Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CQI4

Protein Details
Accession A0A550CQI4    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-141NCFIDPILTKKKRRRQRKDAFDEDEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-133KKKRRRQRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019761  DNA-dir_RNA_pol-M_15_CS  
IPR001529  DNA-dir_RNA_pol_M/15kDasu  
IPR012164  Rpa12/Rpb9/Rpc10/TFS  
IPR034012  Zn_ribbon_RPB9_C  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0005665  C:RNA polymerase II, core complex  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
Pfam View protein in Pfam  
PF02150  RNA_POL_M_15KD  
PF01096  TFIIS_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01030  RNA_POL_M_15KD  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd10508  Zn-ribbon_RPB9  
Amino Acid Sequences MDIQSPSPALHFCTECNNLLYPKADRQYNRLYYYCRMCARDQPAGENDSIVYRNDLLTVTKEQMGEVGNLETDPTLAHASQMCPSCHNYDCVIFQDQSKRYQTRMILFYVCTRCGNCFIDPILTKKKRRRQRKDAFDEDEENKRRQREELQRRGLIPGPELAPFGRPLVEEVDCESDSEGFLDCFKADGHLKQEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.3
4 0.3
5 0.27
6 0.29
7 0.31
8 0.27
9 0.31
10 0.34
11 0.38
12 0.37
13 0.42
14 0.5
15 0.54
16 0.55
17 0.51
18 0.5
19 0.51
20 0.55
21 0.56
22 0.51
23 0.47
24 0.44
25 0.49
26 0.51
27 0.52
28 0.46
29 0.43
30 0.41
31 0.4
32 0.37
33 0.29
34 0.23
35 0.18
36 0.18
37 0.14
38 0.12
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.12
45 0.14
46 0.14
47 0.16
48 0.16
49 0.15
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.06
59 0.05
60 0.04
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.13
68 0.16
69 0.15
70 0.16
71 0.18
72 0.21
73 0.21
74 0.22
75 0.19
76 0.17
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.15
81 0.16
82 0.21
83 0.22
84 0.25
85 0.29
86 0.27
87 0.26
88 0.3
89 0.31
90 0.29
91 0.3
92 0.27
93 0.23
94 0.23
95 0.28
96 0.25
97 0.24
98 0.2
99 0.18
100 0.18
101 0.21
102 0.23
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.19
107 0.2
108 0.24
109 0.3
110 0.34
111 0.42
112 0.5
113 0.59
114 0.64
115 0.75
116 0.81
117 0.81
118 0.86
119 0.89
120 0.9
121 0.9
122 0.86
123 0.79
124 0.73
125 0.65
126 0.64
127 0.56
128 0.5
129 0.44
130 0.4
131 0.37
132 0.36
133 0.42
134 0.44
135 0.52
136 0.59
137 0.64
138 0.65
139 0.65
140 0.64
141 0.59
142 0.49
143 0.39
144 0.31
145 0.24
146 0.21
147 0.21
148 0.18
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.21
160 0.2
161 0.2
162 0.19
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.13
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.13
174 0.15
175 0.19