Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C9D8

Protein Details
Accession A0A550C9D8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-260NDGPQRPDRRAQRRVRRAADTHydrophilic
300-323VRNRGGPNYKRARPSKRRDFFDVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-317RAPRTVRNRGGPNYKRARPSKRR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10, cyto_nucl 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025768  TFG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51536  TFG  
Amino Acid Sequences MPKDTATSKMTRTASSVLHGIRKVAKLRYKNLKITSTFGKDALKQRVRDLCDTLDDLDVSQKRASEHDAAGISAEAFSTAELSEALPTIEATVKSVDTAALEPAKDDETITDPDLVAVKPLSLPPPVVKDIHTYQESTKSSPTSICLPSIASVLSCPASPSDFEAAELQAPHTLPSFGELTEGLHANEEDNDDHLALPLSVHNHPMGATAVSSPIHDETLPSFEGIEAPIEDALLTMGLNDGPQRPDRRAQRRVRRAADTDTFGVLPSSILATQQKAVKESFDAFVDAGGAVRNRAPRTVRNRGGPNYKRARPSKRRDFFDVVLNDSNDSEPISSPVVATYSESSSALGDLARYKLKRALPPLPSGSYVPEYSFETHPSWMRILTAAHLDNPHSPLYAMAYENSEDSDDSMDCSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.36
4 0.31
5 0.35
6 0.34
7 0.34
8 0.36
9 0.4
10 0.43
11 0.46
12 0.51
13 0.53
14 0.62
15 0.69
16 0.72
17 0.75
18 0.76
19 0.75
20 0.69
21 0.67
22 0.66
23 0.61
24 0.54
25 0.48
26 0.45
27 0.43
28 0.49
29 0.55
30 0.53
31 0.48
32 0.54
33 0.59
34 0.6
35 0.58
36 0.53
37 0.45
38 0.42
39 0.42
40 0.36
41 0.3
42 0.25
43 0.21
44 0.24
45 0.23
46 0.22
47 0.21
48 0.21
49 0.21
50 0.23
51 0.27
52 0.25
53 0.24
54 0.26
55 0.26
56 0.24
57 0.23
58 0.21
59 0.16
60 0.11
61 0.1
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.11
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.17
113 0.19
114 0.2
115 0.19
116 0.23
117 0.24
118 0.29
119 0.28
120 0.25
121 0.24
122 0.31
123 0.32
124 0.29
125 0.28
126 0.24
127 0.24
128 0.23
129 0.24
130 0.21
131 0.2
132 0.19
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.14
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.02
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.06
229 0.08
230 0.12
231 0.15
232 0.17
233 0.25
234 0.35
235 0.44
236 0.52
237 0.61
238 0.68
239 0.76
240 0.83
241 0.81
242 0.77
243 0.71
244 0.67
245 0.6
246 0.53
247 0.43
248 0.35
249 0.3
250 0.24
251 0.2
252 0.13
253 0.09
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.11
261 0.15
262 0.15
263 0.17
264 0.17
265 0.16
266 0.17
267 0.18
268 0.17
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.09
280 0.13
281 0.14
282 0.18
283 0.22
284 0.29
285 0.38
286 0.48
287 0.51
288 0.55
289 0.61
290 0.64
291 0.72
292 0.69
293 0.7
294 0.68
295 0.68
296 0.7
297 0.71
298 0.75
299 0.75
300 0.81
301 0.82
302 0.82
303 0.82
304 0.81
305 0.8
306 0.7
307 0.69
308 0.6
309 0.54
310 0.48
311 0.43
312 0.35
313 0.28
314 0.27
315 0.18
316 0.16
317 0.12
318 0.08
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.12
339 0.18
340 0.19
341 0.21
342 0.27
343 0.34
344 0.39
345 0.45
346 0.51
347 0.5
348 0.57
349 0.6
350 0.56
351 0.52
352 0.46
353 0.42
354 0.37
355 0.33
356 0.26
357 0.23
358 0.23
359 0.25
360 0.25
361 0.25
362 0.23
363 0.25
364 0.28
365 0.29
366 0.27
367 0.24
368 0.23
369 0.22
370 0.21
371 0.2
372 0.23
373 0.21
374 0.23
375 0.24
376 0.26
377 0.27
378 0.29
379 0.27
380 0.21
381 0.2
382 0.17
383 0.2
384 0.2
385 0.18
386 0.17
387 0.18
388 0.18
389 0.19
390 0.19
391 0.16
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.12