FuNGI

A0A550CLV4

Protein Details

Accession

A0A550CLV4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
592-616	RDTWTELRRTRKRAKKSKGNPAAFQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
599-610	RRTRKRAKKSKG

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 9, mito 8, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MDIFMRNINFFTTQYELTQCLAEILHSDPYNHMSGLPLNFAVRLFKDKRGTRPHGGIGIMTLPSVEIGQRFLHEYGEVPGRAPLKTCYPARSAGRAVMFKISDRAPIASVVEDIRRLPYQDPRAVQQQNERTTFLQRNQVAVSAVQFGWDCTDAAFSIEWETTFEGGDAYLMFDDERREMRIKIRHPSSTGRLLAIAIRFSQIVAISAPRHSESRAITATLSLPPSFESEVSNSDDPRIRLHCLPFGDHERVVAYTSLALRIVLSSQEYMRRFHELASVAELHHLDEYDYPAVRRGVFSLTHMDKLAAWQKRIPWPIAFQIESLLRCLNLDPTEILSFIPTIHAIYKASGTQYCALFLKYFQGRLDAWCAYEDENSENIQQCFDNAMREFAKQNSVEVIKPTDGSVFDSLHVIVTPTTMYLEGPFPERSNRIIRGYDAKHHDCFLRVSFVEEGRLQYRFDREVDGRAFIRDRIGTLLKQGLVIGGREFEFLAYSQSALKEHAVWFVRPFRPDGQRTKVTAATIISGIGNFENSNDRFCPARYAARLSQAFTATDASVFVEPDEIFPLDDISTRDGAYHFTDGVGTMSREMARDTWTELRRTRKRAKKSKGNPAAFQIRFMGSKGMLSVDYKLSGRAVCLRPSMIKFEAPDSSNLEIARAFDRPGKYYLNRPLIMLLEAIGVPYETFLKYQNIAVADAHRATESLEHAARMLESFGLGTSYRLTSVMLSLHRLGIDCLPGDKFYDRMLEFAINHVLRVLKNHARIPVPNAYTLVGVADVHKELKEGEVFACVKPHDSNKPIYLEGDVLISRSPTIHPGDVQVARAIGRPREGSCFAKEPLFNTVVFSVRGTFYEDYVSLKEVGERPLPSMLGGGDLDGDVYNVIPLGTHPEFRPKKTYPAAEYAAAPRRILDRPANMNDVADFVLDFISFDVGMHPSSLVQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.24
3	0.24
4	0.23
5	0.23
6	0.19
7	0.16
8	0.14
9	0.12
10	0.12
11	0.12
12	0.17
13	0.17
14	0.18
15	0.19
16	0.23
17	0.24
18	0.23
19	0.2
20	0.16
21	0.2
22	0.21
23	0.22
24	0.19
25	0.18
26	0.18
27	0.19
28	0.2
29	0.18
30	0.25
31	0.26
32	0.33
33	0.42
34	0.48
35	0.57
36	0.64
37	0.7
38	0.69
39	0.73
40	0.7
41	0.65
42	0.59
43	0.49
44	0.41
45	0.35
46	0.27
47	0.2
48	0.14
49	0.1
50	0.09
51	0.09
52	0.09
53	0.07
54	0.09
55	0.1
56	0.12
57	0.16
58	0.16
59	0.16
60	0.15
61	0.16
62	0.18
63	0.23
64	0.22
65	0.19
66	0.23
67	0.23
68	0.23
69	0.24
70	0.23
71	0.24
72	0.31
73	0.34
74	0.35
75	0.37
76	0.44
77	0.47
78	0.5
79	0.46
80	0.44
81	0.46
82	0.44
83	0.42
84	0.4
85	0.36
86	0.3
87	0.32
88	0.27
89	0.25
90	0.25
91	0.25
92	0.2
93	0.21
94	0.21
95	0.18
96	0.18
97	0.16
98	0.16
99	0.16
100	0.15
101	0.18
102	0.18
103	0.19
104	0.21
105	0.28
106	0.35
107	0.4
108	0.42
109	0.43
110	0.51
111	0.52
112	0.53
113	0.53
114	0.54
115	0.55
116	0.55
117	0.53
118	0.45
119	0.5
120	0.52
121	0.47
122	0.48
123	0.42
124	0.42
125	0.4
126	0.4
127	0.34
128	0.28
129	0.24
130	0.19
131	0.17
132	0.15
133	0.14
134	0.12
135	0.14
136	0.14
137	0.13
138	0.09
139	0.1
140	0.09
141	0.11
142	0.1
143	0.08
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.11
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.06
161	0.08
162	0.1
163	0.12
164	0.15
165	0.18
166	0.2
167	0.28
168	0.35
169	0.39
170	0.47
171	0.52
172	0.52
173	0.54
174	0.59
175	0.57
176	0.57
177	0.52
178	0.43
179	0.37
180	0.33
181	0.32
182	0.27
183	0.22
184	0.14
185	0.13
186	0.12
187	0.12
188	0.12
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.11
193	0.11
194	0.12
195	0.14
196	0.15
197	0.15
198	0.15
199	0.19
200	0.19
201	0.23
202	0.24
203	0.23
204	0.21
205	0.22
206	0.22
207	0.2
208	0.2
209	0.14
210	0.13
211	0.13
212	0.15
213	0.15
214	0.14
215	0.13
216	0.13
217	0.16
218	0.2
219	0.21
220	0.19
221	0.21
222	0.25
223	0.23
224	0.26
225	0.26
226	0.25
227	0.28
228	0.31
229	0.32
230	0.3
231	0.32
232	0.32
233	0.35
234	0.35
235	0.3
236	0.28
237	0.24
238	0.23
239	0.22
240	0.17
241	0.12
242	0.1
243	0.1
244	0.11
245	0.1
246	0.09
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.16
255	0.17
256	0.19
257	0.2
258	0.25
259	0.24
260	0.23
261	0.27
262	0.23
263	0.22
264	0.24
265	0.23
266	0.18
267	0.19
268	0.18
269	0.14
270	0.12
271	0.11
272	0.08
273	0.08
274	0.11
275	0.11
276	0.12
277	0.11
278	0.14
279	0.15
280	0.15
281	0.14
282	0.13
283	0.14
284	0.14
285	0.15
286	0.2
287	0.21
288	0.22
289	0.22
290	0.21
291	0.18
292	0.22
293	0.28
294	0.23
295	0.23
296	0.24
297	0.28
298	0.36
299	0.39
300	0.37
301	0.32
302	0.31
303	0.36
304	0.37
305	0.33
306	0.26
307	0.25
308	0.25
309	0.23
310	0.22
311	0.16
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.12
316	0.1
317	0.11
318	0.1
319	0.12
320	0.13
321	0.13
322	0.12
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.11
336	0.11
337	0.12
338	0.14
339	0.14
340	0.15
341	0.14
342	0.14
343	0.13
344	0.13
345	0.17
346	0.15
347	0.17
348	0.15
349	0.18
350	0.17
351	0.18
352	0.22
353	0.17
354	0.16
355	0.15
356	0.15
357	0.13
358	0.14
359	0.13
360	0.11
361	0.11
362	0.12
363	0.13
364	0.15
365	0.14
366	0.14
367	0.13
368	0.12
369	0.13
370	0.13
371	0.14
372	0.12
373	0.15
374	0.15
375	0.16
376	0.18
377	0.16
378	0.21
379	0.17
380	0.17
381	0.17
382	0.18
383	0.18
384	0.17
385	0.18
386	0.14
387	0.14
388	0.14
389	0.11
390	0.1
391	0.12
392	0.12
393	0.11
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.09
399	0.07
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.09
411	0.1
412	0.1
413	0.13
414	0.14
415	0.16
416	0.2
417	0.23
418	0.23
419	0.23
420	0.24
421	0.3
422	0.3
423	0.33
424	0.35
425	0.35
426	0.33
427	0.33
428	0.32
429	0.26
430	0.26
431	0.2
432	0.17
433	0.14
434	0.15
435	0.16
436	0.15
437	0.16
438	0.15
439	0.15
440	0.13
441	0.14
442	0.12
443	0.12
444	0.15
445	0.14
446	0.14
447	0.16
448	0.16
449	0.2
450	0.2
451	0.21
452	0.19
453	0.18
454	0.18
455	0.15
456	0.16
457	0.11
458	0.1
459	0.11
460	0.13
461	0.12
462	0.12
463	0.14
464	0.12
465	0.12
466	0.12
467	0.09
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.07
482	0.07
483	0.08
484	0.08
485	0.09
486	0.09
487	0.09
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.16
492	0.23
493	0.25
494	0.24
495	0.26
496	0.26
497	0.32
498	0.37
499	0.41
500	0.41
501	0.44
502	0.45
503	0.46
504	0.42
505	0.35
506	0.31
507	0.25
508	0.19
509	0.14
510	0.12
511	0.09
512	0.07
513	0.07
514	0.05
515	0.05
516	0.04
517	0.05
518	0.1
519	0.1
520	0.12
521	0.12
522	0.13
523	0.14
524	0.14
525	0.19
526	0.16
527	0.21
528	0.21
529	0.26
530	0.27
531	0.34
532	0.35
533	0.31
534	0.31
535	0.27
536	0.25
537	0.2
538	0.19
539	0.12
540	0.11
541	0.1
542	0.08
543	0.08
544	0.07
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.09
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.08
554	0.06
555	0.08
556	0.08
557	0.09
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.11
563	0.12
564	0.12
565	0.1
566	0.09
567	0.09
568	0.09
569	0.09
570	0.09
571	0.07
572	0.06
573	0.07
574	0.08
575	0.08
576	0.09
577	0.09
578	0.1
579	0.1
580	0.14
581	0.2
582	0.23
583	0.27
584	0.31
585	0.41
586	0.46
587	0.54
588	0.61
589	0.62
590	0.71
591	0.77
592	0.83
593	0.84
594	0.86
595	0.89
596	0.89
597	0.85
598	0.76
599	0.72
600	0.71
601	0.6
602	0.52
603	0.42
604	0.33
605	0.28
606	0.27
607	0.22
608	0.12
609	0.12
610	0.11
611	0.1
612	0.09
613	0.09
614	0.11
615	0.1
616	0.11
617	0.11
618	0.11
619	0.12
620	0.11
621	0.12
622	0.18
623	0.2
624	0.2
625	0.22
626	0.23
627	0.25
628	0.27
629	0.31
630	0.24
631	0.24
632	0.22
633	0.24
634	0.26
635	0.23
636	0.24
637	0.23
638	0.22
639	0.22
640	0.21
641	0.19
642	0.15
643	0.15
644	0.15
645	0.12
646	0.12
647	0.15
648	0.17
649	0.19
650	0.22
651	0.26
652	0.26
653	0.34
654	0.42
655	0.45
656	0.43
657	0.41
658	0.4
659	0.35
660	0.33
661	0.25
662	0.16
663	0.09
664	0.09
665	0.08
666	0.06
667	0.05
668	0.04
669	0.05
670	0.06
671	0.05
672	0.06
673	0.09
674	0.11
675	0.12
676	0.13
677	0.16
678	0.15
679	0.16
680	0.16
681	0.16
682	0.16
683	0.16
684	0.15
685	0.12
686	0.11
687	0.11
688	0.12
689	0.12
690	0.14
691	0.14
692	0.13
693	0.14
694	0.14
695	0.14
696	0.12
697	0.11
698	0.06
699	0.06
700	0.06
701	0.05
702	0.06
703	0.06
704	0.07
705	0.08
706	0.08
707	0.09
708	0.09
709	0.09
710	0.08
711	0.1
712	0.13
713	0.12
714	0.15
715	0.15
716	0.16
717	0.16
718	0.16
719	0.16
720	0.13
721	0.14
722	0.12
723	0.12
724	0.12
725	0.12
726	0.15
727	0.14
728	0.14
729	0.13
730	0.19
731	0.18
732	0.18
733	0.2
734	0.2
735	0.19
736	0.21
737	0.27
738	0.2
739	0.2
740	0.2
741	0.2
742	0.18
743	0.21
744	0.26
745	0.25
746	0.3
747	0.34
748	0.38
749	0.39
750	0.41
751	0.43
752	0.44
753	0.4
754	0.36
755	0.34
756	0.3
757	0.27
758	0.24
759	0.19
760	0.1
761	0.09
762	0.08
763	0.09
764	0.09
765	0.1
766	0.1
767	0.1
768	0.1
769	0.13
770	0.13
771	0.13
772	0.12
773	0.17
774	0.19
775	0.19
776	0.22
777	0.19
778	0.21
779	0.23
780	0.29
781	0.31
782	0.34
783	0.39
784	0.4
785	0.44
786	0.42
787	0.39
788	0.35
789	0.27
790	0.23
791	0.2
792	0.16
793	0.12
794	0.12
795	0.11
796	0.1
797	0.1
798	0.1
799	0.12
800	0.16
801	0.18
802	0.18
803	0.21
804	0.28
805	0.28
806	0.29
807	0.25
808	0.22
809	0.21
810	0.24
811	0.25
812	0.2
813	0.23
814	0.25
815	0.26
816	0.32
817	0.36
818	0.35
819	0.37
820	0.39
821	0.37
822	0.4
823	0.39
824	0.34
825	0.36
826	0.33
827	0.28
828	0.26
829	0.26
830	0.23
831	0.22
832	0.21
833	0.17
834	0.16
835	0.17
836	0.19
837	0.18
838	0.17
839	0.19
840	0.19
841	0.19
842	0.2
843	0.21
844	0.17
845	0.16
846	0.21
847	0.2
848	0.24
849	0.26
850	0.26
851	0.26
852	0.28
853	0.28
854	0.23
855	0.21
856	0.17
857	0.14
858	0.13
859	0.11
860	0.09
861	0.08
862	0.09
863	0.07
864	0.08
865	0.05
866	0.05
867	0.05
868	0.05
869	0.05
870	0.04
871	0.04
872	0.13
873	0.14
874	0.17
875	0.19
876	0.3
877	0.35
878	0.4
879	0.48
880	0.44
881	0.52
882	0.58
883	0.65
884	0.6
885	0.62
886	0.62
887	0.55
888	0.55
889	0.53
890	0.53
891	0.46
892	0.4
893	0.34
894	0.35
895	0.36
896	0.39
897	0.39
898	0.38
899	0.45
900	0.5
901	0.53
902	0.49
903	0.46
904	0.4
905	0.35
906	0.26
907	0.18
908	0.13
909	0.09
910	0.09
911	0.08
912	0.08
913	0.06
914	0.07
915	0.07
916	0.07
917	0.08
918	0.09
919	0.1
920	0.1

A0A550CLV4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer