FuNGI

A0A550C9S2

Protein Details

Accession

A0A550C9S2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-128	APNTTKKKIKEKDNIGIQLK	Hydrophilic
473-513	RQTIARPKNESKEDKKARKAAVKAERQARRVEKKATKEQFD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
478-509	RPKNESKEDKKARKAAVKAERQARRVEKKATK
520-531	KRRLNGKELRTR

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSKSIYRQPGAKHFQLVHRSQRDPLIHDPDASQHVLKPFVRENEKKGKSRADLEEILTPAETDQRANVGEASLYGVYYDDTEYDYMQHLRQAGVEEEGVDTILIEAPNTTKKKIKEKDNIGIQLKDLPEGVLASTTELPRNYESQQAIPESLSGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDDDLEDDFFGELVAKGERDAAEDLGFEFAEDGIDEAAADEDEDGEEVADEELGWEERFARFKKAQTHADVDDELKSTDDFRSEGGDTVGGLPAMRRRKGTSDASGYSMSSSSLHRTDTLQTLDSQYDQVMAKEYGDEYEDEDEDAEEDDIDEVPDLILSRPDFENMMDEFLNDFELLGRKMQPKLEGDTGVEKLDTFRRALGAMREIDMQETPSNDSYNDDELSDSEEEKEDKWDCESILCETKTAVPQITIDPKTGLPVVTQPNSQTRHSKAAPPPFADDTSGSDTETEATHRQTIARPKNESKEDKKARKAAVKAERQARRVEKKATKEQFDAEMQNAKRRLNGKELRTRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.66
3	0.59
4	0.62
5	0.63
6	0.64
7	0.64
8	0.63
9	0.62
10	0.59
11	0.62
12	0.58
13	0.54
14	0.56
15	0.54
16	0.47
17	0.46
18	0.44
19	0.4
20	0.4
21	0.37
22	0.29
23	0.24
24	0.25
25	0.3
26	0.3
27	0.32
28	0.34
29	0.4
30	0.49
31	0.51
32	0.56
33	0.61
34	0.68
35	0.69
36	0.69
37	0.69
38	0.65
39	0.68
40	0.66
41	0.63
42	0.58
43	0.54
44	0.53
45	0.45
46	0.4
47	0.31
48	0.25
49	0.17
50	0.19
51	0.17
52	0.12
53	0.12
54	0.14
55	0.15
56	0.16
57	0.16
58	0.12
59	0.11
60	0.11
61	0.13
62	0.1
63	0.09
64	0.08
65	0.08
66	0.08
67	0.08
68	0.09
69	0.06
70	0.08
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.12
75	0.14
76	0.14
77	0.16
78	0.15
79	0.15
80	0.16
81	0.17
82	0.16
83	0.15
84	0.15
85	0.13
86	0.12
87	0.12
88	0.11
89	0.08
90	0.06
91	0.05
92	0.07
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.08
97	0.17
98	0.19
99	0.21
100	0.25
101	0.31
102	0.42
103	0.5
104	0.59
105	0.61
106	0.68
107	0.75
108	0.78
109	0.8
110	0.73
111	0.66
112	0.56
113	0.5
114	0.41
115	0.33
116	0.24
117	0.16
118	0.12
119	0.12
120	0.11
121	0.07
122	0.07
123	0.08
124	0.11
125	0.11
126	0.14
127	0.14
128	0.16
129	0.17
130	0.2
131	0.19
132	0.23
133	0.24
134	0.23
135	0.26
136	0.25
137	0.24
138	0.21
139	0.2
140	0.15
141	0.14
142	0.12
143	0.1
144	0.09
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.13
149	0.15
150	0.15
151	0.15
152	0.19
153	0.19
154	0.18
155	0.18
156	0.14
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.07
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.05
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.07
183	0.07
184	0.09
185	0.1
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.06
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.06
223	0.11
224	0.12
225	0.18
226	0.2
227	0.25
228	0.34
229	0.39
230	0.43
231	0.43
232	0.46
233	0.41
234	0.4
235	0.36
236	0.28
237	0.23
238	0.18
239	0.14
240	0.1
241	0.09
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.09
251	0.09
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.1
259	0.14
260	0.15
261	0.16
262	0.18
263	0.22
264	0.28
265	0.32
266	0.32
267	0.33
268	0.33
269	0.34
270	0.32
271	0.29
272	0.23
273	0.19
274	0.14
275	0.1
276	0.09
277	0.09
278	0.1
279	0.1
280	0.11
281	0.12
282	0.14
283	0.16
284	0.17
285	0.15
286	0.15
287	0.16
288	0.16
289	0.15
290	0.13
291	0.1
292	0.11
293	0.1
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.1
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.07
304	0.08
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.06
324	0.06
325	0.09
326	0.09
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.13
331	0.11
332	0.14
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.1
337	0.11
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.08
342	0.08
343	0.09
344	0.13
345	0.15
346	0.18
347	0.2
348	0.23
349	0.24
350	0.28
351	0.3
352	0.27
353	0.26
354	0.27
355	0.26
356	0.22
357	0.2
358	0.15
359	0.14
360	0.17
361	0.17
362	0.14
363	0.14
364	0.14
365	0.15
366	0.17
367	0.18
368	0.19
369	0.18
370	0.19
371	0.19
372	0.19
373	0.19
374	0.17
375	0.16
376	0.12
377	0.13
378	0.14
379	0.14
380	0.15
381	0.14
382	0.16
383	0.16
384	0.18
385	0.17
386	0.14
387	0.13
388	0.13
389	0.17
390	0.15
391	0.13
392	0.11
393	0.13
394	0.13
395	0.13
396	0.18
397	0.16
398	0.16
399	0.18
400	0.19
401	0.17
402	0.18
403	0.19
404	0.19
405	0.25
406	0.24
407	0.22
408	0.21
409	0.24
410	0.26
411	0.26
412	0.23
413	0.16
414	0.17
415	0.22
416	0.3
417	0.28
418	0.26
419	0.25
420	0.25
421	0.26
422	0.26
423	0.21
424	0.13
425	0.19
426	0.24
427	0.25
428	0.26
429	0.27
430	0.33
431	0.37
432	0.39
433	0.4
434	0.38
435	0.44
436	0.46
437	0.52
438	0.53
439	0.59
440	0.62
441	0.58
442	0.59
443	0.53
444	0.52
445	0.45
446	0.38
447	0.33
448	0.32
449	0.3
450	0.25
451	0.21
452	0.2
453	0.19
454	0.18
455	0.17
456	0.14
457	0.16
458	0.18
459	0.19
460	0.21
461	0.27
462	0.37
463	0.43
464	0.48
465	0.54
466	0.59
467	0.67
468	0.75
469	0.78
470	0.75
471	0.76
472	0.79
473	0.81
474	0.83
475	0.82
476	0.81
477	0.8
478	0.78
479	0.77
480	0.77
481	0.77
482	0.76
483	0.78
484	0.77
485	0.71
486	0.74
487	0.74
488	0.73
489	0.71
490	0.73
491	0.72
492	0.74
493	0.82
494	0.82
495	0.78
496	0.72
497	0.68
498	0.63
499	0.6
500	0.54
501	0.46
502	0.46
503	0.41
504	0.46
505	0.46
506	0.41
507	0.42
508	0.44
509	0.45
510	0.48
511	0.54
512	0.56
513	0.63

A0A550C9S2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer