FuNGI

A0A550CKU5

Protein Details

Accession

A0A550CKU5

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
45-66	LAMPKPNPSKKPPSVQRRDLFA	Hydrophilic
213-242	PPTSNPFGKKKPQPKPVRRAQRQSPSPPPQ	Hydrophilic
261-283	EEEQMSRKKPVRKRNSNRITSPE	Hydrophilic
364-384	QLPPKNKAKPVRKPQPPPFSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
174-234	RRSPPRQQRVPSPPPPITSKPSRNLFAKSKTASKGQPAAPPTSNPFGKKKPQPKPVRRAQR
267-275	RKKPVRKRN
358-377	GKGKAVQLPPKNKAKPVRKP
471-487	KKSRPAPRPANARGRKA

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MNRLPSLSRIDDKSHSDVFKMSSRTVINGDAGKRRGEGRDGCEDLAMPKPNPSKKPPSVQRRDLFALSDSDDELTHPFGADISANRIQRSPSRSQASKPARADVDPARQQKQINIYKTLSFKKMSKSSDATAESRASTSKAPVEQIDLTKPDSTSKRPSSPSRLPLKHQSVNARRSPPRQQRVPSPPPPITSKPSRNLFAKSKTASKGQPAAPPTSNPFGKKKPQPKPVRRAQRQSPSPPPQAEPIEIDDDDGGDSDNDEEEEQMSRKKPVRKRNSNRITSPEPAPFPMPLTPRKKPRAQAFPMSNDSPLSSPPRRGPDAFPMQSPLSSQTRPVEEEEGSNEAACPSTVKTRLSLDKGKGKAVQLPPKNKAKPVRKPQPPPFSQFVPSLFDSPTSGNKRFSDDGLSEGERNAKRPRSESPTSTYELMDDDDPDLQLGQASADARDLCPYCDELLPPSPTPILQRLLDEVAKKSRPAPRPANARGRKAQLRHFAPVCQRHRFEREVLPEAESKGWPKKIDWGALPARVRRFSDELHGLLDDELDHAGCIFWKELAQEIKEKGSRAATGVSAQFENFEKVQIGYYGEQGAAIITQTLYSMFPMDIIDPDKVAPIGPGEFLQRVLLPEAGLRLIEEDRGLGQADALRTLRESAKYGVAMFPDDAGVAGGKASVAPEWQTGCQGARGPPATANRGGRARGGEAGRCGNSRAPSAEAQADT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.45
3	0.4
4	0.39
5	0.38
6	0.39
7	0.38
8	0.33
9	0.32
10	0.32
11	0.34
12	0.33
13	0.32
14	0.29
15	0.3
16	0.34
17	0.36
18	0.37
19	0.36
20	0.35
21	0.36
22	0.36
23	0.39
24	0.4
25	0.38
26	0.46
27	0.47
28	0.46
29	0.42
30	0.39
31	0.33
32	0.34
33	0.33
34	0.24
35	0.29
36	0.37
37	0.44
38	0.5
39	0.57
40	0.6
41	0.64
42	0.74
43	0.77
44	0.8
45	0.82
46	0.86
47	0.83
48	0.8
49	0.77
50	0.67
51	0.59
52	0.5
53	0.42
54	0.34
55	0.3
56	0.23
57	0.18
58	0.17
59	0.15
60	0.15
61	0.13
62	0.11
63	0.1
64	0.1
65	0.09
66	0.1
67	0.11
68	0.11
69	0.16
70	0.22
71	0.23
72	0.24
73	0.26
74	0.28
75	0.33
76	0.39
77	0.39
78	0.42
79	0.49
80	0.51
81	0.53
82	0.61
83	0.63
84	0.66
85	0.61
86	0.58
87	0.52
88	0.5
89	0.52
90	0.48
91	0.49
92	0.49
93	0.52
94	0.49
95	0.5
96	0.5
97	0.5
98	0.53
99	0.51
100	0.47
101	0.48
102	0.47
103	0.48
104	0.54
105	0.54
106	0.48
107	0.44
108	0.43
109	0.46
110	0.51
111	0.5
112	0.51
113	0.5
114	0.48
115	0.52
116	0.52
117	0.45
118	0.4
119	0.38
120	0.32
121	0.28
122	0.26
123	0.2
124	0.17
125	0.19
126	0.2
127	0.2
128	0.22
129	0.21
130	0.25
131	0.26
132	0.28
133	0.28
134	0.26
135	0.26
136	0.25
137	0.25
138	0.27
139	0.28
140	0.31
141	0.37
142	0.42
143	0.47
144	0.51
145	0.58
146	0.61
147	0.66
148	0.7
149	0.71
150	0.69
151	0.67
152	0.71
153	0.72
154	0.68
155	0.64
156	0.66
157	0.64
158	0.67
159	0.68
160	0.67
161	0.64
162	0.65
163	0.71
164	0.71
165	0.71
166	0.72
167	0.7
168	0.72
169	0.77
170	0.8
171	0.77
172	0.74
173	0.68
174	0.63
175	0.65
176	0.59
177	0.55
178	0.55
179	0.55
180	0.55
181	0.57
182	0.59
183	0.56
184	0.57
185	0.58
186	0.55
187	0.55
188	0.5
189	0.51
190	0.48
191	0.5
192	0.46
193	0.45
194	0.46
195	0.42
196	0.44
197	0.4
198	0.43
199	0.39
200	0.38
201	0.36
202	0.36
203	0.35
204	0.34
205	0.37
206	0.38
207	0.46
208	0.53
209	0.6
210	0.63
211	0.71
212	0.78
213	0.83
214	0.86
215	0.87
216	0.89
217	0.88
218	0.87
219	0.86
220	0.85
221	0.83
222	0.81
223	0.81
224	0.78
225	0.75
226	0.68
227	0.61
228	0.56
229	0.49
230	0.43
231	0.34
232	0.29
233	0.26
234	0.23
235	0.22
236	0.16
237	0.14
238	0.12
239	0.1
240	0.08
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.07
250	0.08
251	0.11
252	0.12
253	0.17
254	0.23
255	0.32
256	0.39
257	0.48
258	0.59
259	0.67
260	0.76
261	0.82
262	0.86
263	0.85
264	0.82
265	0.78
266	0.72
267	0.64
268	0.57
269	0.5
270	0.41
271	0.34
272	0.32
273	0.25
274	0.21
275	0.22
276	0.22
277	0.26
278	0.32
279	0.37
280	0.45
281	0.51
282	0.55
283	0.58
284	0.64
285	0.66
286	0.64
287	0.66
288	0.62
289	0.61
290	0.6
291	0.53
292	0.45
293	0.34
294	0.3
295	0.22
296	0.19
297	0.2
298	0.17
299	0.2
300	0.23
301	0.28
302	0.31
303	0.32
304	0.33
305	0.35
306	0.42
307	0.4
308	0.36
309	0.35
310	0.32
311	0.3
312	0.27
313	0.23
314	0.17
315	0.16
316	0.18
317	0.17
318	0.18
319	0.2
320	0.21
321	0.19
322	0.16
323	0.16
324	0.16
325	0.15
326	0.14
327	0.12
328	0.11
329	0.08
330	0.08
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.09
335	0.12
336	0.12
337	0.14
338	0.17
339	0.21
340	0.26
341	0.3
342	0.3
343	0.35
344	0.36
345	0.36
346	0.35
347	0.32
348	0.34
349	0.36
350	0.4
351	0.39
352	0.45
353	0.48
354	0.54
355	0.55
356	0.54
357	0.57
358	0.58
359	0.62
360	0.66
361	0.71
362	0.71
363	0.79
364	0.84
365	0.85
366	0.78
367	0.73
368	0.66
369	0.58
370	0.52
371	0.44
372	0.36
373	0.29
374	0.27
375	0.23
376	0.19
377	0.17
378	0.15
379	0.15
380	0.21
381	0.22
382	0.24
383	0.25
384	0.26
385	0.3
386	0.3
387	0.29
388	0.26
389	0.2
390	0.2
391	0.2
392	0.2
393	0.16
394	0.15
395	0.22
396	0.18
397	0.21
398	0.25
399	0.27
400	0.28
401	0.3
402	0.36
403	0.37
404	0.42
405	0.42
406	0.42
407	0.41
408	0.41
409	0.39
410	0.33
411	0.25
412	0.21
413	0.19
414	0.14
415	0.1
416	0.09
417	0.08
418	0.08
419	0.07
420	0.07
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.11
432	0.11
433	0.1
434	0.11
435	0.12
436	0.12
437	0.13
438	0.13
439	0.13
440	0.17
441	0.2
442	0.19
443	0.19
444	0.18
445	0.17
446	0.2
447	0.2
448	0.19
449	0.16
450	0.17
451	0.18
452	0.2
453	0.22
454	0.21
455	0.2
456	0.23
457	0.23
458	0.23
459	0.27
460	0.33
461	0.37
462	0.44
463	0.5
464	0.51
465	0.6
466	0.67
467	0.73
468	0.71
469	0.71
470	0.68
471	0.67
472	0.66
473	0.61
474	0.61
475	0.59
476	0.57
477	0.57
478	0.53
479	0.51
480	0.52
481	0.57
482	0.55
483	0.54
484	0.52
485	0.51
486	0.55
487	0.53
488	0.5
489	0.48
490	0.48
491	0.46
492	0.44
493	0.41
494	0.37
495	0.35
496	0.33
497	0.26
498	0.24
499	0.24
500	0.27
501	0.26
502	0.25
503	0.32
504	0.35
505	0.39
506	0.36
507	0.37
508	0.37
509	0.42
510	0.45
511	0.41
512	0.41
513	0.4
514	0.4
515	0.37
516	0.36
517	0.31
518	0.35
519	0.35
520	0.31
521	0.28
522	0.27
523	0.23
524	0.2
525	0.18
526	0.11
527	0.08
528	0.07
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.08
539	0.13
540	0.17
541	0.19
542	0.22
543	0.24
544	0.3
545	0.31
546	0.32
547	0.29
548	0.28
549	0.27
550	0.23
551	0.23
552	0.18
553	0.19
554	0.2
555	0.19
556	0.17
557	0.16
558	0.16
559	0.16
560	0.18
561	0.15
562	0.14
563	0.13
564	0.13
565	0.14
566	0.14
567	0.15
568	0.13
569	0.14
570	0.14
571	0.13
572	0.12
573	0.11
574	0.1
575	0.07
576	0.06
577	0.05
578	0.04
579	0.04
580	0.05
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.08
588	0.09
589	0.1
590	0.12
591	0.12
592	0.12
593	0.12
594	0.12
595	0.12
596	0.11
597	0.1
598	0.09
599	0.1
600	0.1
601	0.11
602	0.13
603	0.13
604	0.14
605	0.14
606	0.13
607	0.14
608	0.15
609	0.15
610	0.12
611	0.12
612	0.13
613	0.12
614	0.11
615	0.1
616	0.1
617	0.1
618	0.11
619	0.1
620	0.09
621	0.09
622	0.1
623	0.11
624	0.09
625	0.09
626	0.12
627	0.12
628	0.15
629	0.15
630	0.14
631	0.14
632	0.18
633	0.2
634	0.2
635	0.23
636	0.22
637	0.26
638	0.26
639	0.27
640	0.26
641	0.23
642	0.23
643	0.2
644	0.18
645	0.13
646	0.12
647	0.11
648	0.09
649	0.08
650	0.06
651	0.06
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.06
656	0.06
657	0.07
658	0.09
659	0.12
660	0.15
661	0.16
662	0.18
663	0.19
664	0.2
665	0.22
666	0.24
667	0.24
668	0.29
669	0.31
670	0.3
671	0.34
672	0.39
673	0.41
674	0.44
675	0.44
676	0.43
677	0.46
678	0.45
679	0.44
680	0.41
681	0.38
682	0.38
683	0.38
684	0.35
685	0.35
686	0.4
687	0.39
688	0.37
689	0.37
690	0.36
691	0.35
692	0.35
693	0.33
694	0.31
695	0.31
696	0.34

A0A550CKU5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer