Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CMC9

Protein Details
Accession A0A550CMC9    Localization Confidence High Confidence Score 25.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-75EPVQQAPKPAPQPKQKRVRVVKRIVERPKTVHydrophilic
326-351ELHFTKVRTAKKKKDRAGRKLGKGGNBasic
807-832EEEIARMKKNQERRLHRKNAKIVKEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-63KQKRVR
333-349RTAKKKKDRAGRKLGKG
800-828KRAMKRLEEEIARMKKNQERRLHRKNAKI
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
IPR041670  Znf-CCHC_6  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
PF15288  zf-CCHC_6  
Amino Acid Sequences MSGGDENDAVQLGLSTSNAFSSDQIYNDVYEDDYGPFEDDDEEPEPVQQAPKPAPQPKQKRVRVVKRIVERPKTVYERFPTFEKNKVLDFTELFRGETVRKSRISRRPFHVEMTYPRKREAPKGYLDLVVGDTKRQVESKRVEEVVSAGSIESDLRHALEERDGTESAVNLPLHDRTFDLVLLSNWEDQIVYGPEGGSAAKSSKAFEIQADTSLNERLNDKPFRDFTQLEFNHEDDVVPESGKATRPRKRFRLDPSQVRDKFNIANDQYYEVSKERHRVRQTFGQIQVEHAYPAQKLQLPFYKTRLSKAEARSFHRPALQFPSNIELHFTKVRTAKKKKDRAGRKLGKGGNVSEGLHRTTDLSLRDTSNFVLWEYSEEHPPVVPNFGMGSALVNYYRKKDDKDEHVPKFDLGVPFVLEPQDDSPFMKFGNVYPGQAIPALYNNLVRAPLFRHKPYATDFLVVRHTYKGETRYYLREIKNLFVAGQTYPVTEVPGPHSRKITSTIKNRLQIIAFKLLRKSIEERLKIHRLMKYFPDQNELQMRQRLKEFMEYHRRGIHQGFWRLKDHLTIPSDAEMLKMISPEQVVLMESMQVGQRHLADCGYTQTAEDADDTSNLSIEQQLAPWITTKNFILATQAKAMLKLHGEGDPSGRGRLQLPGENYEEKLAEAESRPKSAHRYNVAEQQQIYKSEVERIWKAQFDSLSRKDAPPLTEEDEREYARKARDAAAQHRPDGSIRESPMPMEDREASMARTQLVDGVWKTEIVRDPAVIRAYIRSRQVLEEESTLADSLAPTGDAEKDKRAMKRLEEEIARMKKNQERRLHRKNAKIVKEGGTPMQLNRPIKPDTTRRCGHCGQIGHMKTNRKCPRWAEFNSATPPMPVPTPANTAAGPSGGATSPPPPGAPMGFNRGPAFGFPAAVPSPLATSPPVSAMDVDDDMGGSSSQGPKLKLTLKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.08
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.14
9 0.16
10 0.16
11 0.19
12 0.2
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.16
28 0.17
29 0.18
30 0.17
31 0.18
32 0.18
33 0.17
34 0.2
35 0.18
36 0.21
37 0.25
38 0.32
39 0.41
40 0.48
41 0.56
42 0.63
43 0.72
44 0.76
45 0.82
46 0.83
47 0.84
48 0.88
49 0.89
50 0.89
51 0.89
52 0.88
53 0.87
54 0.89
55 0.88
56 0.86
57 0.79
58 0.74
59 0.74
60 0.72
61 0.66
62 0.64
63 0.6
64 0.59
65 0.57
66 0.55
67 0.55
68 0.51
69 0.55
70 0.54
71 0.5
72 0.47
73 0.46
74 0.45
75 0.4
76 0.38
77 0.34
78 0.35
79 0.33
80 0.3
81 0.27
82 0.27
83 0.25
84 0.31
85 0.33
86 0.3
87 0.35
88 0.41
89 0.5
90 0.58
91 0.65
92 0.67
93 0.69
94 0.73
95 0.71
96 0.7
97 0.66
98 0.62
99 0.62
100 0.63
101 0.64
102 0.56
103 0.55
104 0.56
105 0.54
106 0.57
107 0.57
108 0.55
109 0.53
110 0.57
111 0.57
112 0.52
113 0.49
114 0.4
115 0.32
116 0.29
117 0.22
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.19
122 0.21
123 0.22
124 0.26
125 0.33
126 0.37
127 0.42
128 0.42
129 0.4
130 0.37
131 0.36
132 0.29
133 0.22
134 0.17
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.15
147 0.16
148 0.16
149 0.19
150 0.19
151 0.18
152 0.18
153 0.17
154 0.14
155 0.18
156 0.17
157 0.14
158 0.15
159 0.17
160 0.17
161 0.18
162 0.17
163 0.13
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.15
170 0.16
171 0.15
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.1
176 0.14
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.21
195 0.19
196 0.22
197 0.21
198 0.2
199 0.19
200 0.21
201 0.2
202 0.16
203 0.17
204 0.18
205 0.24
206 0.29
207 0.29
208 0.33
209 0.35
210 0.39
211 0.43
212 0.4
213 0.36
214 0.42
215 0.41
216 0.4
217 0.4
218 0.35
219 0.31
220 0.29
221 0.26
222 0.16
223 0.18
224 0.13
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.17
230 0.25
231 0.3
232 0.38
233 0.48
234 0.57
235 0.66
236 0.71
237 0.74
238 0.74
239 0.77
240 0.78
241 0.79
242 0.77
243 0.79
244 0.76
245 0.72
246 0.64
247 0.56
248 0.5
249 0.43
250 0.44
251 0.34
252 0.34
253 0.31
254 0.32
255 0.3
256 0.26
257 0.25
258 0.18
259 0.2
260 0.2
261 0.28
262 0.31
263 0.39
264 0.46
265 0.47
266 0.53
267 0.58
268 0.63
269 0.62
270 0.6
271 0.58
272 0.5
273 0.48
274 0.44
275 0.35
276 0.28
277 0.21
278 0.18
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.19
285 0.25
286 0.28
287 0.3
288 0.34
289 0.39
290 0.36
291 0.4
292 0.4
293 0.37
294 0.41
295 0.46
296 0.51
297 0.48
298 0.53
299 0.57
300 0.55
301 0.53
302 0.51
303 0.44
304 0.39
305 0.42
306 0.39
307 0.32
308 0.3
309 0.32
310 0.28
311 0.27
312 0.26
313 0.18
314 0.18
315 0.21
316 0.2
317 0.2
318 0.25
319 0.33
320 0.41
321 0.5
322 0.57
323 0.64
324 0.73
325 0.77
326 0.82
327 0.85
328 0.84
329 0.86
330 0.85
331 0.81
332 0.8
333 0.75
334 0.7
335 0.61
336 0.52
337 0.44
338 0.37
339 0.31
340 0.24
341 0.23
342 0.18
343 0.16
344 0.15
345 0.12
346 0.12
347 0.14
348 0.13
349 0.15
350 0.15
351 0.17
352 0.18
353 0.17
354 0.17
355 0.15
356 0.14
357 0.12
358 0.1
359 0.09
360 0.1
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.14
368 0.13
369 0.11
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.12
383 0.17
384 0.18
385 0.2
386 0.27
387 0.33
388 0.4
389 0.5
390 0.57
391 0.56
392 0.58
393 0.56
394 0.49
395 0.44
396 0.38
397 0.28
398 0.19
399 0.16
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.1
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.15
417 0.15
418 0.15
419 0.15
420 0.15
421 0.15
422 0.15
423 0.15
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.11
435 0.17
436 0.21
437 0.22
438 0.26
439 0.26
440 0.29
441 0.32
442 0.33
443 0.27
444 0.26
445 0.25
446 0.22
447 0.25
448 0.23
449 0.2
450 0.15
451 0.15
452 0.13
453 0.16
454 0.18
455 0.16
456 0.18
457 0.2
458 0.22
459 0.26
460 0.33
461 0.31
462 0.32
463 0.31
464 0.29
465 0.29
466 0.25
467 0.21
468 0.13
469 0.14
470 0.09
471 0.1
472 0.09
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.08
478 0.09
479 0.11
480 0.2
481 0.22
482 0.23
483 0.25
484 0.24
485 0.25
486 0.31
487 0.34
488 0.34
489 0.4
490 0.48
491 0.52
492 0.55
493 0.54
494 0.5
495 0.43
496 0.38
497 0.33
498 0.32
499 0.28
500 0.26
501 0.26
502 0.26
503 0.25
504 0.24
505 0.25
506 0.24
507 0.31
508 0.33
509 0.35
510 0.41
511 0.46
512 0.46
513 0.47
514 0.41
515 0.35
516 0.34
517 0.35
518 0.36
519 0.35
520 0.33
521 0.34
522 0.31
523 0.33
524 0.37
525 0.35
526 0.31
527 0.31
528 0.32
529 0.28
530 0.3
531 0.28
532 0.22
533 0.28
534 0.27
535 0.31
536 0.41
537 0.41
538 0.42
539 0.44
540 0.44
541 0.38
542 0.36
543 0.35
544 0.31
545 0.38
546 0.4
547 0.39
548 0.41
549 0.4
550 0.39
551 0.34
552 0.29
553 0.26
554 0.24
555 0.22
556 0.2
557 0.19
558 0.19
559 0.17
560 0.15
561 0.1
562 0.08
563 0.07
564 0.07
565 0.06
566 0.06
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.06
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.1
582 0.1
583 0.1
584 0.1
585 0.08
586 0.08
587 0.11
588 0.11
589 0.1
590 0.09
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.09
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.08
599 0.07
600 0.07
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.06
606 0.06
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.12
614 0.12
615 0.12
616 0.13
617 0.12
618 0.17
619 0.18
620 0.19
621 0.19
622 0.22
623 0.2
624 0.21
625 0.21
626 0.17
627 0.15
628 0.14
629 0.14
630 0.12
631 0.14
632 0.13
633 0.14
634 0.16
635 0.16
636 0.16
637 0.15
638 0.14
639 0.14
640 0.18
641 0.19
642 0.2
643 0.22
644 0.25
645 0.28
646 0.28
647 0.28
648 0.24
649 0.22
650 0.17
651 0.15
652 0.12
653 0.1
654 0.11
655 0.18
656 0.18
657 0.2
658 0.21
659 0.22
660 0.29
661 0.32
662 0.39
663 0.37
664 0.43
665 0.44
666 0.53
667 0.55
668 0.51
669 0.46
670 0.44
671 0.4
672 0.35
673 0.33
674 0.26
675 0.23
676 0.26
677 0.27
678 0.27
679 0.27
680 0.29
681 0.3
682 0.3
683 0.31
684 0.28
685 0.28
686 0.28
687 0.34
688 0.33
689 0.36
690 0.36
691 0.35
692 0.36
693 0.37
694 0.34
695 0.28
696 0.29
697 0.29
698 0.31
699 0.32
700 0.32
701 0.32
702 0.32
703 0.3
704 0.28
705 0.28
706 0.26
707 0.28
708 0.25
709 0.25
710 0.31
711 0.36
712 0.41
713 0.47
714 0.47
715 0.45
716 0.45
717 0.42
718 0.37
719 0.34
720 0.31
721 0.25
722 0.25
723 0.28
724 0.27
725 0.26
726 0.29
727 0.28
728 0.24
729 0.23
730 0.22
731 0.19
732 0.22
733 0.22
734 0.2
735 0.19
736 0.19
737 0.16
738 0.15
739 0.14
740 0.13
741 0.12
742 0.15
743 0.13
744 0.15
745 0.14
746 0.15
747 0.15
748 0.18
749 0.21
750 0.21
751 0.22
752 0.2
753 0.21
754 0.25
755 0.26
756 0.22
757 0.19
758 0.21
759 0.24
760 0.28
761 0.3
762 0.29
763 0.29
764 0.31
765 0.33
766 0.31
767 0.29
768 0.26
769 0.24
770 0.21
771 0.2
772 0.18
773 0.14
774 0.11
775 0.08
776 0.07
777 0.06
778 0.06
779 0.05
780 0.06
781 0.1
782 0.13
783 0.15
784 0.19
785 0.24
786 0.29
787 0.33
788 0.4
789 0.42
790 0.44
791 0.5
792 0.51
793 0.53
794 0.5
795 0.5
796 0.52
797 0.54
798 0.51
799 0.45
800 0.47
801 0.46
802 0.54
803 0.59
804 0.6
805 0.63
806 0.71
807 0.8
808 0.85
809 0.87
810 0.86
811 0.88
812 0.87
813 0.84
814 0.8
815 0.74
816 0.68
817 0.65
818 0.58
819 0.5
820 0.45
821 0.39
822 0.35
823 0.37
824 0.39
825 0.36
826 0.37
827 0.39
828 0.36
829 0.39
830 0.44
831 0.47
832 0.49
833 0.55
834 0.59
835 0.59
836 0.64
837 0.63
838 0.61
839 0.58
840 0.52
841 0.49
842 0.53
843 0.5
844 0.5
845 0.52
846 0.57
847 0.54
848 0.62
849 0.66
850 0.6
851 0.65
852 0.65
853 0.69
854 0.69
855 0.7
856 0.69
857 0.64
858 0.66
859 0.64
860 0.6
861 0.51
862 0.43
863 0.38
864 0.3
865 0.26
866 0.22
867 0.2
868 0.21
869 0.25
870 0.26
871 0.27
872 0.25
873 0.26
874 0.24
875 0.21
876 0.17
877 0.12
878 0.12
879 0.1
880 0.11
881 0.1
882 0.12
883 0.14
884 0.15
885 0.15
886 0.14
887 0.17
888 0.18
889 0.21
890 0.23
891 0.29
892 0.3
893 0.34
894 0.33
895 0.32
896 0.3
897 0.27
898 0.28
899 0.2
900 0.19
901 0.16
902 0.19
903 0.19
904 0.19
905 0.19
906 0.14
907 0.16
908 0.15
909 0.17
910 0.13
911 0.14
912 0.15
913 0.17
914 0.18
915 0.16
916 0.16
917 0.16
918 0.18
919 0.17
920 0.16
921 0.14
922 0.12
923 0.12
924 0.12
925 0.1
926 0.07
927 0.1
928 0.13
929 0.18
930 0.22
931 0.23
932 0.24
933 0.31
934 0.39