
950 0.27
951 0.32
952 0.3
953 0.31
954 0.36
955 0.36
956 0.33
957 0.36
958 0.35
959 0.33
960 0.32
961 0.28
962 0.22
963 0.19
964 0.17
965 0.13
966 0.12
967 0.11
968 0.12
969 0.12
970 0.12
971 0.12
972 0.1
973 0.09
974 0.09
975 0.08
976 0.08
977 0.08
978 0.11
979 0.11
980 0.11
981 0.12
982 0.12
983 0.13
984 0.17
985 0.19
986 0.19
987 0.29