FuNGI

A0A550C376

Protein Details

Accession

A0A550C376

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
223-249	DKLVYRKWRTFVKRKRKRTEVRAAGLE	Hydrophilic
639-663	NAEAPSSGVKRKRSRKEKDVDAADG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
233-240	FVKRKRKR
648-656	KRKRSRKEK

Subcellular Location(s)

cyto 12, cyto_nucl 12, nucl 10, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033315 Fan1-like IPR011856 tRNA_endonuc-like_dom_sf IPR014883 VRR_NUC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004528 F:phosphodiesterase I activity GO:0036297 P:interstrand cross-link repair
Pfam	View protein in Pfam PF08774 VRR_NUC
CDD	cd22326 FAN1-like

Amino Acid Sequences

MDLDDILNRLQTAQLKVLMKQMKAKEQVTKKEDMIKSLKRAACNQKLLNFASVFAPKSKKPTGALKTQETVLKKFALKELGTCLRVNVDFIRFVRRMHIIFYRSTELPTRLLLPALLSSFRIRSYPDIGPITRDGDIWTSRQLFLEYEDALLLQAEYEELMGGGDQTTLDTTNRFVTAGSALLRPATPAPSGTKRKRDKSVADDPPESPLSLKRANQIEEVFDKLVYRKWRTFVKRKRKRTEVRAAGLERFEAGYIYTRLVYKAAHAFGMLKMYEKELEILDALLKQRFWRRGKVADWYQRQALIQMNHLCSASEDKAERAAHKEAMRECARATLLAALDDKDVGDVYRPGLLHRLQRLEKLLKMDSSISEPLGRPKEVFVAATRIHKPVGEDGLPLSPGKENICTLTQMWRDPDVRLDEEEPPAAIRKAMGKSIWKGRDDKQVNVETVALERYESLGYKGFHAETRILTTLFALLFWDVLFARVPGVFVTEFQTAPLDLAEDTFYDARKELIEKRLAEVEAGEAKTILQRNDKFYRDTKTFCIGVSWATCSSEDLEEIVECMGGHALRHICLLFCQDYAGRCGGVPDLIVWKMTGDDRCKFVEVKGPGDRASDAQKLWFDSLLRARVPVDLCHVTDANAEAPSSGVKRKRSRKEKDVDAADGGPSTPKRRASG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.31
3	0.32
4	0.4
5	0.42
6	0.39
7	0.44
8	0.47
9	0.49
10	0.54
11	0.57
12	0.58
13	0.62
14	0.69
15	0.66
16	0.65
17	0.6
18	0.62
19	0.6
20	0.58
21	0.58
22	0.55
23	0.57
24	0.61
25	0.61
26	0.56
27	0.63
28	0.66
29	0.67
30	0.68
31	0.67
32	0.63
33	0.66
34	0.63
35	0.59
36	0.49
37	0.4
38	0.36
39	0.34
40	0.3
41	0.3
42	0.32
43	0.29
44	0.37
45	0.4
46	0.41
47	0.42
48	0.51
49	0.52
50	0.57
51	0.62
52	0.6
53	0.58
54	0.56
55	0.57
56	0.5
57	0.47
58	0.4
59	0.37
60	0.34
61	0.34
62	0.35
63	0.37
64	0.33
65	0.32
66	0.38
67	0.4
68	0.4
69	0.37
70	0.33
71	0.3
72	0.3
73	0.3
74	0.25
75	0.21
76	0.23
77	0.24
78	0.31
79	0.28
80	0.29
81	0.31
82	0.32
83	0.3
84	0.3
85	0.36
86	0.31
87	0.33
88	0.36
89	0.37
90	0.32
91	0.34
92	0.34
93	0.29
94	0.28
95	0.27
96	0.25
97	0.21
98	0.21
99	0.19
100	0.15
101	0.15
102	0.15
103	0.14
104	0.13
105	0.14
106	0.15
107	0.16
108	0.15
109	0.15
110	0.18
111	0.23
112	0.24
113	0.28
114	0.32
115	0.31
116	0.33
117	0.33
118	0.32
119	0.27
120	0.25
121	0.2
122	0.19
123	0.2
124	0.19
125	0.22
126	0.21
127	0.21
128	0.22
129	0.22
130	0.18
131	0.19
132	0.2
133	0.15
134	0.13
135	0.13
136	0.12
137	0.11
138	0.1
139	0.07
140	0.04
141	0.04
142	0.03
143	0.03
144	0.03
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.03
149	0.03
150	0.04
151	0.04
152	0.04
153	0.04
154	0.05
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.08
159	0.1
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.1
165	0.12
166	0.12
167	0.11
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.11
176	0.17
177	0.25
178	0.35
179	0.42
180	0.51
181	0.58
182	0.65
183	0.71
184	0.74
185	0.72
186	0.71
187	0.74
188	0.73
189	0.7
190	0.65
191	0.57
192	0.54
193	0.47
194	0.38
195	0.29
196	0.22
197	0.22
198	0.24
199	0.25
200	0.27
201	0.31
202	0.33
203	0.35
204	0.33
205	0.31
206	0.28
207	0.29
208	0.23
209	0.19
210	0.18
211	0.15
212	0.19
213	0.23
214	0.26
215	0.26
216	0.3
217	0.39
218	0.48
219	0.58
220	0.64
221	0.69
222	0.74
223	0.82
224	0.88
225	0.89
226	0.9
227	0.89
228	0.9
229	0.87
230	0.82
231	0.78
232	0.71
233	0.62
234	0.52
235	0.42
236	0.31
237	0.22
238	0.17
239	0.09
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.11
248	0.1
249	0.1
250	0.13
251	0.13
252	0.12
253	0.12
254	0.13
255	0.13
256	0.15
257	0.13
258	0.1
259	0.1
260	0.11
261	0.11
262	0.1
263	0.11
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.1
274	0.16
275	0.25
276	0.27
277	0.33
278	0.37
279	0.42
280	0.44
281	0.5
282	0.53
283	0.54
284	0.56
285	0.51
286	0.47
287	0.42
288	0.4
289	0.33
290	0.29
291	0.21
292	0.22
293	0.23
294	0.23
295	0.22
296	0.22
297	0.2
298	0.16
299	0.19
300	0.14
301	0.12
302	0.12
303	0.12
304	0.16
305	0.17
306	0.18
307	0.18
308	0.19
309	0.21
310	0.22
311	0.26
312	0.22
313	0.29
314	0.29
315	0.26
316	0.24
317	0.22
318	0.21
319	0.16
320	0.15
321	0.11
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.05
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.11
339	0.14
340	0.17
341	0.2
342	0.26
343	0.24
344	0.27
345	0.31
346	0.3
347	0.3
348	0.29
349	0.27
350	0.22
351	0.22
352	0.2
353	0.16
354	0.17
355	0.16
356	0.12
357	0.13
358	0.13
359	0.18
360	0.2
361	0.19
362	0.16
363	0.16
364	0.18
365	0.17
366	0.18
367	0.13
368	0.15
369	0.16
370	0.21
371	0.22
372	0.21
373	0.2
374	0.2
375	0.2
376	0.18
377	0.2
378	0.15
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.14
383	0.13
384	0.11
385	0.08
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.19
395	0.2
396	0.2
397	0.22
398	0.23
399	0.24
400	0.23
401	0.26
402	0.23
403	0.22
404	0.22
405	0.23
406	0.21
407	0.21
408	0.21
409	0.17
410	0.13
411	0.14
412	0.12
413	0.1
414	0.08
415	0.12
416	0.14
417	0.16
418	0.18
419	0.2
420	0.25
421	0.34
422	0.38
423	0.36
424	0.38
425	0.41
426	0.49
427	0.48
428	0.47
429	0.46
430	0.45
431	0.43
432	0.39
433	0.35
434	0.25
435	0.22
436	0.19
437	0.12
438	0.08
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.12
445	0.13
446	0.14
447	0.16
448	0.16
449	0.16
450	0.18
451	0.18
452	0.15
453	0.18
454	0.18
455	0.16
456	0.15
457	0.14
458	0.14
459	0.12
460	0.11
461	0.08
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.07
466	0.05
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.12
478	0.13
479	0.13
480	0.13
481	0.14
482	0.11
483	0.11
484	0.1
485	0.07
486	0.06
487	0.07
488	0.07
489	0.06
490	0.08
491	0.09
492	0.09
493	0.1
494	0.1
495	0.1
496	0.11
497	0.14
498	0.18
499	0.24
500	0.3
501	0.3
502	0.32
503	0.36
504	0.35
505	0.31
506	0.26
507	0.22
508	0.21
509	0.2
510	0.17
511	0.13
512	0.13
513	0.17
514	0.2
515	0.2
516	0.23
517	0.26
518	0.34
519	0.41
520	0.44
521	0.44
522	0.46
523	0.5
524	0.47
525	0.48
526	0.44
527	0.43
528	0.41
529	0.37
530	0.34
531	0.27
532	0.25
533	0.23
534	0.22
535	0.17
536	0.17
537	0.17
538	0.16
539	0.18
540	0.16
541	0.14
542	0.11
543	0.11
544	0.1
545	0.1
546	0.09
547	0.07
548	0.06
549	0.06
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.11
554	0.12
555	0.12
556	0.14
557	0.14
558	0.13
559	0.14
560	0.19
561	0.15
562	0.14
563	0.16
564	0.17
565	0.18
566	0.21
567	0.21
568	0.16
569	0.15
570	0.15
571	0.14
572	0.13
573	0.11
574	0.1
575	0.12
576	0.13
577	0.13
578	0.12
579	0.11
580	0.13
581	0.17
582	0.21
583	0.23
584	0.26
585	0.28
586	0.31
587	0.33
588	0.33
589	0.3
590	0.33
591	0.31
592	0.35
593	0.39
594	0.39
595	0.37
596	0.39
597	0.38
598	0.32
599	0.35
600	0.31
601	0.25
602	0.27
603	0.28
604	0.29
605	0.29
606	0.29
607	0.24
608	0.26
609	0.32
610	0.33
611	0.31
612	0.3
613	0.29
614	0.32
615	0.33
616	0.28
617	0.29
618	0.27
619	0.27
620	0.3
621	0.3
622	0.25
623	0.25
624	0.25
625	0.2
626	0.17
627	0.16
628	0.12
629	0.12
630	0.14
631	0.16
632	0.22
633	0.26
634	0.35
635	0.45
636	0.56
637	0.67
638	0.75
639	0.82
640	0.85
641	0.89
642	0.9
643	0.9
644	0.86
645	0.79
646	0.71
647	0.62
648	0.52
649	0.43
650	0.32
651	0.28
652	0.25
653	0.25
654	0.28

A0A550C376

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer