Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C1M5

Protein Details
Accession A0A550C1M5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
322-362ATPLRPTPASKQPKKRIADKSKGDAPKKKRKKDEIDAIFGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
330-353ASKQPKKRIADKSKGDAPKKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027951  Nepro_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF14780  DUF4477  
Amino Acid Sequences MRPGFPRTEKPPKLTVIERSHLAKDSHSAVDAALRDLKKYSRRLHVTYDAFSEELQVLERVFYKGKNQHRSALFWRRVADVRKFSQRIAQYEPPTLLDAFRCSFFGADLQPNSKAMKGAWSYVPDDKTKTYLLGRLSAGVALLNEAHERVLDAYRAFVLEMQSGFFLQLILTLAALSSRLDILVQDLRDALQGSWTTIYELFRTLNPSAATKVPKIQTVGPRPCSKGELAAPSVSQALPVRDEPAGDEDTGVTITRAPEVPAEPEVSDMQDTVPTAPLPSVTGRKRIDKSTDTYDDSPTREVEDTIDVVNIREAETPARVVATPLRPTPASKQPKKRIADKSKGDAPKKKRKKDEIDAIFGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.63
3 0.6
4 0.58
5 0.56
6 0.54
7 0.51
8 0.5
9 0.45
10 0.37
11 0.32
12 0.32
13 0.3
14 0.27
15 0.24
16 0.19
17 0.23
18 0.22
19 0.2
20 0.22
21 0.21
22 0.21
23 0.23
24 0.3
25 0.33
26 0.41
27 0.46
28 0.5
29 0.58
30 0.61
31 0.66
32 0.69
33 0.66
34 0.59
35 0.55
36 0.46
37 0.39
38 0.34
39 0.28
40 0.19
41 0.15
42 0.13
43 0.11
44 0.09
45 0.1
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.22
51 0.29
52 0.39
53 0.48
54 0.5
55 0.56
56 0.57
57 0.62
58 0.63
59 0.65
60 0.61
61 0.54
62 0.53
63 0.49
64 0.52
65 0.52
66 0.5
67 0.47
68 0.48
69 0.54
70 0.54
71 0.51
72 0.52
73 0.51
74 0.47
75 0.48
76 0.5
77 0.43
78 0.44
79 0.44
80 0.39
81 0.35
82 0.31
83 0.23
84 0.17
85 0.17
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.16
95 0.17
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.21
100 0.19
101 0.17
102 0.12
103 0.18
104 0.17
105 0.19
106 0.2
107 0.22
108 0.24
109 0.28
110 0.3
111 0.25
112 0.26
113 0.24
114 0.24
115 0.22
116 0.21
117 0.18
118 0.2
119 0.19
120 0.21
121 0.2
122 0.19
123 0.18
124 0.16
125 0.14
126 0.1
127 0.09
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.14
191 0.13
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.16
196 0.19
197 0.21
198 0.18
199 0.23
200 0.21
201 0.23
202 0.24
203 0.27
204 0.32
205 0.39
206 0.46
207 0.45
208 0.48
209 0.48
210 0.47
211 0.44
212 0.36
213 0.31
214 0.27
215 0.26
216 0.24
217 0.23
218 0.21
219 0.2
220 0.2
221 0.16
222 0.14
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.14
232 0.14
233 0.12
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.09
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.14
248 0.14
249 0.15
250 0.13
251 0.15
252 0.15
253 0.14
254 0.13
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.12
267 0.2
268 0.21
269 0.3
270 0.33
271 0.41
272 0.45
273 0.49
274 0.53
275 0.49
276 0.52
277 0.53
278 0.55
279 0.52
280 0.5
281 0.5
282 0.46
283 0.43
284 0.39
285 0.31
286 0.29
287 0.24
288 0.22
289 0.19
290 0.18
291 0.17
292 0.15
293 0.16
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.13
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.2
309 0.25
310 0.28
311 0.28
312 0.32
313 0.32
314 0.36
315 0.41
316 0.44
317 0.49
318 0.54
319 0.64
320 0.7
321 0.78
322 0.81
323 0.84
324 0.85
325 0.85
326 0.85
327 0.83
328 0.81
329 0.81
330 0.84
331 0.83
332 0.82
333 0.81
334 0.82
335 0.84
336 0.86
337 0.88
338 0.89
339 0.9
340 0.92
341 0.93
342 0.9