Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CAY9

Protein Details
Accession A0A550CAY9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-52EPAVPVKRGRGRPKGSKNKPKDLALBasic
161-186IHPRSPKPSHRLPRTKTRARARPETQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-66VKRGRGRPKGSKNKPKDLALDPPVKVPKKRGRPV
164-182RSPKPSHRLPRTKTRARAR
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 6.5, cyto_nucl 6.5, cyto 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MAKSSEKAAAEQKLLDATTSAAPAPEGEPAVPVKRGRGRPKGSKNKPKDLALDPPVKVPKKRGRPVRGLFMFYGFVFSVPLPLPTFSHSYPTASVFYRLPIRRLHPLMLVVRQPHFFHGPPQLWRIPDTSGAFPAPLPHSNTSAAFPITLSRPRSTVLTIIHPRSPKPSHRLPRTKTRARARPETQTRTLRHRNGGVDGLARVWSNER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.16
4 0.13
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.11
16 0.13
17 0.16
18 0.19
19 0.19
20 0.24
21 0.32
22 0.41
23 0.48
24 0.56
25 0.62
26 0.69
27 0.8
28 0.84
29 0.87
30 0.89
31 0.88
32 0.88
33 0.86
34 0.79
35 0.74
36 0.67
37 0.65
38 0.61
39 0.59
40 0.49
41 0.48
42 0.51
43 0.49
44 0.47
45 0.47
46 0.5
47 0.54
48 0.62
49 0.67
50 0.67
51 0.74
52 0.77
53 0.78
54 0.71
55 0.63
56 0.55
57 0.46
58 0.39
59 0.29
60 0.26
61 0.15
62 0.12
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.15
73 0.13
74 0.17
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.15
81 0.16
82 0.13
83 0.14
84 0.21
85 0.21
86 0.21
87 0.22
88 0.24
89 0.29
90 0.3
91 0.3
92 0.23
93 0.26
94 0.25
95 0.25
96 0.24
97 0.2
98 0.19
99 0.2
100 0.19
101 0.18
102 0.19
103 0.17
104 0.18
105 0.23
106 0.24
107 0.25
108 0.29
109 0.29
110 0.26
111 0.27
112 0.26
113 0.2
114 0.22
115 0.22
116 0.19
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.15
121 0.17
122 0.15
123 0.15
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.22
128 0.23
129 0.21
130 0.2
131 0.17
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.19
137 0.21
138 0.2
139 0.21
140 0.22
141 0.24
142 0.23
143 0.24
144 0.21
145 0.27
146 0.32
147 0.35
148 0.38
149 0.38
150 0.38
151 0.41
152 0.45
153 0.43
154 0.44
155 0.52
156 0.58
157 0.67
158 0.76
159 0.75
160 0.8
161 0.83
162 0.85
163 0.84
164 0.84
165 0.82
166 0.8
167 0.84
168 0.78
169 0.79
170 0.8
171 0.78
172 0.76
173 0.76
174 0.73
175 0.73
176 0.76
177 0.72
178 0.69
179 0.67
180 0.62
181 0.58
182 0.57
183 0.49
184 0.41
185 0.35
186 0.29
187 0.24
188 0.21