Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C016

Protein Details
Accession A0A550C016    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-144DDDQQGPPKKKRRRQALSCTECKRRKINLRRVHPCTPCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-120PKKKRRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MDPSRSPHHSSAFRRRTASLSELHAPHASQHHDQPSLPPIRSLHPFLNPSPPQSSSHPPPPMPSAEGSSGYGYSDAPHSSSYSAHGMPAMQHSLRESDYPMVESDPDDDQQGPPKKKRRRQALSCTECKRRKINLRRVHPCTPCSRRGEQDRCHWNIIEPTEKYVSRQEHDELRARVEHLEGLVQRLLSGSTAATPYYQMTVPGAPDNPSPYPGGGGMYPQHPHAGLMPPPPPLSVPYDMPAQGDRDRDRERARVSPTAATRSPPAAAKHSLASITSPYNTGPGPAEPQSKNCCAQTLMLGERLRLLPCAPTGGDDDPASATNSRRMGPASSSAPTTCHPRCRSPRGGMANVMQASAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.65
3 0.61
4 0.57
5 0.52
6 0.45
7 0.41
8 0.43
9 0.4
10 0.41
11 0.38
12 0.33
13 0.32
14 0.33
15 0.32
16 0.29
17 0.34
18 0.37
19 0.38
20 0.39
21 0.39
22 0.43
23 0.44
24 0.41
25 0.37
26 0.33
27 0.36
28 0.4
29 0.41
30 0.36
31 0.37
32 0.4
33 0.39
34 0.47
35 0.44
36 0.44
37 0.43
38 0.41
39 0.38
40 0.39
41 0.45
42 0.42
43 0.5
44 0.52
45 0.48
46 0.49
47 0.5
48 0.48
49 0.42
50 0.36
51 0.31
52 0.27
53 0.28
54 0.26
55 0.23
56 0.2
57 0.18
58 0.16
59 0.12
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.14
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.17
76 0.17
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.21
98 0.29
99 0.33
100 0.4
101 0.49
102 0.58
103 0.65
104 0.74
105 0.76
106 0.78
107 0.82
108 0.85
109 0.87
110 0.85
111 0.86
112 0.83
113 0.82
114 0.77
115 0.71
116 0.67
117 0.65
118 0.68
119 0.7
120 0.74
121 0.73
122 0.79
123 0.83
124 0.83
125 0.83
126 0.76
127 0.69
128 0.68
129 0.64
130 0.61
131 0.57
132 0.54
133 0.52
134 0.58
135 0.63
136 0.59
137 0.62
138 0.63
139 0.61
140 0.59
141 0.52
142 0.44
143 0.39
144 0.35
145 0.32
146 0.24
147 0.23
148 0.24
149 0.23
150 0.24
151 0.26
152 0.26
153 0.21
154 0.24
155 0.23
156 0.25
157 0.29
158 0.33
159 0.28
160 0.27
161 0.27
162 0.25
163 0.23
164 0.18
165 0.15
166 0.09
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.05
176 0.06
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.14
213 0.14
214 0.17
215 0.18
216 0.2
217 0.2
218 0.2
219 0.18
220 0.16
221 0.19
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.19
226 0.19
227 0.2
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.22
232 0.22
233 0.27
234 0.3
235 0.35
236 0.37
237 0.4
238 0.42
239 0.43
240 0.46
241 0.45
242 0.44
243 0.44
244 0.43
245 0.43
246 0.4
247 0.35
248 0.32
249 0.29
250 0.28
251 0.26
252 0.26
253 0.24
254 0.26
255 0.26
256 0.25
257 0.25
258 0.24
259 0.2
260 0.18
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.13
268 0.14
269 0.13
270 0.12
271 0.16
272 0.19
273 0.27
274 0.26
275 0.32
276 0.37
277 0.4
278 0.42
279 0.38
280 0.36
281 0.3
282 0.3
283 0.28
284 0.28
285 0.26
286 0.29
287 0.29
288 0.27
289 0.28
290 0.29
291 0.25
292 0.2
293 0.19
294 0.15
295 0.15
296 0.18
297 0.15
298 0.15
299 0.19
300 0.19
301 0.21
302 0.19
303 0.19
304 0.17
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.2
310 0.23
311 0.23
312 0.23
313 0.25
314 0.25
315 0.26
316 0.31
317 0.29
318 0.28
319 0.3
320 0.29
321 0.29
322 0.29
323 0.34
324 0.34
325 0.4
326 0.43
327 0.51
328 0.61
329 0.68
330 0.74
331 0.73
332 0.77
333 0.76
334 0.75
335 0.7
336 0.63
337 0.62
338 0.53