FuNGI

A0A550BWJ0

Protein Details

Accession

A0A550BWJ0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1020-1044	LVAGAGAGRRKRKRTKGPAADLSAT	Hydrophilic
1088-1116	APPAVGAGDKPKKKKRKTGEGEKGPHFRA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1026-1036	AGRRKRKRTKG
1096-1117	DKPKKKKRKTGEGEKGPHFRAP

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 8.5, extr 6, mito 5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002562 3'-5'_exonuclease_dom IPR012588 Exosome-assoc_fac_Rrp6_N IPR010997 HRDC-like_sf IPR044876 HRDC_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR045092 Rrp6-like
Gene Ontology	GO:0000176 C:nuclear exosome (RNase complex) GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF01612 DNA_pol_A_exo1 PF08066 PMC2NT

Amino Acid Sequences

MALDQLALNSTRLAAALPSDIAFHRTIDDDLGDDLDDVSDRVHTLLARLLALARPAAPADPADFKQVVDTVDWLLEGADDTLDVLTGKKKLPQIAVAPAPVPTRVMPNPHPDNRDVPFAYDDRTHPCKSSLTRLVLPAHALQPQEPVHPKHTASTAPNIAPLPTDPPSFHNVSVDMITTPDALDALLTRLRNYASLPDRELLLAIDLEHHSAHSYRGFVCLMQLTVRVRALRNDTPTEQADYLVDALVLRNYLTALNEFTTNANIIKIFHGAASDIPWLAENFNVHVVGMFDTYHAARALGALAAAEGKPPPPLSLGHLLKTYCDYDADKRLARSDWRVRPLPPPLLSYARSDTHFLPFIYDVVKGLLADAPPTLAADPHGEDGGGTAIEVLVESGDGAVDGGEEAQEGGREEAPEGALRQAPEGALRQIFEASARTCLRAPRWLTGATLPHAARALARRMNRPVLGEEGSLDHAVFLALYRWRDGAARGADEGVGTILPNSALLIIADRWRALITGLDGASRETLASTAGFTPIAGFTPTTGSLTAPTASGASSSAVSGTSDVTSTTSTAGQPTLTPLAAAAPHAALASLVAPASLPGPARVRAGEIVRVVEGAVRGWVPVTWTRLNGVAAAEVEVVNAAATKQGTLTALATMQAAALATTRAAAAGSATGGMTPTSGDNAMKDDDAMKDDGATAEASGPAPSVAASALFGGASAPAATTSALFGGAPAKGKSSLFGAGLAKAQSASSGGVLGKVQSSLFGTGPAKAQSSMFGGAPAKAQSSLFGGVLGKKSEVAASVVSDAAARTRESALGAATSASGATMSTLFGGTLRRNAASDSTLKNSTGVPFASKDASSTSAGASSTSVDPSSAFRTGPSLAAIAARVHASFGLGPIGVPTPFNSQDVKAGAFNAGSTVTPNPAATAEHAFVPAGQRSGQSRGTANSRAFTSTRKTVTGLTDADRNAFAVLEMESAEMEGVEGEDALEPRGDMNGQGEESRSRKPTKASLPSQAAPTIMDDALVAGAGAGRRKRKRTKGPAADLSATVDSTPSVGATASAVGGSTSSSTVADSATVTFDFASVPNILDAQAPPAVGAGDKPKKKKRKTGEGEKGPHFRAPAPAPAEVRGVKVNMAHTFK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.09
3	0.1
4	0.1
5	0.1
6	0.12
7	0.13
8	0.15
9	0.15
10	0.14
11	0.14
12	0.15
13	0.16
14	0.16
15	0.16
16	0.14
17	0.14
18	0.14
19	0.13
20	0.11
21	0.1
22	0.09
23	0.09
24	0.07
25	0.07
26	0.07
27	0.07
28	0.07
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.14
33	0.15
34	0.14
35	0.14
36	0.16
37	0.15
38	0.16
39	0.16
40	0.12
41	0.12
42	0.13
43	0.13
44	0.12
45	0.12
46	0.14
47	0.19
48	0.2
49	0.24
50	0.24
51	0.23
52	0.25
53	0.25
54	0.23
55	0.18
56	0.19
57	0.14
58	0.14
59	0.14
60	0.11
61	0.09
62	0.08
63	0.08
64	0.07
65	0.05
66	0.05
67	0.05
68	0.05
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.1
73	0.13
74	0.15
75	0.2
76	0.24
77	0.3
78	0.33
79	0.39
80	0.4
81	0.45
82	0.47
83	0.44
84	0.4
85	0.37
86	0.34
87	0.28
88	0.25
89	0.18
90	0.21
91	0.22
92	0.29
93	0.31
94	0.4
95	0.49
96	0.54
97	0.57
98	0.54
99	0.57
100	0.52
101	0.55
102	0.46
103	0.4
104	0.37
105	0.34
106	0.34
107	0.32
108	0.31
109	0.31
110	0.37
111	0.36
112	0.33
113	0.35
114	0.38
115	0.39
116	0.47
117	0.47
118	0.48
119	0.49
120	0.52
121	0.53
122	0.47
123	0.45
124	0.38
125	0.32
126	0.29
127	0.26
128	0.22
129	0.25
130	0.25
131	0.29
132	0.32
133	0.34
134	0.35
135	0.38
136	0.39
137	0.36
138	0.38
139	0.37
140	0.34
141	0.38
142	0.39
143	0.35
144	0.38
145	0.35
146	0.31
147	0.27
148	0.24
149	0.22
150	0.19
151	0.2
152	0.18
153	0.21
154	0.26
155	0.28
156	0.28
157	0.24
158	0.22
159	0.22
160	0.22
161	0.2
162	0.14
163	0.12
164	0.12
165	0.1
166	0.1
167	0.08
168	0.07
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.08
173	0.11
174	0.11
175	0.11
176	0.13
177	0.14
178	0.15
179	0.15
180	0.22
181	0.25
182	0.28
183	0.3
184	0.29
185	0.3
186	0.29
187	0.28
188	0.19
189	0.14
190	0.11
191	0.08
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.13
200	0.12
201	0.13
202	0.13
203	0.16
204	0.16
205	0.15
206	0.16
207	0.16
208	0.15
209	0.14
210	0.17
211	0.16
212	0.18
213	0.21
214	0.21
215	0.21
216	0.25
217	0.31
218	0.33
219	0.37
220	0.4
221	0.39
222	0.41
223	0.42
224	0.41
225	0.34
226	0.28
227	0.23
228	0.19
229	0.17
230	0.13
231	0.11
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.08
242	0.09
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.12
248	0.12
249	0.11
250	0.11
251	0.1
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.1
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.1
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.09
273	0.09
274	0.1
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.06
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.07
285	0.07
286	0.08
287	0.06
288	0.06
289	0.04
290	0.04
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.11
301	0.14
302	0.24
303	0.26
304	0.26
305	0.28
306	0.28
307	0.27
308	0.28
309	0.25
310	0.16
311	0.16
312	0.16
313	0.18
314	0.25
315	0.29
316	0.29
317	0.28
318	0.3
319	0.31
320	0.32
321	0.37
322	0.4
323	0.43
324	0.47
325	0.5
326	0.5
327	0.53
328	0.56
329	0.54
330	0.46
331	0.41
332	0.39
333	0.4
334	0.39
335	0.36
336	0.34
337	0.29
338	0.28
339	0.28
340	0.26
341	0.25
342	0.26
343	0.22
344	0.2
345	0.19
346	0.18
347	0.16
348	0.15
349	0.11
350	0.09
351	0.1
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.06
362	0.05
363	0.06
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.04
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.02
380	0.02
381	0.02
382	0.02
383	0.02
384	0.02
385	0.02
386	0.02
387	0.02
388	0.02
389	0.02
390	0.02
391	0.02
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.04
396	0.05
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.1
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.09
419	0.1
420	0.09
421	0.14
422	0.14
423	0.15
424	0.16
425	0.19
426	0.21
427	0.26
428	0.28
429	0.25
430	0.27
431	0.27
432	0.26
433	0.27
434	0.27
435	0.21
436	0.24
437	0.21
438	0.19
439	0.18
440	0.17
441	0.16
442	0.16
443	0.2
444	0.2
445	0.23
446	0.27
447	0.3
448	0.34
449	0.34
450	0.32
451	0.28
452	0.27
453	0.25
454	0.21
455	0.17
456	0.15
457	0.15
458	0.13
459	0.11
460	0.07
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.04
465	0.05
466	0.07
467	0.08
468	0.08
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.11
473	0.15
474	0.14
475	0.14
476	0.14
477	0.14
478	0.13
479	0.13
480	0.12
481	0.06
482	0.04
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.04
493	0.04
494	0.06
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.07
510	0.06
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.05
522	0.06
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.08
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.04
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.07
560	0.06
561	0.08
562	0.08
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.07
569	0.05
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.04
584	0.04
585	0.06
586	0.08
587	0.09
588	0.1
589	0.1
590	0.11
591	0.12
592	0.13
593	0.14
594	0.13
595	0.12
596	0.12
597	0.11
598	0.1
599	0.09
600	0.08
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.06
608	0.08
609	0.13
610	0.13
611	0.14
612	0.15
613	0.16
614	0.16
615	0.15
616	0.12
617	0.09
618	0.08
619	0.08
620	0.07
621	0.06
622	0.05
623	0.05
624	0.04
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.05
641	0.05
642	0.04
643	0.04
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.03
649	0.03
650	0.03
651	0.03
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.05
666	0.05
667	0.06
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.08
674	0.1
675	0.11
676	0.09
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.08
681	0.07
682	0.05
683	0.05
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.03
694	0.04
695	0.04
696	0.04
697	0.04
698	0.04
699	0.03
700	0.03
701	0.03
702	0.03
703	0.03
704	0.03
705	0.03
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.05
714	0.06
715	0.08
716	0.08
717	0.09
718	0.11
719	0.11
720	0.11
721	0.12
722	0.13
723	0.11
724	0.14
725	0.13
726	0.13
727	0.14
728	0.14
729	0.12
730	0.1
731	0.09
732	0.07
733	0.07
734	0.07
735	0.05
736	0.07
737	0.06
738	0.07
739	0.07
740	0.08
741	0.07
742	0.07
743	0.07
744	0.06
745	0.07
746	0.08
747	0.08
748	0.11
749	0.11
750	0.12
751	0.14
752	0.15
753	0.14
754	0.13
755	0.13
756	0.11
757	0.13
758	0.14
759	0.12
760	0.13
761	0.12
762	0.12
763	0.14
764	0.13
765	0.11
766	0.1
767	0.1
768	0.09
769	0.11
770	0.12
771	0.1
772	0.1
773	0.1
774	0.12
775	0.14
776	0.14
777	0.12
778	0.11
779	0.11
780	0.1
781	0.1
782	0.1
783	0.08
784	0.08
785	0.09
786	0.08
787	0.08
788	0.08
789	0.07
790	0.07
791	0.08
792	0.07
793	0.08
794	0.09
795	0.1
796	0.1
797	0.11
798	0.1
799	0.09
800	0.09
801	0.07
802	0.06
803	0.06
804	0.05
805	0.04
806	0.04
807	0.03
808	0.04
809	0.04
810	0.04
811	0.04
812	0.05
813	0.05
814	0.06
815	0.08
816	0.09
817	0.12
818	0.14
819	0.14
820	0.14
821	0.16
822	0.17
823	0.17
824	0.21
825	0.2
826	0.23
827	0.24
828	0.24
829	0.24
830	0.23
831	0.22
832	0.2
833	0.17
834	0.15
835	0.15
836	0.16
837	0.18
838	0.16
839	0.15
840	0.15
841	0.17
842	0.16
843	0.15
844	0.14
845	0.13
846	0.13
847	0.13
848	0.11
849	0.11
850	0.1
851	0.11
852	0.1
853	0.09
854	0.1
855	0.12
856	0.15
857	0.14
858	0.13
859	0.13
860	0.15
861	0.16
862	0.16
863	0.15
864	0.11
865	0.1
866	0.11
867	0.12
868	0.09
869	0.09
870	0.09
871	0.08
872	0.08
873	0.08
874	0.08
875	0.07
876	0.07
877	0.07
878	0.06
879	0.06
880	0.07
881	0.09
882	0.08
883	0.08
884	0.1
885	0.14
886	0.16
887	0.18
888	0.19
889	0.18
890	0.22
891	0.24
892	0.23
893	0.18
894	0.18
895	0.17
896	0.15
897	0.14
898	0.11
899	0.09
900	0.08
901	0.09
902	0.09
903	0.1
904	0.11
905	0.11
906	0.11
907	0.11
908	0.12
909	0.12
910	0.15
911	0.14
912	0.14
913	0.15
914	0.14
915	0.14
916	0.16
917	0.15
918	0.13
919	0.13
920	0.14
921	0.17
922	0.22
923	0.24
924	0.23
925	0.24
926	0.27
927	0.32
928	0.36
929	0.34
930	0.32
931	0.3
932	0.32
933	0.3
934	0.3
935	0.31
936	0.33
937	0.34
938	0.33
939	0.33
940	0.33
941	0.36
942	0.37
943	0.33
944	0.28
945	0.3
946	0.29
947	0.29
948	0.25
949	0.22
950	0.17
951	0.14
952	0.12
953	0.08
954	0.08
955	0.07
956	0.07
957	0.07
958	0.06
959	0.06
960	0.06
961	0.05
962	0.04
963	0.04
964	0.04
965	0.03
966	0.03
967	0.04
968	0.06
969	0.06
970	0.07
971	0.07
972	0.07
973	0.07
974	0.08
975	0.08
976	0.07
977	0.09
978	0.11
979	0.12
980	0.13
981	0.14
982	0.19
983	0.21
984	0.27
985	0.3
986	0.32
987	0.35
988	0.4
989	0.47
990	0.53
991	0.6
992	0.61
993	0.64
994	0.67
995	0.66
996	0.63
997	0.55
998	0.45
999	0.36
1000	0.31
1001	0.25
1002	0.17
1003	0.14
1004	0.11
1005	0.1
1006	0.1
1007	0.09
1008	0.07
1009	0.03
1010	0.05
1011	0.06
1012	0.11
1013	0.16
1014	0.26
1015	0.34
1016	0.44
1017	0.55
1018	0.64
1019	0.74
1020	0.81
1021	0.88
1022	0.89
1023	0.91
1024	0.91
1025	0.87
1026	0.78
1027	0.68
1028	0.6
1029	0.49
1030	0.38
1031	0.28
1032	0.19
1033	0.13
1034	0.11
1035	0.1
1036	0.06
1037	0.06
1038	0.05
1039	0.06
1040	0.06
1041	0.07
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.06
1045	0.05
1046	0.05
1047	0.06
1048	0.06
1049	0.06
1050	0.07
1051	0.07
1052	0.07
1053	0.08
1054	0.08
1055	0.08
1056	0.08
1057	0.08
1058	0.1
1059	0.1
1060	0.1
1061	0.09
1062	0.09
1063	0.09
1064	0.09
1065	0.11
1066	0.1
1067	0.1
1068	0.1
1069	0.11
1070	0.11
1071	0.12
1072	0.12
1073	0.13
1074	0.13
1075	0.13
1076	0.12
1077	0.12
1078	0.12
1079	0.1
1080	0.12
1081	0.19
1082	0.27
1083	0.35
1084	0.45
1085	0.55
1086	0.65
1087	0.75
1088	0.83
1089	0.84
1090	0.86
1091	0.9
1092	0.92
1093	0.93
1094	0.93
1095	0.92
1096	0.9
1097	0.86
1098	0.77
1099	0.69
1100	0.6
1101	0.51
1102	0.48
1103	0.44
1104	0.43
1105	0.4
1106	0.42
1107	0.41
1108	0.41
1109	0.44
1110	0.37
1111	0.36
1112	0.31
1113	0.28
1114	0.25
1115	0.26
1116	0.29

A0A550BWJ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer