Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C0T1

Protein Details
Accession A0A550C0T1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-336LRSATIFKSKSRRRRCDQCGVVVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-228RKRR
272-302HRRLSKVALKRRIPARLTHGSAARRFVAKRT
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12, cyto 2.5, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
Amino Acid Sequences MARRSKHKRPRFAYITTHGLTTPAYRDLLSAELWYIVFSYCLPATLFAVRDTCRMFRDIVDRDSGVLLARAPLLLPFAPPDPRRYMQLIGNPLTFRAMRDFFGIGKPRTRGLYGSATYTRLLFQPGKCSVCKQTTEGPPMSLYSKVYLCSARCKQNFFWSQVHFLKPHRRYLPGRALCDRHIVPWLPHLTYTSGRRRTVVLIRDLKKARREYIRETVSPHAPEERKRRKEALFKQYSHRCHLRKALLTFQCYVDDWIRETGIVEKNISRANHRRLSKVALKRRIPARLTHGSAARRFVAKRTKNLQHIALTRLRSATIFKSKSRRRRCDQCGVVVGALRLDAHVAQHHADQLLGSRLNADTGTPEYSCTLCESEPVKWLSKSSLQAHRYHKHGIRIPKLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.72
3 0.62
4 0.56
5 0.45
6 0.39
7 0.33
8 0.26
9 0.23
10 0.18
11 0.18
12 0.17
13 0.17
14 0.18
15 0.19
16 0.17
17 0.14
18 0.12
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.1
23 0.08
24 0.08
25 0.07
26 0.11
27 0.09
28 0.11
29 0.11
30 0.12
31 0.14
32 0.17
33 0.18
34 0.16
35 0.2
36 0.19
37 0.23
38 0.25
39 0.26
40 0.24
41 0.25
42 0.25
43 0.25
44 0.32
45 0.34
46 0.33
47 0.34
48 0.32
49 0.32
50 0.31
51 0.27
52 0.19
53 0.14
54 0.12
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.12
65 0.2
66 0.21
67 0.26
68 0.3
69 0.32
70 0.35
71 0.37
72 0.38
73 0.36
74 0.41
75 0.43
76 0.39
77 0.4
78 0.36
79 0.32
80 0.32
81 0.27
82 0.21
83 0.2
84 0.19
85 0.17
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.25
90 0.31
91 0.27
92 0.31
93 0.31
94 0.31
95 0.32
96 0.32
97 0.27
98 0.25
99 0.3
100 0.26
101 0.29
102 0.29
103 0.28
104 0.27
105 0.26
106 0.23
107 0.15
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.24
112 0.29
113 0.31
114 0.31
115 0.34
116 0.36
117 0.36
118 0.37
119 0.33
120 0.37
121 0.41
122 0.46
123 0.44
124 0.39
125 0.34
126 0.33
127 0.31
128 0.24
129 0.17
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.16
135 0.16
136 0.24
137 0.29
138 0.36
139 0.37
140 0.41
141 0.41
142 0.48
143 0.52
144 0.49
145 0.48
146 0.41
147 0.46
148 0.45
149 0.45
150 0.38
151 0.38
152 0.43
153 0.4
154 0.46
155 0.42
156 0.45
157 0.46
158 0.52
159 0.58
160 0.54
161 0.55
162 0.51
163 0.51
164 0.45
165 0.47
166 0.39
167 0.29
168 0.26
169 0.22
170 0.18
171 0.22
172 0.23
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.17
177 0.19
178 0.26
179 0.29
180 0.32
181 0.33
182 0.33
183 0.33
184 0.35
185 0.38
186 0.35
187 0.34
188 0.37
189 0.39
190 0.46
191 0.48
192 0.47
193 0.48
194 0.47
195 0.45
196 0.44
197 0.46
198 0.46
199 0.52
200 0.53
201 0.47
202 0.47
203 0.45
204 0.41
205 0.37
206 0.31
207 0.28
208 0.26
209 0.32
210 0.4
211 0.47
212 0.5
213 0.53
214 0.59
215 0.59
216 0.67
217 0.7
218 0.7
219 0.68
220 0.64
221 0.69
222 0.71
223 0.68
224 0.64
225 0.62
226 0.53
227 0.49
228 0.54
229 0.52
230 0.51
231 0.5
232 0.53
233 0.49
234 0.5
235 0.46
236 0.39
237 0.34
238 0.28
239 0.27
240 0.2
241 0.16
242 0.15
243 0.15
244 0.14
245 0.12
246 0.12
247 0.16
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.2
253 0.24
254 0.25
255 0.26
256 0.3
257 0.37
258 0.44
259 0.45
260 0.47
261 0.45
262 0.52
263 0.54
264 0.55
265 0.57
266 0.59
267 0.6
268 0.64
269 0.67
270 0.68
271 0.61
272 0.56
273 0.54
274 0.53
275 0.53
276 0.49
277 0.49
278 0.46
279 0.46
280 0.44
281 0.38
282 0.34
283 0.31
284 0.34
285 0.4
286 0.41
287 0.47
288 0.53
289 0.59
290 0.63
291 0.66
292 0.64
293 0.6
294 0.58
295 0.55
296 0.51
297 0.45
298 0.39
299 0.35
300 0.31
301 0.25
302 0.24
303 0.26
304 0.3
305 0.33
306 0.37
307 0.47
308 0.56
309 0.66
310 0.74
311 0.77
312 0.77
313 0.84
314 0.87
315 0.87
316 0.84
317 0.81
318 0.75
319 0.67
320 0.59
321 0.5
322 0.41
323 0.3
324 0.24
325 0.16
326 0.1
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.1
331 0.11
332 0.13
333 0.14
334 0.16
335 0.15
336 0.15
337 0.13
338 0.14
339 0.17
340 0.17
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.13
347 0.11
348 0.13
349 0.16
350 0.14
351 0.15
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.17
356 0.17
357 0.14
358 0.2
359 0.21
360 0.22
361 0.28
362 0.31
363 0.33
364 0.31
365 0.33
366 0.33
367 0.37
368 0.43
369 0.45
370 0.51
371 0.51
372 0.59
373 0.66
374 0.67
375 0.64
376 0.66
377 0.64
378 0.64
379 0.66
380 0.68