Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A550CDQ6

Protein Details
Accession A0A550CDQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
774-794VTNGNGNKRKRRATNKSSESDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
739-787RGARLPGPGARPPSSRKNSISPGSRPAKRPAAEPPVTNGNGNKRKRRAT
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR013105  TPR_2  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF00515  TPR_1  
PF13432  TPR_16  
PF07719  TPR_2  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MSHRHVSRQQDREVRMADPSPTLAPHINGAAAPAVNGANHSHHVSPAVAHSVVVNGTAPLSLAQKLSRANEDTWMLVGRVAEQMGELDLALSAYESVLRHNPNSMNGLSQVASIARIKENYPKAIDYFQRVVAVEDHNGEVWSALGHCYLMQDDLQKAYTAYQQALYNLPNPKEDPKLWYGIGILYDRYGSLDHAEEAFSSVLRMDRELDFDKANEILFRLGIIYKQQCKFNDSLSCFHQILRNPPSPLAHADIWFQIGHVHEQQKDFVQAKEAYEKVVQDNPNHAKVLQQLGWLFHQDGSSFQNQDEAIHCLTKSLEADSSDAQSWYLLGRAFMAGQKYNKAYEAYQQAVYRDSRNPTFWCSIGVLYFQINQFRDALDAYSRAIRINPYISEVWFDLGSLYESCNNQISDAIDAYARASELDPSNQIITQRLQLLKSAQVNGTRVGAAPGPQDVHPTAYANVVPPGPGGMSGLPLMLQAPGVTPRPGPLRTDSRGPGSEIALPPPSQMSIAGRSGSPPFRGGPPPPVVLDDRHPPSHTPLAPMELDRGGPLRDGGRSLLNRDSVPPPPPRTNGHVDPFYNRGPRPSRSSSPAPPPTSLLGGPRARSPEQWPPRQNGSPVMSGRQFAAPLPVSREYESSPMDNVRSWSRSQAAQQEMMRGPEPPRREGSPMSDRQRSHSRSSARRGYPAAPESGHRMPPYERERPSRYDPLMDAAGEREREAMEADRRSQFERSPEGMRGARLPGPGARPPSSRKNSISPGSRPAKRPAAEPPVTNGNGNKRKRRATNKSSESDTPKPEGWGESSSRAPRARSPGMMSSSGASSSRSVQPSPTGMARPPERVLDEDYDEPAVAADALMGLASSSGSYRQAEAAQSSNSPTVSTGSRHSDGTRVLSHRNSVSSQRSRPSPPAPAAPSLKRPPSHGAFEDHEPKRPRMDSSSRRPSSPSQGRRSPQQSSRPSPIPFRTQPSSRSPDTHEPYGASPSLPAVLPPHPRPIGNGAGGQGGSPSIALPPIATLQSSKSPQGERDEQMQVDRSRSGTPRQSPGNRVSPPKGEKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.51
3 0.46
4 0.39
5 0.31
6 0.3
7 0.25
8 0.23
9 0.25
10 0.23
11 0.21
12 0.21
13 0.2
14 0.19
15 0.17
16 0.17
17 0.16
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.1
23 0.11
24 0.12
25 0.13
26 0.16
27 0.19
28 0.18
29 0.19
30 0.21
31 0.2
32 0.19
33 0.19
34 0.21
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.12
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.17
52 0.21
53 0.24
54 0.29
55 0.31
56 0.3
57 0.34
58 0.35
59 0.32
60 0.29
61 0.27
62 0.21
63 0.18
64 0.17
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.07
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.07
82 0.07
83 0.1
84 0.16
85 0.19
86 0.2
87 0.26
88 0.28
89 0.29
90 0.33
91 0.31
92 0.27
93 0.26
94 0.27
95 0.21
96 0.19
97 0.17
98 0.12
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.19
105 0.27
106 0.32
107 0.35
108 0.37
109 0.37
110 0.37
111 0.42
112 0.44
113 0.42
114 0.39
115 0.36
116 0.36
117 0.33
118 0.32
119 0.29
120 0.28
121 0.22
122 0.21
123 0.2
124 0.17
125 0.17
126 0.15
127 0.12
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.16
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.19
147 0.18
148 0.18
149 0.19
150 0.19
151 0.21
152 0.23
153 0.23
154 0.25
155 0.29
156 0.29
157 0.29
158 0.3
159 0.33
160 0.36
161 0.36
162 0.36
163 0.34
164 0.37
165 0.34
166 0.32
167 0.29
168 0.24
169 0.25
170 0.2
171 0.16
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.11
184 0.12
185 0.11
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.18
195 0.2
196 0.22
197 0.2
198 0.2
199 0.21
200 0.19
201 0.18
202 0.14
203 0.12
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.15
211 0.21
212 0.28
213 0.31
214 0.37
215 0.37
216 0.42
217 0.42
218 0.42
219 0.44
220 0.4
221 0.4
222 0.38
223 0.42
224 0.37
225 0.37
226 0.35
227 0.3
228 0.35
229 0.38
230 0.41
231 0.37
232 0.39
233 0.4
234 0.37
235 0.37
236 0.33
237 0.27
238 0.23
239 0.23
240 0.21
241 0.21
242 0.18
243 0.15
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.18
248 0.21
249 0.23
250 0.24
251 0.25
252 0.25
253 0.3
254 0.29
255 0.23
256 0.25
257 0.24
258 0.25
259 0.29
260 0.28
261 0.24
262 0.24
263 0.25
264 0.22
265 0.27
266 0.28
267 0.24
268 0.33
269 0.35
270 0.37
271 0.36
272 0.33
273 0.29
274 0.3
275 0.34
276 0.26
277 0.24
278 0.22
279 0.24
280 0.25
281 0.24
282 0.21
283 0.16
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.15
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.18
292 0.17
293 0.18
294 0.18
295 0.17
296 0.15
297 0.16
298 0.16
299 0.13
300 0.13
301 0.14
302 0.13
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.14
307 0.14
308 0.16
309 0.15
310 0.14
311 0.13
312 0.11
313 0.1
314 0.08
315 0.09
316 0.07
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.1
322 0.12
323 0.14
324 0.15
325 0.19
326 0.19
327 0.2
328 0.21
329 0.21
330 0.19
331 0.21
332 0.26
333 0.25
334 0.26
335 0.27
336 0.26
337 0.27
338 0.28
339 0.25
340 0.24
341 0.26
342 0.25
343 0.28
344 0.29
345 0.31
346 0.31
347 0.28
348 0.26
349 0.23
350 0.21
351 0.18
352 0.17
353 0.12
354 0.11
355 0.13
356 0.12
357 0.15
358 0.15
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.16
379 0.17
380 0.16
381 0.14
382 0.12
383 0.11
384 0.08
385 0.07
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.09
390 0.09
391 0.1
392 0.13
393 0.12
394 0.11
395 0.12
396 0.12
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.07
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.07
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.12
415 0.12
416 0.12
417 0.13
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.17
422 0.18
423 0.2
424 0.21
425 0.21
426 0.19
427 0.2
428 0.21
429 0.2
430 0.2
431 0.16
432 0.13
433 0.12
434 0.11
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.11
441 0.1
442 0.12
443 0.11
444 0.12
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.1
449 0.11
450 0.09
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.03
467 0.04
468 0.06
469 0.07
470 0.08
471 0.07
472 0.1
473 0.14
474 0.15
475 0.16
476 0.19
477 0.24
478 0.26
479 0.3
480 0.3
481 0.3
482 0.3
483 0.29
484 0.25
485 0.2
486 0.22
487 0.18
488 0.18
489 0.15
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.11
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.11
502 0.14
503 0.14
504 0.14
505 0.12
506 0.12
507 0.15
508 0.18
509 0.18
510 0.21
511 0.22
512 0.23
513 0.22
514 0.23
515 0.21
516 0.19
517 0.21
518 0.21
519 0.21
520 0.21
521 0.22
522 0.2
523 0.23
524 0.28
525 0.26
526 0.23
527 0.2
528 0.22
529 0.21
530 0.21
531 0.18
532 0.13
533 0.12
534 0.09
535 0.1
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.12
544 0.13
545 0.15
546 0.17
547 0.18
548 0.17
549 0.19
550 0.21
551 0.19
552 0.23
553 0.26
554 0.28
555 0.31
556 0.33
557 0.34
558 0.36
559 0.4
560 0.41
561 0.4
562 0.38
563 0.35
564 0.35
565 0.35
566 0.34
567 0.31
568 0.26
569 0.29
570 0.29
571 0.32
572 0.37
573 0.39
574 0.4
575 0.41
576 0.47
577 0.46
578 0.51
579 0.56
580 0.51
581 0.45
582 0.43
583 0.38
584 0.34
585 0.3
586 0.22
587 0.21
588 0.2
589 0.2
590 0.21
591 0.24
592 0.23
593 0.25
594 0.28
595 0.31
596 0.38
597 0.46
598 0.47
599 0.47
600 0.53
601 0.53
602 0.49
603 0.45
604 0.4
605 0.37
606 0.34
607 0.33
608 0.27
609 0.25
610 0.25
611 0.2
612 0.17
613 0.11
614 0.15
615 0.13
616 0.13
617 0.17
618 0.18
619 0.19
620 0.2
621 0.21
622 0.18
623 0.2
624 0.2
625 0.17
626 0.16
627 0.16
628 0.16
629 0.15
630 0.16
631 0.16
632 0.17
633 0.17
634 0.19
635 0.19
636 0.21
637 0.23
638 0.28
639 0.27
640 0.3
641 0.3
642 0.32
643 0.31
644 0.31
645 0.28
646 0.22
647 0.22
648 0.22
649 0.24
650 0.22
651 0.25
652 0.25
653 0.29
654 0.29
655 0.34
656 0.38
657 0.44
658 0.46
659 0.49
660 0.47
661 0.5
662 0.57
663 0.54
664 0.5
665 0.49
666 0.51
667 0.53
668 0.61
669 0.64
670 0.57
671 0.57
672 0.54
673 0.5
674 0.48
675 0.42
676 0.36
677 0.28
678 0.26
679 0.29
680 0.29
681 0.29
682 0.23
683 0.23
684 0.22
685 0.3
686 0.36
687 0.38
688 0.4
689 0.44
690 0.49
691 0.53
692 0.58
693 0.58
694 0.52
695 0.47
696 0.43
697 0.39
698 0.35
699 0.29
700 0.22
701 0.16
702 0.17
703 0.14
704 0.14
705 0.11
706 0.1
707 0.1
708 0.11
709 0.13
710 0.16
711 0.19
712 0.22
713 0.25
714 0.26
715 0.28
716 0.29
717 0.28
718 0.28
719 0.32
720 0.32
721 0.31
722 0.32
723 0.34
724 0.33
725 0.32
726 0.28
727 0.25
728 0.24
729 0.21
730 0.21
731 0.19
732 0.22
733 0.25
734 0.28
735 0.28
736 0.29
737 0.34
738 0.43
739 0.46
740 0.48
741 0.48
742 0.5
743 0.54
744 0.57
745 0.59
746 0.52
747 0.55
748 0.57
749 0.59
750 0.56
751 0.56
752 0.58
753 0.52
754 0.51
755 0.5
756 0.52
757 0.49
758 0.46
759 0.43
760 0.42
761 0.42
762 0.41
763 0.35
764 0.36
765 0.42
766 0.49
767 0.54
768 0.53
769 0.61
770 0.69
771 0.77
772 0.78
773 0.79
774 0.83
775 0.82
776 0.79
777 0.76
778 0.73
779 0.7
780 0.65
781 0.58
782 0.51
783 0.44
784 0.4
785 0.36
786 0.32
787 0.27
788 0.24
789 0.23
790 0.23
791 0.27
792 0.28
793 0.33
794 0.33
795 0.33
796 0.34
797 0.4
798 0.4
799 0.38
800 0.4
801 0.41
802 0.42
803 0.41
804 0.36
805 0.29
806 0.26
807 0.24
808 0.19
809 0.14
810 0.12
811 0.14
812 0.2
813 0.21
814 0.21
815 0.22
816 0.25
817 0.26
818 0.28
819 0.27
820 0.23
821 0.23
822 0.3
823 0.31
824 0.32
825 0.32
826 0.32
827 0.3
828 0.3
829 0.32
830 0.28
831 0.29
832 0.26
833 0.26
834 0.23
835 0.21
836 0.19
837 0.14
838 0.11
839 0.07
840 0.05
841 0.04
842 0.03
843 0.03
844 0.03
845 0.03
846 0.02
847 0.02
848 0.03
849 0.03
850 0.03
851 0.05
852 0.07
853 0.08
854 0.09
855 0.11
856 0.13
857 0.15
858 0.17
859 0.19
860 0.18
861 0.18
862 0.2
863 0.2
864 0.18
865 0.17
866 0.15
867 0.15
868 0.15
869 0.17
870 0.19
871 0.24
872 0.25
873 0.27
874 0.27
875 0.29
876 0.29
877 0.31
878 0.33
879 0.3
880 0.33
881 0.34
882 0.37
883 0.36
884 0.36
885 0.35
886 0.36
887 0.42
888 0.45
889 0.49
890 0.51
891 0.54
892 0.56
893 0.6
894 0.59
895 0.57
896 0.53
897 0.56
898 0.54
899 0.55
900 0.56
901 0.54
902 0.57
903 0.56
904 0.59
905 0.52
906 0.53
907 0.54
908 0.53
909 0.55
910 0.49
911 0.47
912 0.44
913 0.49
914 0.55
915 0.49
916 0.52
917 0.5
918 0.49
919 0.51
920 0.49
921 0.46
922 0.45
923 0.54
924 0.56
925 0.62
926 0.71
927 0.66
928 0.66
929 0.66
930 0.63
931 0.63
932 0.64
933 0.63
934 0.61
935 0.67
936 0.7
937 0.75
938 0.76
939 0.74
940 0.72
941 0.72
942 0.73
943 0.71
944 0.76
945 0.73
946 0.7
947 0.69
948 0.67
949 0.66
950 0.62
951 0.62
952 0.61
953 0.59
954 0.61
955 0.61
956 0.62
957 0.56
958 0.55
959 0.55
960 0.58
961 0.6
962 0.59
963 0.52
964 0.47
965 0.45
966 0.46
967 0.39
968 0.28
969 0.22
970 0.18
971 0.18
972 0.16
973 0.15
974 0.13
975 0.19
976 0.27
977 0.3
978 0.37
979 0.38
980 0.38
981 0.41
982 0.43
983 0.43
984 0.38
985 0.37
986 0.29
987 0.29
988 0.29
989 0.25
990 0.19
991 0.13
992 0.1
993 0.08
994 0.07
995 0.05
996 0.06
997 0.06
998 0.06
999 0.08
1000 0.1
1001 0.11
1002 0.11
1003 0.12
1004 0.15
1005 0.23
1006 0.26
1007 0.29
1008 0.32
1009 0.35
1010 0.39
1011 0.46
1012 0.5
1013 0.46
1014 0.49
1015 0.51
1016 0.47
1017 0.47
1018 0.5
1019 0.44
1020 0.4
1021 0.38
1022 0.33
1023 0.34
1024 0.37
1025 0.41
1026 0.43
1027 0.48
1028 0.53
1029 0.61
1030 0.66
1031 0.67
1032 0.71
1033 0.72
1034 0.69
1035 0.7
1036 0.68
1037 0.68