Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550CMW9

Protein Details
Accession A0A550CMW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
538-563QDRRTPLGKLSKKPKPWAKAMRDEGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
544-554LGKLSKKPKPW
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 11, nucl 8.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Amino Acid Sequences MSSTYLTALQHRRIEAEALSAQLDSDDDEDLQIDKKVQKLLEESSAIIRAADADSNIAEDLQTVLSAAYETLEAILKITYDAEIESIRSYTHDAATPLVKDPAAMENLTMSLMSPEFLDLISFLGGSNFTPKKIPKPDSFHSTPKPHANTSPLARFRMGAVPVLPPSAYTAQAILYGCCSISCEEGIPVPSELVTVPECDVLLMSGASGWKQRDPYLTYYRLDTCDSWDLMPEHTNIRNGLLNHVEYLAIDSKRNLIYAADEKRVKSFAVDGRKYKATHTLKSTREGPLAIIDDGTRLFRAGKGGVDVWDVDALPTHGADGKGDDTMRDEHGVEKVERSTGTPRTSSIDFTDAQMNVRKWHLPSWWCLGGQLKALAYLEDTHSSVSALDLQDGGKVAMRYMGHTGEVECISSSAADPTTFITAGDEGIVRLFDVRHPLPQMSFNAGEMEKTYSALYVHVDGVPIVLTGGTRSQCIKVWDPRAKKLVYELATGNNSVQSLAWDVKRSTLYAATECMYMDRMGSTHEYRRAKIPAGPEVQDRRTPLGKLSKKPKPWAKAMRDEGEGDDDETVDDDEDEDEGDAEDEEEGDDEEEEFTSDPDKAWPKKAYHAENYFGYTFDCGNHRLLRYKFGLDAIPKEVPAYGYVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.32
3 0.31
4 0.25
5 0.22
6 0.21
7 0.19
8 0.17
9 0.14
10 0.13
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.09
17 0.1
18 0.11
19 0.12
20 0.15
21 0.17
22 0.2
23 0.25
24 0.25
25 0.29
26 0.31
27 0.34
28 0.36
29 0.35
30 0.33
31 0.31
32 0.32
33 0.28
34 0.23
35 0.19
36 0.14
37 0.14
38 0.13
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.09
75 0.1
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.17
81 0.19
82 0.22
83 0.22
84 0.21
85 0.21
86 0.19
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.16
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.14
115 0.14
116 0.15
117 0.2
118 0.22
119 0.31
120 0.41
121 0.48
122 0.49
123 0.56
124 0.61
125 0.65
126 0.69
127 0.68
128 0.67
129 0.66
130 0.62
131 0.63
132 0.61
133 0.55
134 0.53
135 0.5
136 0.47
137 0.48
138 0.51
139 0.46
140 0.44
141 0.42
142 0.38
143 0.36
144 0.35
145 0.3
146 0.22
147 0.19
148 0.19
149 0.2
150 0.2
151 0.17
152 0.11
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.15
160 0.15
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.06
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.08
196 0.1
197 0.12
198 0.13
199 0.15
200 0.2
201 0.23
202 0.29
203 0.34
204 0.36
205 0.34
206 0.36
207 0.36
208 0.33
209 0.32
210 0.26
211 0.23
212 0.23
213 0.23
214 0.2
215 0.2
216 0.19
217 0.18
218 0.19
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.18
223 0.16
224 0.17
225 0.19
226 0.17
227 0.19
228 0.18
229 0.17
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.1
234 0.12
235 0.14
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.09
244 0.12
245 0.19
246 0.22
247 0.25
248 0.26
249 0.26
250 0.28
251 0.28
252 0.25
253 0.18
254 0.2
255 0.2
256 0.28
257 0.32
258 0.33
259 0.36
260 0.4
261 0.4
262 0.36
263 0.41
264 0.35
265 0.36
266 0.41
267 0.45
268 0.44
269 0.47
270 0.49
271 0.42
272 0.38
273 0.34
274 0.26
275 0.21
276 0.2
277 0.16
278 0.13
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.14
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.12
326 0.15
327 0.18
328 0.2
329 0.19
330 0.19
331 0.22
332 0.23
333 0.22
334 0.19
335 0.17
336 0.15
337 0.16
338 0.19
339 0.15
340 0.16
341 0.19
342 0.18
343 0.17
344 0.18
345 0.19
346 0.16
347 0.2
348 0.23
349 0.21
350 0.24
351 0.28
352 0.29
353 0.27
354 0.27
355 0.25
356 0.22
357 0.21
358 0.19
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.09
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.13
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.1
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.07
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.12
421 0.13
422 0.16
423 0.18
424 0.19
425 0.19
426 0.23
427 0.24
428 0.22
429 0.21
430 0.19
431 0.2
432 0.19
433 0.18
434 0.15
435 0.16
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.1
443 0.09
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.07
451 0.05
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.11
459 0.13
460 0.16
461 0.2
462 0.27
463 0.31
464 0.41
465 0.49
466 0.52
467 0.57
468 0.61
469 0.57
470 0.51
471 0.48
472 0.46
473 0.39
474 0.37
475 0.32
476 0.3
477 0.31
478 0.31
479 0.25
480 0.18
481 0.16
482 0.14
483 0.12
484 0.08
485 0.1
486 0.13
487 0.14
488 0.17
489 0.17
490 0.21
491 0.22
492 0.22
493 0.21
494 0.21
495 0.22
496 0.2
497 0.22
498 0.19
499 0.18
500 0.17
501 0.16
502 0.14
503 0.11
504 0.1
505 0.09
506 0.08
507 0.1
508 0.14
509 0.17
510 0.22
511 0.31
512 0.34
513 0.35
514 0.41
515 0.43
516 0.41
517 0.41
518 0.4
519 0.4
520 0.41
521 0.42
522 0.43
523 0.46
524 0.48
525 0.48
526 0.45
527 0.42
528 0.41
529 0.39
530 0.39
531 0.43
532 0.47
533 0.53
534 0.6
535 0.64
536 0.69
537 0.78
538 0.8
539 0.77
540 0.79
541 0.81
542 0.8
543 0.81
544 0.81
545 0.75
546 0.69
547 0.63
548 0.54
549 0.47
550 0.39
551 0.29
552 0.21
553 0.16
554 0.14
555 0.13
556 0.11
557 0.08
558 0.07
559 0.06
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.09
583 0.09
584 0.09
585 0.15
586 0.24
587 0.27
588 0.35
589 0.42
590 0.43
591 0.53
592 0.62
593 0.64
594 0.65
595 0.66
596 0.63
597 0.59
598 0.61
599 0.52
600 0.43
601 0.35
602 0.27
603 0.22
604 0.19
605 0.2
606 0.17
607 0.22
608 0.27
609 0.3
610 0.37
611 0.38
612 0.43
613 0.44
614 0.45
615 0.42
616 0.39
617 0.41
618 0.37
619 0.39
620 0.37
621 0.35
622 0.32
623 0.3
624 0.29
625 0.23