FuNGI

A0A550CSQ8

Protein Details

Accession

A0A550CSQ8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
46-66	SRLSLRPQTRHTRNRLLPLCQ	Hydrophilic
962-990	DISRHSLLVRRHRSRHQRRIRRNVIGFGA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
973-980	HRSRHQRR

Subcellular Location(s)

mito 9, nucl 7, cyto 6, plas 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007259 GCP IPR040457 GCP_C IPR042241 GCP_C_sf IPR041470 GCP_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0000930 C:gamma-tubulin complex GO:0005874 C:microtubule GO:0000922 C:spindle pole GO:0005816 C:spindle pole body GO:0043015 F:gamma-tubulin binding GO:0007020 P:microtubule nucleation
Pfam	View protein in Pfam PF04130 GCP_C_terminal PF17681 GCP_N_terminal
CDD	cd22572 GCP5_NTD

Amino Acid Sequences

MLPSNSAPGLGRPPRSASSAGHRRASGSNALNAPRPQSSASVRPGSRLSLRPQTRHTRNRLLPLCQKLVTQITGNDEQSVDDAQQQHRQDVDFALKTLESSKQATTLDMELIERQIRGLIQKARINNQDGLAAALKKSLERMKDDSLRLKKSDLDSDIRSSHLPAHIRFLLSLSSSPSAASLAYAEHYLEEIRNPPPSPKPITWLDIIGDEPFEGEHWQGVYGLPPGFVRDSESDDFGDGSEPSLSAMSDDPELDSLNESLSSVEDAPIMPTTPPFVAENTLLQPPPKYTYTHRQVLEDLRTRQYWTNHWRSDVHPDRAFDIGNAATFGSSIQRALARGQPVPLTPEIHIDEVDMVREVLIGLQGRHNIIFIADSPTCPLRPDAPRLAHLSLGSQQSILQSYCQTAGVLYHLRTFTSFVLAQVSARRPQTSSYIKLKPPIRTLEAFADAVAEQLRQFDAWCASREQNICEARESVGAGQLVVSLLSTEKALRDRYERAFSALLSVVVSVCGEPELGRWRLPVKAAARISAALLDALLDAYKAHMEIGEAVTADALLSAFRLTAEPVWGMVHLWLRDGMDPTGKELDDELFIEGSGLGVGMMGMGMLDPDFWADAYTLREDAAPATGGEAAHKVVPAFLAPVAELLLGAGKGTGLLRALGDEMEGGEARLCDWRSFGELLAAEASTDLSTDTLAHAVYDALYPHCAAVGRALVGVVREEFDEHLAAIEGVFLMRRGDSIAHFADLVFEKMDAHQSWADFHFLNTSFNDVVQRTGGTQWVQPALVRLAFRGGKEKERSISRTVRALDGLSLDYSVPFPVIYIFSPRIIQIYNSIFTFLLQIMRAKSVLERILFRGESKRPSPTMKVFYALRGKMSWFTNALLNFFTTYVIHSEVLRFRKRIHDVGSLDELITLHEEHIERIQGRCLLQSKTSALHRAVLSILDLSISFSQLLVSVSGDANATLDISRHSLLVRRHRSRHQRRIRRNVIGFGASSAALDSSSDEDDVEDEADLTRDAPSTSLTTSAASAAFDPLGGVEKISTELDGLVRFVRRGVDSLAGGTSEAASAFGVLSFVLEDWDL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.44
3	0.44
4	0.38
5	0.43
6	0.49
7	0.52
8	0.52
9	0.49
10	0.49
11	0.49
12	0.49
13	0.46
14	0.4
15	0.4
16	0.4
17	0.43
18	0.45
19	0.44
20	0.43
21	0.37
22	0.35
23	0.31
24	0.31
25	0.35
26	0.37
27	0.42
28	0.47
29	0.46
30	0.47
31	0.47
32	0.47
33	0.47
34	0.45
35	0.45
36	0.47
37	0.54
38	0.56
39	0.63
40	0.69
41	0.73
42	0.77
43	0.79
44	0.79
45	0.78
46	0.83
47	0.81
48	0.79
49	0.77
50	0.75
51	0.72
52	0.62
53	0.56
54	0.5
55	0.48
56	0.41
57	0.35
58	0.3
59	0.31
60	0.35
61	0.35
62	0.31
63	0.27
64	0.24
65	0.23
66	0.21
67	0.16
68	0.15
69	0.19
70	0.21
71	0.28
72	0.29
73	0.31
74	0.31
75	0.32
76	0.29
77	0.28
78	0.32
79	0.27
80	0.26
81	0.25
82	0.23
83	0.22
84	0.23
85	0.23
86	0.19
87	0.2
88	0.21
89	0.23
90	0.24
91	0.24
92	0.24
93	0.22
94	0.2
95	0.18
96	0.18
97	0.15
98	0.17
99	0.17
100	0.15
101	0.13
102	0.13
103	0.14
104	0.15
105	0.22
106	0.25
107	0.31
108	0.36
109	0.41
110	0.47
111	0.52
112	0.54
113	0.5
114	0.44
115	0.39
116	0.34
117	0.32
118	0.28
119	0.23
120	0.18
121	0.17
122	0.16
123	0.15
124	0.2
125	0.22
126	0.23
127	0.28
128	0.33
129	0.4
130	0.47
131	0.52
132	0.56
133	0.6
134	0.61
135	0.57
136	0.54
137	0.51
138	0.48
139	0.5
140	0.45
141	0.42
142	0.4
143	0.43
144	0.43
145	0.39
146	0.35
147	0.29
148	0.28
149	0.28
150	0.29
151	0.25
152	0.31
153	0.32
154	0.32
155	0.31
156	0.28
157	0.24
158	0.2
159	0.2
160	0.17
161	0.16
162	0.15
163	0.15
164	0.14
165	0.12
166	0.11
167	0.1
168	0.07
169	0.06
170	0.07
171	0.08
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.1
178	0.12
179	0.14
180	0.18
181	0.19
182	0.23
183	0.29
184	0.35
185	0.4
186	0.38
187	0.42
188	0.42
189	0.44
190	0.41
191	0.36
192	0.31
193	0.25
194	0.24
195	0.19
196	0.15
197	0.11
198	0.09
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.12
214	0.13
215	0.13
216	0.15
217	0.14
218	0.2
219	0.21
220	0.23
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.17
225	0.16
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.13
265	0.13
266	0.15
267	0.16
268	0.18
269	0.17
270	0.17
271	0.17
272	0.17
273	0.2
274	0.2
275	0.21
276	0.24
277	0.34
278	0.41
279	0.48
280	0.47
281	0.44
282	0.46
283	0.49
284	0.51
285	0.48
286	0.44
287	0.4
288	0.4
289	0.41
290	0.42
291	0.39
292	0.4
293	0.42
294	0.48
295	0.47
296	0.49
297	0.49
298	0.46
299	0.54
300	0.54
301	0.52
302	0.46
303	0.44
304	0.43
305	0.42
306	0.39
307	0.28
308	0.22
309	0.15
310	0.11
311	0.11
312	0.09
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.08
321	0.09
322	0.11
323	0.15
324	0.16
325	0.17
326	0.18
327	0.18
328	0.18
329	0.2
330	0.2
331	0.18
332	0.16
333	0.19
334	0.19
335	0.19
336	0.18
337	0.15
338	0.15
339	0.13
340	0.13
341	0.09
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.04
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.09
351	0.1
352	0.11
353	0.11
354	0.11
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.13
363	0.14
364	0.14
365	0.15
366	0.15
367	0.16
368	0.2
369	0.26
370	0.32
371	0.33
372	0.36
373	0.39
374	0.39
375	0.34
376	0.29
377	0.25
378	0.22
379	0.21
380	0.18
381	0.14
382	0.13
383	0.13
384	0.15
385	0.13
386	0.1
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.07
393	0.08
394	0.1
395	0.11
396	0.11
397	0.14
398	0.13
399	0.14
400	0.14
401	0.16
402	0.13
403	0.14
404	0.14
405	0.11
406	0.13
407	0.13
408	0.13
409	0.16
410	0.18
411	0.18
412	0.19
413	0.2
414	0.18
415	0.19
416	0.27
417	0.28
418	0.32
419	0.36
420	0.41
421	0.41
422	0.48
423	0.52
424	0.49
425	0.48
426	0.46
427	0.42
428	0.37
429	0.39
430	0.35
431	0.32
432	0.27
433	0.22
434	0.18
435	0.14
436	0.13
437	0.1
438	0.07
439	0.05
440	0.05
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.09
446	0.1
447	0.12
448	0.14
449	0.15
450	0.2
451	0.21
452	0.21
453	0.25
454	0.26
455	0.26
456	0.24
457	0.24
458	0.2
459	0.2
460	0.19
461	0.11
462	0.11
463	0.1
464	0.09
465	0.08
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.04
474	0.04
475	0.05
476	0.08
477	0.1
478	0.11
479	0.15
480	0.19
481	0.23
482	0.27
483	0.26
484	0.26
485	0.25
486	0.23
487	0.22
488	0.18
489	0.14
490	0.1
491	0.09
492	0.07
493	0.06
494	0.06
495	0.04
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.05
501	0.1
502	0.11
503	0.11
504	0.12
505	0.13
506	0.14
507	0.15
508	0.19
509	0.16
510	0.22
511	0.23
512	0.23
513	0.22
514	0.21
515	0.2
516	0.15
517	0.13
518	0.06
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.02
526	0.03
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.04
540	0.03
541	0.03
542	0.02
543	0.02
544	0.02
545	0.03
546	0.03
547	0.03
548	0.04
549	0.04
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.07
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.09
562	0.1
563	0.11
564	0.1
565	0.1
566	0.1
567	0.12
568	0.13
569	0.12
570	0.12
571	0.11
572	0.11
573	0.09
574	0.09
575	0.08
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.05
580	0.04
581	0.04
582	0.03
583	0.02
584	0.02
585	0.02
586	0.02
587	0.02
588	0.01
589	0.01
590	0.01
591	0.02
592	0.02
593	0.02
594	0.02
595	0.02
596	0.02
597	0.02
598	0.03
599	0.03
600	0.05
601	0.06
602	0.07
603	0.07
604	0.08
605	0.08
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.05
611	0.06
612	0.07
613	0.06
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.06
620	0.05
621	0.06
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.04
631	0.03
632	0.04
633	0.03
634	0.03
635	0.03
636	0.02
637	0.03
638	0.03
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.04
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.05
655	0.09
656	0.09
657	0.09
658	0.09
659	0.1
660	0.12
661	0.13
662	0.13
663	0.12
664	0.11
665	0.12
666	0.12
667	0.11
668	0.08
669	0.07
670	0.07
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.03
675	0.04
676	0.04
677	0.04
678	0.05
679	0.05
680	0.04
681	0.05
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.07
689	0.06
690	0.07
691	0.07
692	0.06
693	0.07
694	0.08
695	0.08
696	0.07
697	0.08
698	0.07
699	0.07
700	0.08
701	0.06
702	0.06
703	0.05
704	0.06
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.06
711	0.06
712	0.05
713	0.05
714	0.04
715	0.03
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.05
722	0.06
723	0.07
724	0.11
725	0.12
726	0.12
727	0.12
728	0.12
729	0.13
730	0.13
731	0.13
732	0.09
733	0.08
734	0.08
735	0.09
736	0.13
737	0.11
738	0.13
739	0.14
740	0.14
741	0.16
742	0.17
743	0.18
744	0.14
745	0.14
746	0.16
747	0.15
748	0.17
749	0.14
750	0.17
751	0.15
752	0.15
753	0.18
754	0.14
755	0.14
756	0.13
757	0.13
758	0.11
759	0.12
760	0.14
761	0.12
762	0.13
763	0.14
764	0.15
765	0.15
766	0.14
767	0.15
768	0.15
769	0.16
770	0.15
771	0.13
772	0.17
773	0.18
774	0.19
775	0.25
776	0.26
777	0.31
778	0.36
779	0.39
780	0.4
781	0.44
782	0.48
783	0.47
784	0.52
785	0.46
786	0.48
787	0.46
788	0.42
789	0.37
790	0.33
791	0.27
792	0.21
793	0.19
794	0.12
795	0.11
796	0.1
797	0.09
798	0.09
799	0.08
800	0.07
801	0.05
802	0.05
803	0.06
804	0.07
805	0.08
806	0.12
807	0.14
808	0.15
809	0.16
810	0.16
811	0.16
812	0.16
813	0.16
814	0.16
815	0.19
816	0.19
817	0.19
818	0.2
819	0.18
820	0.18
821	0.18
822	0.13
823	0.11
824	0.11
825	0.13
826	0.13
827	0.14
828	0.14
829	0.13
830	0.14
831	0.17
832	0.2
833	0.2
834	0.21
835	0.22
836	0.27
837	0.27
838	0.28
839	0.3
840	0.31
841	0.36
842	0.37
843	0.4
844	0.39
845	0.43
846	0.49
847	0.5
848	0.51
849	0.46
850	0.47
851	0.42
852	0.45
853	0.49
854	0.42
855	0.37
856	0.31
857	0.31
858	0.32
859	0.33
860	0.29
861	0.22
862	0.22
863	0.24
864	0.24
865	0.23
866	0.19
867	0.18
868	0.16
869	0.15
870	0.14
871	0.1
872	0.1
873	0.11
874	0.13
875	0.13
876	0.12
877	0.16
878	0.22
879	0.3
880	0.34
881	0.33
882	0.33
883	0.42
884	0.48
885	0.5
886	0.49
887	0.5
888	0.47
889	0.5
890	0.52
891	0.43
892	0.37
893	0.32
894	0.26
895	0.17
896	0.17
897	0.12
898	0.08
899	0.11
900	0.11
901	0.12
902	0.14
903	0.18
904	0.18
905	0.19
906	0.23
907	0.23
908	0.23
909	0.27
910	0.29
911	0.28
912	0.28
913	0.31
914	0.3
915	0.31
916	0.35
917	0.35
918	0.32
919	0.35
920	0.32
921	0.3
922	0.28
923	0.23
924	0.2
925	0.15
926	0.13
927	0.08
928	0.08
929	0.1
930	0.09
931	0.1
932	0.09
933	0.08
934	0.08
935	0.09
936	0.1
937	0.08
938	0.08
939	0.09
940	0.09
941	0.09
942	0.09
943	0.08
944	0.08
945	0.07
946	0.07
947	0.06
948	0.06
949	0.07
950	0.1
951	0.1
952	0.11
953	0.12
954	0.17
955	0.25
956	0.35
957	0.45
958	0.51
959	0.58
960	0.68
961	0.78
962	0.84
963	0.87
964	0.88
965	0.88
966	0.9
967	0.95
968	0.95
969	0.94
970	0.88
971	0.83
972	0.76
973	0.68
974	0.57
975	0.47
976	0.38
977	0.27
978	0.22
979	0.15
980	0.1
981	0.08
982	0.07
983	0.07
984	0.08
985	0.1
986	0.1
987	0.09
988	0.1
989	0.1
990	0.11
991	0.1
992	0.08
993	0.07
994	0.07
995	0.08
996	0.08
997	0.08
998	0.08
999	0.08
1000	0.08
1001	0.09
1002	0.1
1003	0.12
1004	0.13
1005	0.14
1006	0.14
1007	0.14
1008	0.15
1009	0.16
1010	0.14
1011	0.12
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.11
1015	0.1
1016	0.09
1017	0.08
1018	0.11
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.08
1022	0.09
1023	0.12
1024	0.12
1025	0.12
1026	0.09
1027	0.1
1028	0.12
1029	0.12
1030	0.13
1031	0.14
1032	0.16
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.19
1036	0.19
1037	0.21
1038	0.23
1039	0.23
1040	0.22
1041	0.24
1042	0.23
1043	0.19
1044	0.18
1045	0.15
1046	0.13
1047	0.09
1048	0.08
1049	0.07
1050	0.06
1051	0.06
1052	0.06
1053	0.06
1054	0.05
1055	0.05
1056	0.05
1057	0.05
1058	0.05

A0A550CSQ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer