Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CTW8

Protein Details
Accession A0A550CTW8    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MVSRTSSKGKKRAREPPAVAYRSHydrophilic
30-55SPAPSEPPPVKKPKRAETRPCPVCSEHydrophilic
123-149QGEKTIQTIKRRRKQRHGKLKDMAREABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-13GKKRA
132-143KRRRKQRHGKLK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031824  RNF220_mid  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Pfam View protein in Pfam  
PF15926  RNF220  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MVSRTSSKGKKRAREPPAVAYRSESTSSLSPAPSEPPPVKKPKRAETRPCPVCSEPIPLRLMGKHLELESERVDDIIAHVGSPEVYQDDREEGPSNASRRSAIRARKSFSSAGARDPTDIAYQGEKTIQTIKRRRKQRHGKLKDMAREADEDARPARSMTVGRNEIVCPVCSANVQGDQDVLDAHVDACVANESRKLEDERQRELARRSAEEPVWQLQDTGDDEHLGHVGDVRGTGFHTRDRDEQDIDEEIDVDGDDAEVFGAAQFDEGDIVPVQTVQMEADDNLEIDIEGDEVNADHRTLRDLVADGKVVRRSAVECAKAEMDQVMGVGDADRIDLAILAAKRKGDKKALIVALEEKVDLLESLRISSSTSLLCRICLDPYNEPTVSTGCWHTCCRECWLRCLGSTKLCPICKRITAAADLRRVYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.82
3 0.82
4 0.83
5 0.76
6 0.66
7 0.61
8 0.55
9 0.48
10 0.44
11 0.34
12 0.27
13 0.27
14 0.29
15 0.27
16 0.25
17 0.22
18 0.22
19 0.25
20 0.24
21 0.29
22 0.31
23 0.36
24 0.43
25 0.53
26 0.6
27 0.65
28 0.73
29 0.76
30 0.82
31 0.85
32 0.87
33 0.86
34 0.89
35 0.88
36 0.82
37 0.78
38 0.68
39 0.63
40 0.55
41 0.54
42 0.46
43 0.44
44 0.42
45 0.37
46 0.37
47 0.33
48 0.33
49 0.26
50 0.25
51 0.22
52 0.2
53 0.23
54 0.22
55 0.24
56 0.22
57 0.21
58 0.19
59 0.16
60 0.16
61 0.12
62 0.12
63 0.14
64 0.12
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.1
75 0.13
76 0.13
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.2
81 0.25
82 0.26
83 0.25
84 0.25
85 0.24
86 0.24
87 0.3
88 0.34
89 0.38
90 0.46
91 0.51
92 0.54
93 0.56
94 0.59
95 0.54
96 0.51
97 0.51
98 0.42
99 0.41
100 0.41
101 0.37
102 0.34
103 0.33
104 0.29
105 0.21
106 0.2
107 0.16
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.2
115 0.24
116 0.32
117 0.41
118 0.51
119 0.57
120 0.68
121 0.76
122 0.79
123 0.85
124 0.87
125 0.89
126 0.87
127 0.89
128 0.87
129 0.85
130 0.81
131 0.74
132 0.64
133 0.54
134 0.47
135 0.39
136 0.37
137 0.29
138 0.23
139 0.2
140 0.19
141 0.18
142 0.16
143 0.15
144 0.11
145 0.12
146 0.14
147 0.21
148 0.22
149 0.22
150 0.24
151 0.23
152 0.25
153 0.24
154 0.2
155 0.14
156 0.13
157 0.13
158 0.11
159 0.12
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.15
184 0.21
185 0.28
186 0.32
187 0.34
188 0.39
189 0.4
190 0.42
191 0.41
192 0.39
193 0.33
194 0.31
195 0.29
196 0.27
197 0.26
198 0.24
199 0.24
200 0.21
201 0.2
202 0.18
203 0.16
204 0.12
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.07
224 0.1
225 0.13
226 0.15
227 0.19
228 0.24
229 0.26
230 0.25
231 0.25
232 0.24
233 0.23
234 0.21
235 0.17
236 0.12
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.05
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.15
293 0.17
294 0.15
295 0.18
296 0.2
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.17
301 0.22
302 0.28
303 0.28
304 0.26
305 0.29
306 0.3
307 0.28
308 0.27
309 0.2
310 0.14
311 0.1
312 0.09
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.08
326 0.09
327 0.11
328 0.13
329 0.15
330 0.2
331 0.24
332 0.3
333 0.33
334 0.37
335 0.41
336 0.48
337 0.5
338 0.46
339 0.43
340 0.41
341 0.35
342 0.31
343 0.25
344 0.16
345 0.12
346 0.12
347 0.1
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.13
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.19
360 0.19
361 0.19
362 0.21
363 0.21
364 0.23
365 0.25
366 0.29
367 0.3
368 0.34
369 0.4
370 0.37
371 0.36
372 0.34
373 0.31
374 0.26
375 0.22
376 0.23
377 0.2
378 0.24
379 0.26
380 0.3
381 0.34
382 0.36
383 0.42
384 0.48
385 0.47
386 0.49
387 0.55
388 0.52
389 0.5
390 0.53
391 0.49
392 0.48
393 0.5
394 0.51
395 0.51
396 0.54
397 0.54
398 0.54
399 0.57
400 0.54
401 0.55
402 0.52
403 0.48
404 0.5
405 0.55
406 0.57
407 0.56