Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DMN3

Protein Details
Accession C5DMN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-426DVDAVSKDQDEKRKRKHERRSKDKSKSKTKSSSKDHRYQPYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
397-417KRKRKHERRSKDKSKSKTKSS
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 7.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR039328  WDR89  
KEGG lth:KLTH0G10296g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MIINLLISQSSRTSRTTYSMSYSKLESIEFGPNNWCLKLQPIYNSGLLTSLSNGRVELIDWATHKSILQIQTHATSVNDMVIINNDRMNGSLIATAAEDAVKIYDLKSNDCVATLKNGKSAPFLSLDSRHGLLGCGTELSGVDAELHVYDIRSWQQPLRSLVDSHHDDITSIKFHPSDPNVLLSGSTDGYVNIYDLTQQEEDDALHQVINFASIHSCGWLSPKRIYTLSHMETYGIHELNDKRDEPTEPKPVDFGDVRKPWDCNYVIDVYPGFIATGKSEEGRGELKLIPLDHEKPELQSAITIPSAHDDEVVRDVLVPFQHEDLLYSCGEDGSLKVWKSSAGPLNVPQEFWQYSEKIDVFSGTVAEVEMMDSEVPDIELRQEPSDVDAVSKDQDEKRKRKHERRSKDKSKSKTKSSSKDHRYQPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.34
4 0.33
5 0.37
6 0.39
7 0.4
8 0.39
9 0.38
10 0.36
11 0.32
12 0.29
13 0.25
14 0.23
15 0.29
16 0.27
17 0.26
18 0.27
19 0.3
20 0.32
21 0.3
22 0.28
23 0.19
24 0.25
25 0.29
26 0.29
27 0.31
28 0.32
29 0.35
30 0.36
31 0.36
32 0.3
33 0.25
34 0.22
35 0.16
36 0.15
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.22
54 0.25
55 0.26
56 0.25
57 0.26
58 0.27
59 0.28
60 0.26
61 0.2
62 0.16
63 0.14
64 0.12
65 0.11
66 0.09
67 0.08
68 0.12
69 0.14
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.16
76 0.13
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.1
92 0.11
93 0.14
94 0.16
95 0.18
96 0.17
97 0.18
98 0.18
99 0.15
100 0.23
101 0.26
102 0.24
103 0.26
104 0.28
105 0.27
106 0.29
107 0.3
108 0.23
109 0.2
110 0.21
111 0.2
112 0.21
113 0.23
114 0.22
115 0.22
116 0.2
117 0.18
118 0.16
119 0.14
120 0.11
121 0.09
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.07
138 0.1
139 0.11
140 0.13
141 0.15
142 0.18
143 0.23
144 0.26
145 0.29
146 0.28
147 0.26
148 0.26
149 0.31
150 0.31
151 0.27
152 0.25
153 0.2
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.15
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.17
163 0.18
164 0.2
165 0.2
166 0.21
167 0.2
168 0.19
169 0.19
170 0.14
171 0.13
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.09
206 0.13
207 0.16
208 0.19
209 0.21
210 0.23
211 0.24
212 0.25
213 0.26
214 0.3
215 0.3
216 0.27
217 0.26
218 0.24
219 0.23
220 0.24
221 0.22
222 0.14
223 0.12
224 0.14
225 0.15
226 0.19
227 0.22
228 0.19
229 0.18
230 0.19
231 0.22
232 0.23
233 0.28
234 0.33
235 0.31
236 0.31
237 0.3
238 0.29
239 0.3
240 0.26
241 0.23
242 0.23
243 0.25
244 0.28
245 0.29
246 0.3
247 0.28
248 0.32
249 0.3
250 0.23
251 0.23
252 0.23
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.15
257 0.14
258 0.12
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.15
276 0.16
277 0.19
278 0.21
279 0.2
280 0.22
281 0.21
282 0.2
283 0.22
284 0.2
285 0.16
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.1
292 0.12
293 0.13
294 0.12
295 0.13
296 0.11
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.11
310 0.13
311 0.12
312 0.14
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.1
318 0.09
319 0.07
320 0.08
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.14
325 0.15
326 0.16
327 0.23
328 0.27
329 0.25
330 0.27
331 0.32
332 0.39
333 0.38
334 0.37
335 0.31
336 0.3
337 0.27
338 0.27
339 0.27
340 0.2
341 0.21
342 0.26
343 0.26
344 0.21
345 0.21
346 0.19
347 0.16
348 0.16
349 0.15
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.09
366 0.13
367 0.16
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.2
372 0.22
373 0.19
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.16
378 0.18
379 0.2
380 0.24
381 0.34
382 0.43
383 0.52
384 0.61
385 0.71
386 0.8
387 0.86
388 0.91
389 0.92
390 0.93
391 0.94
392 0.95
393 0.95
394 0.95
395 0.94
396 0.94
397 0.94
398 0.92
399 0.91
400 0.91
401 0.9
402 0.89
403 0.9
404 0.91
405 0.89
406 0.89