Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJJ6

Protein Details
Accession C5DJJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
476-499QTSNTKLVKSSTKPRKPRKAIVEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
488-494KPRKPRK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito_nucl 11.833, mito 10.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039039  RAI1-like_fam  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
KEGG lth:KLTH0F16962g  -  
Amino Acid Sequences MPPKTKAKVLRTSPHVKATFRYEENNDASGNACLKAHKCAAFYDLLTYNDLHRSFDSYLEGNDQRPLPMICKPGESKDFGVRVIPVSNPRLTRLNLAVTQLEFMPETADVFTNRGDLVDIALSFFPHFDNNFQKIRHVAHLRHGRLFIWHDAQRDDTFGSSKARDGWYSGYKFEDMCRHVWPQNTQTWTALPETNKDNNPLISLVELPLKKDVSTVMMAEYDLRLPGAKKPNGFVELKCFLPRLGNPDSVRWQELTNAEVLDLLVNKRSFMKFFKTCLQSRFSGCENLVYGIRNKKVNLVGVRKFHISEVEQKLQELEPRFYYRHYITALTSVGEFISFLFRECVDGEFYLITKRSVHSPLSVIRTPRQELMFQTAFTPGFESLLEKHEEQRNAFLKRSRPNFFGSRSEGRKDALEYKPVIAARKGGSSSLTSASRKMRKPKVPVADVQVDKLANDLQQTSLQDRSFSDPEAESRQTSNTKLVKSSTKPRKPRKAIVEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.72
3 0.64
4 0.59
5 0.58
6 0.58
7 0.53
8 0.54
9 0.48
10 0.51
11 0.53
12 0.5
13 0.42
14 0.34
15 0.32
16 0.28
17 0.25
18 0.18
19 0.15
20 0.17
21 0.18
22 0.24
23 0.29
24 0.29
25 0.29
26 0.3
27 0.32
28 0.32
29 0.31
30 0.3
31 0.27
32 0.25
33 0.26
34 0.25
35 0.23
36 0.27
37 0.27
38 0.23
39 0.2
40 0.24
41 0.23
42 0.25
43 0.26
44 0.2
45 0.21
46 0.26
47 0.27
48 0.23
49 0.26
50 0.25
51 0.22
52 0.24
53 0.24
54 0.2
55 0.24
56 0.27
57 0.25
58 0.3
59 0.32
60 0.36
61 0.39
62 0.4
63 0.39
64 0.41
65 0.42
66 0.36
67 0.35
68 0.29
69 0.27
70 0.25
71 0.24
72 0.22
73 0.25
74 0.29
75 0.28
76 0.3
77 0.33
78 0.33
79 0.35
80 0.32
81 0.33
82 0.31
83 0.32
84 0.31
85 0.26
86 0.26
87 0.21
88 0.18
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.13
116 0.2
117 0.25
118 0.3
119 0.3
120 0.31
121 0.33
122 0.35
123 0.39
124 0.38
125 0.35
126 0.4
127 0.5
128 0.51
129 0.51
130 0.49
131 0.4
132 0.38
133 0.39
134 0.33
135 0.3
136 0.29
137 0.28
138 0.28
139 0.31
140 0.27
141 0.25
142 0.22
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.17
147 0.15
148 0.15
149 0.17
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.22
154 0.26
155 0.27
156 0.27
157 0.25
158 0.24
159 0.24
160 0.25
161 0.27
162 0.21
163 0.22
164 0.24
165 0.26
166 0.29
167 0.32
168 0.34
169 0.31
170 0.35
171 0.36
172 0.34
173 0.3
174 0.28
175 0.26
176 0.24
177 0.23
178 0.18
179 0.18
180 0.22
181 0.26
182 0.27
183 0.28
184 0.27
185 0.24
186 0.25
187 0.22
188 0.17
189 0.12
190 0.12
191 0.09
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.12
214 0.2
215 0.22
216 0.23
217 0.25
218 0.27
219 0.31
220 0.32
221 0.26
222 0.24
223 0.23
224 0.24
225 0.23
226 0.2
227 0.16
228 0.17
229 0.18
230 0.17
231 0.19
232 0.23
233 0.23
234 0.26
235 0.3
236 0.28
237 0.28
238 0.23
239 0.2
240 0.17
241 0.17
242 0.15
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.16
258 0.23
259 0.23
260 0.26
261 0.34
262 0.37
263 0.4
264 0.41
265 0.42
266 0.37
267 0.35
268 0.36
269 0.3
270 0.27
271 0.23
272 0.22
273 0.19
274 0.18
275 0.17
276 0.14
277 0.16
278 0.19
279 0.22
280 0.22
281 0.22
282 0.25
283 0.26
284 0.31
285 0.34
286 0.36
287 0.39
288 0.4
289 0.42
290 0.38
291 0.37
292 0.31
293 0.28
294 0.22
295 0.26
296 0.3
297 0.33
298 0.32
299 0.31
300 0.32
301 0.3
302 0.32
303 0.26
304 0.21
305 0.19
306 0.22
307 0.23
308 0.23
309 0.27
310 0.24
311 0.24
312 0.24
313 0.22
314 0.19
315 0.22
316 0.21
317 0.17
318 0.15
319 0.12
320 0.1
321 0.08
322 0.07
323 0.05
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.16
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.23
347 0.27
348 0.32
349 0.35
350 0.33
351 0.34
352 0.38
353 0.38
354 0.39
355 0.36
356 0.31
357 0.3
358 0.35
359 0.32
360 0.27
361 0.26
362 0.24
363 0.22
364 0.2
365 0.2
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.12
370 0.11
371 0.14
372 0.17
373 0.15
374 0.21
375 0.27
376 0.3
377 0.3
378 0.37
379 0.41
380 0.42
381 0.45
382 0.45
383 0.46
384 0.52
385 0.59
386 0.55
387 0.51
388 0.53
389 0.56
390 0.55
391 0.54
392 0.52
393 0.53
394 0.53
395 0.54
396 0.49
397 0.44
398 0.42
399 0.39
400 0.4
401 0.36
402 0.36
403 0.35
404 0.34
405 0.37
406 0.37
407 0.36
408 0.28
409 0.28
410 0.25
411 0.27
412 0.27
413 0.23
414 0.23
415 0.22
416 0.24
417 0.24
418 0.27
419 0.24
420 0.28
421 0.36
422 0.43
423 0.49
424 0.56
425 0.62
426 0.66
427 0.74
428 0.79
429 0.8
430 0.77
431 0.75
432 0.72
433 0.71
434 0.64
435 0.56
436 0.5
437 0.4
438 0.34
439 0.3
440 0.24
441 0.15
442 0.16
443 0.15
444 0.14
445 0.17
446 0.2
447 0.22
448 0.26
449 0.25
450 0.25
451 0.26
452 0.31
453 0.29
454 0.28
455 0.29
456 0.25
457 0.28
458 0.34
459 0.34
460 0.29
461 0.29
462 0.33
463 0.33
464 0.34
465 0.4
466 0.39
467 0.39
468 0.41
469 0.44
470 0.47
471 0.52
472 0.6
473 0.62
474 0.67
475 0.75
476 0.82
477 0.88
478 0.89
479 0.92