Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CCB2

Protein Details
Accession A0A550CCB2    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32KSSSLPSDRIKPRYNNRPQQNGTGGHydrophilic
222-243PSEPHYSRKKADPQRPWKNLMGHydrophilic
249-276VPPPKEREGGQGKRRRRKGKEAQGGDGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-51GRGSPKGKEPAGPPKSRAVR
245-269GARYVPPPKEREGGQGKRRRRKGKE
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MQHTPWIKSSSLPSDRIKPRYNNRPQQNGTGGRGSPKGKEPAGPPKSRAVRKLENQIAALTSEAGTQDPAGGCFCMAREHALSSYAPACTRCGLILCVLNGPQHLCPHCASPLLSPDAAARLIERLESELAATRAREEAAVVRAEQEARARAGAFPTLSGAAPPMRTPSPAQNQAHKVLSLNSRTKKATVTTFTPAPPPPPPAQQQQEAPAEPEPVRVPPPPSEPHYSRKKADPQRPWKNLMGEGARYVPPPKEREGGQGKRRRRKGKEAQGGDGGPTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.6
3 0.65
4 0.67
5 0.66
6 0.71
7 0.76
8 0.82
9 0.83
10 0.84
11 0.86
12 0.82
13 0.8
14 0.79
15 0.74
16 0.67
17 0.62
18 0.53
19 0.46
20 0.48
21 0.42
22 0.36
23 0.37
24 0.39
25 0.35
26 0.38
27 0.41
28 0.46
29 0.53
30 0.54
31 0.5
32 0.54
33 0.62
34 0.63
35 0.63
36 0.6
37 0.61
38 0.63
39 0.71
40 0.68
41 0.62
42 0.57
43 0.52
44 0.44
45 0.35
46 0.28
47 0.18
48 0.11
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.13
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.13
76 0.12
77 0.13
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.16
94 0.17
95 0.18
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.11
107 0.08
108 0.06
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.06
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.1
152 0.09
153 0.11
154 0.13
155 0.2
156 0.27
157 0.35
158 0.37
159 0.41
160 0.45
161 0.47
162 0.46
163 0.39
164 0.31
165 0.27
166 0.3
167 0.3
168 0.34
169 0.33
170 0.36
171 0.37
172 0.37
173 0.35
174 0.34
175 0.34
176 0.3
177 0.31
178 0.32
179 0.33
180 0.33
181 0.34
182 0.32
183 0.29
184 0.27
185 0.28
186 0.26
187 0.29
188 0.33
189 0.37
190 0.41
191 0.42
192 0.42
193 0.43
194 0.45
195 0.4
196 0.38
197 0.3
198 0.29
199 0.25
200 0.25
201 0.2
202 0.18
203 0.2
204 0.21
205 0.23
206 0.23
207 0.29
208 0.31
209 0.35
210 0.41
211 0.43
212 0.49
213 0.56
214 0.58
215 0.56
216 0.6
217 0.66
218 0.68
219 0.74
220 0.76
221 0.77
222 0.82
223 0.84
224 0.81
225 0.77
226 0.71
227 0.64
228 0.6
229 0.53
230 0.44
231 0.4
232 0.38
233 0.33
234 0.3
235 0.29
236 0.27
237 0.29
238 0.31
239 0.33
240 0.34
241 0.35
242 0.43
243 0.51
244 0.56
245 0.6
246 0.66
247 0.72
248 0.78
249 0.87
250 0.88
251 0.86
252 0.87
253 0.88
254 0.9
255 0.9
256 0.86
257 0.82
258 0.78
259 0.7