Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C5B7

Protein Details
Accession A0A550C5B7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-30SETTPPPTRKPTHTKRPAAKHARPTDSPHydrophilic
37-63YNHPQTPSAPHRRRQPPPPRRHHLASVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-50R
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041723  CCT  
IPR004821  Cyt_trans-like  
IPR045049  Pcy1-like  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
Gene Ontology GO:0004105  F:choline-phosphate cytidylyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01467  CTP_transf_like  
CDD cd02174  CCT  
Amino Acid Sequences MDSETTPPPTRKPTHTKRPAAKHARPTDSPAYDACAYNHPQTPSAPHRRRQPPPPRRHHLASVLSDSDGVESPTYDGDNHCRETTPRRTRILKCIPSSPSRPAPVHHITEPPVPAVSAAAFNPASLTAEDIQAYVQQAIDGDPVSINGEPPKPRPYRTSPPPQGRPVRIYADGVYDLFHFAHSLQLRCQNSPSPSVHLLVGVCSDALVRKYKAHTVMNHAERLEAVRHCRWVDEVVAEAPWVVDQAFLDKWRIDYVAHDEAPYPAKAEVASDDVYGFVKSQGKFLPTRRTPGVSTSELLERIVAGYRRGEFDAKLGVEFRRSDEVGGGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.8
3 0.85
4 0.85
5 0.9
6 0.91
7 0.91
8 0.89
9 0.88
10 0.87
11 0.85
12 0.77
13 0.74
14 0.72
15 0.63
16 0.56
17 0.46
18 0.42
19 0.37
20 0.36
21 0.3
22 0.27
23 0.29
24 0.31
25 0.36
26 0.32
27 0.31
28 0.31
29 0.37
30 0.42
31 0.49
32 0.52
33 0.54
34 0.63
35 0.71
36 0.78
37 0.8
38 0.82
39 0.81
40 0.85
41 0.89
42 0.87
43 0.85
44 0.83
45 0.79
46 0.76
47 0.72
48 0.66
49 0.6
50 0.52
51 0.44
52 0.38
53 0.32
54 0.24
55 0.17
56 0.13
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.1
64 0.15
65 0.19
66 0.22
67 0.22
68 0.23
69 0.25
70 0.33
71 0.42
72 0.46
73 0.49
74 0.53
75 0.61
76 0.64
77 0.72
78 0.74
79 0.71
80 0.64
81 0.64
82 0.62
83 0.59
84 0.59
85 0.55
86 0.5
87 0.47
88 0.45
89 0.4
90 0.43
91 0.43
92 0.42
93 0.38
94 0.34
95 0.32
96 0.34
97 0.34
98 0.26
99 0.21
100 0.16
101 0.14
102 0.12
103 0.1
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.08
135 0.11
136 0.12
137 0.15
138 0.24
139 0.25
140 0.27
141 0.33
142 0.39
143 0.45
144 0.51
145 0.6
146 0.6
147 0.67
148 0.71
149 0.72
150 0.7
151 0.64
152 0.59
153 0.51
154 0.46
155 0.38
156 0.33
157 0.26
158 0.21
159 0.18
160 0.15
161 0.12
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.2
173 0.22
174 0.22
175 0.24
176 0.24
177 0.24
178 0.28
179 0.28
180 0.25
181 0.25
182 0.26
183 0.24
184 0.2
185 0.18
186 0.14
187 0.13
188 0.08
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.1
195 0.11
196 0.14
197 0.16
198 0.21
199 0.26
200 0.3
201 0.31
202 0.36
203 0.44
204 0.44
205 0.45
206 0.41
207 0.35
208 0.3
209 0.3
210 0.25
211 0.19
212 0.2
213 0.2
214 0.24
215 0.24
216 0.24
217 0.24
218 0.22
219 0.21
220 0.16
221 0.16
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.1
226 0.08
227 0.07
228 0.06
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.12
241 0.14
242 0.2
243 0.25
244 0.24
245 0.24
246 0.23
247 0.24
248 0.27
249 0.24
250 0.19
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.16
266 0.16
267 0.2
268 0.22
269 0.25
270 0.31
271 0.37
272 0.45
273 0.42
274 0.49
275 0.5
276 0.51
277 0.49
278 0.49
279 0.49
280 0.41
281 0.38
282 0.34
283 0.33
284 0.3
285 0.28
286 0.22
287 0.16
288 0.14
289 0.19
290 0.17
291 0.15
292 0.19
293 0.21
294 0.24
295 0.26
296 0.27
297 0.22
298 0.24
299 0.29
300 0.25
301 0.25
302 0.25
303 0.23
304 0.26
305 0.27
306 0.28
307 0.27
308 0.27
309 0.27