FuNGI

A0A550BWM4

Protein Details

Accession

A0A550BWM4

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
380-401	TEDTAPPKKRKAKKSSDTPAAA	Hydrophilic
474-493	VSGKKAKKAGKEKAAGKEKA	Basic
515-542	AEEATEKVRTDKKKKQKKAKAEGVNALE	Hydrophilic
560-593	IDEPDFKKKRAGKAGEKKKEKVAKARPGKPSAKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
297-342	ARAKGKRRADADQEPEQPKKRAKGEKGAVVPADSVELKKKKSKATK
355-364	AKPKSKKKAR
386-393	PKKRKAKK
446-449	KKRK
476-494	GKKAKKAGKEKAAGKEKAA
524-534	TDKKKKQKKAK
566-603	KKKRAGKAGEKKKEKVAKARPGKPSAKEGVLGKKAARA

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto_nucl 13.833, cyto 12.5, mito_nucl 7.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR023674 Ribosomal_L1-like IPR028364 Ribosomal_L1/biogenesis IPR016095 Ribosomal_L1_3-a/b-sand
Gene Ontology	GO:0005840 C:ribosome
Pfam	View protein in Pfam PF00687 Ribosomal_L1
CDD	cd00403 Ribosomal_L1

Amino Acid Sequences

MAVDLIDGHVSPTQCEKAVNALLAHATKRAQAKAETELLPSREQHVWLNIAEKTIPADRKLKPQRIPLAYPIVDPRVASICLITKDPQRQYKDLLETQKIRFISRVVGMEKLKGKFKPFEARRGLLKDHDMFLADERIIPLLPKLLGSTWFKAKKQPIPVCLTRKDLKSELERAVSSTYMSQQQGTQTSVKIGTLSQKPAHILANLKTALPAIAARITGGWDNIQNVHIKTSSSASLPVWSCDLSADALGRWGGAADVADVEMSGVSDLEDSDKEEEDEEDEEADEEMEVDTPAPPARAKGKRRADADQEPEQPKKRAKGEKGAVVPADSVELKKKKSKATKDATPSVDVAPADAKPKSKKKARVAEETTEDAATTAAPTEDTAPPKKRKAKKSSDTPAAAAATTKAAATAKTATDTIAKNAATSEAVVAAVSAPPATDAGTVTKKKRKARAEVDATPDAGPVAVAVEVEESPVSGKKAKKAGKEKAAGKEKAASEDKAASKAAPVPDVVIAADAEEATEKVRTDKKKKQKKAKAEGVNALEAAAVVALPAEADAAAKEIDEPDFKKKRAGKAGEKKKEKVAKARPGKPSAKEGVLGKKAARA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.21
3	0.21
4	0.25
5	0.28
6	0.29
7	0.24
8	0.23
9	0.25
10	0.26
11	0.26
12	0.22
13	0.19
14	0.21
15	0.27
16	0.28
17	0.29
18	0.31
19	0.34
20	0.37
21	0.42
22	0.39
23	0.37
24	0.39
25	0.38
26	0.36
27	0.34
28	0.32
29	0.29
30	0.29
31	0.29
32	0.29
33	0.29
34	0.27
35	0.3
36	0.27
37	0.25
38	0.24
39	0.2
40	0.2
41	0.24
42	0.26
43	0.26
44	0.33
45	0.35
46	0.46
47	0.56
48	0.61
49	0.61
50	0.68
51	0.74
52	0.73
53	0.74
54	0.69
55	0.68
56	0.59
57	0.55
58	0.49
59	0.43
60	0.36
61	0.31
62	0.28
63	0.22
64	0.22
65	0.19
66	0.17
67	0.18
68	0.19
69	0.21
70	0.22
71	0.26
72	0.34
73	0.42
74	0.49
75	0.51
76	0.52
77	0.55
78	0.6
79	0.61
80	0.59
81	0.58
82	0.58
83	0.58
84	0.56
85	0.56
86	0.49
87	0.43
88	0.37
89	0.31
90	0.28
91	0.26
92	0.3
93	0.26
94	0.31
95	0.3
96	0.34
97	0.39
98	0.38
99	0.39
100	0.37
101	0.4
102	0.4
103	0.45
104	0.51
105	0.49
106	0.56
107	0.58
108	0.58
109	0.6
110	0.6
111	0.56
112	0.49
113	0.51
114	0.43
115	0.38
116	0.35
117	0.29
118	0.25
119	0.24
120	0.22
121	0.16
122	0.14
123	0.13
124	0.13
125	0.11
126	0.11
127	0.09
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.1
132	0.1
133	0.15
134	0.19
135	0.22
136	0.28
137	0.34
138	0.34
139	0.41
140	0.48
141	0.5
142	0.57
143	0.6
144	0.58
145	0.6
146	0.67
147	0.67
148	0.63
149	0.63
150	0.57
151	0.53
152	0.52
153	0.47
154	0.44
155	0.43
156	0.45
157	0.42
158	0.4
159	0.37
160	0.33
161	0.31
162	0.26
163	0.2
164	0.16
165	0.15
166	0.16
167	0.17
168	0.16
169	0.16
170	0.19
171	0.2
172	0.22
173	0.21
174	0.16
175	0.18
176	0.18
177	0.16
178	0.14
179	0.12
180	0.17
181	0.19
182	0.23
183	0.23
184	0.24
185	0.25
186	0.26
187	0.27
188	0.22
189	0.21
190	0.19
191	0.23
192	0.22
193	0.21
194	0.2
195	0.18
196	0.16
197	0.13
198	0.11
199	0.06
200	0.07
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.07
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.12
213	0.12
214	0.13
215	0.13
216	0.12
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.11
221	0.13
222	0.11
223	0.15
224	0.16
225	0.15
226	0.14
227	0.13
228	0.12
229	0.11
230	0.11
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.02
252	0.02
253	0.02
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.07
284	0.15
285	0.24
286	0.28
287	0.38
288	0.46
289	0.52
290	0.55
291	0.58
292	0.57
293	0.56
294	0.57
295	0.54
296	0.52
297	0.49
298	0.49
299	0.48
300	0.45
301	0.41
302	0.41
303	0.43
304	0.44
305	0.45
306	0.51
307	0.52
308	0.55
309	0.54
310	0.5
311	0.42
312	0.34
313	0.3
314	0.2
315	0.16
316	0.1
317	0.08
318	0.13
319	0.16
320	0.18
321	0.23
322	0.28
323	0.35
324	0.44
325	0.52
326	0.56
327	0.61
328	0.66
329	0.68
330	0.71
331	0.65
332	0.57
333	0.49
334	0.4
335	0.34
336	0.26
337	0.19
338	0.13
339	0.12
340	0.12
341	0.12
342	0.15
343	0.21
344	0.29
345	0.37
346	0.44
347	0.53
348	0.6
349	0.69
350	0.72
351	0.75
352	0.73
353	0.7
354	0.65
355	0.58
356	0.49
357	0.39
358	0.32
359	0.22
360	0.16
361	0.11
362	0.07
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.07
368	0.11
369	0.15
370	0.21
371	0.28
372	0.34
373	0.42
374	0.52
375	0.58
376	0.65
377	0.72
378	0.77
379	0.79
380	0.84
381	0.85
382	0.85
383	0.78
384	0.68
385	0.6
386	0.49
387	0.4
388	0.29
389	0.2
390	0.12
391	0.1
392	0.09
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.15
403	0.16
404	0.16
405	0.18
406	0.18
407	0.16
408	0.16
409	0.17
410	0.12
411	0.12
412	0.1
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.03
422	0.04
423	0.04
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.1
428	0.17
429	0.22
430	0.29
431	0.36
432	0.43
433	0.5
434	0.58
435	0.63
436	0.66
437	0.71
438	0.75
439	0.77
440	0.75
441	0.75
442	0.67
443	0.6
444	0.49
445	0.4
446	0.29
447	0.2
448	0.14
449	0.06
450	0.05
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.05
459	0.06
460	0.08
461	0.1
462	0.14
463	0.17
464	0.23
465	0.32
466	0.38
467	0.47
468	0.56
469	0.64
470	0.68
471	0.74
472	0.75
473	0.76
474	0.8
475	0.72
476	0.63
477	0.61
478	0.52
479	0.51
480	0.48
481	0.39
482	0.32
483	0.37
484	0.37
485	0.32
486	0.31
487	0.24
488	0.22
489	0.26
490	0.25
491	0.19
492	0.18
493	0.17
494	0.17
495	0.17
496	0.15
497	0.11
498	0.09
499	0.08
500	0.08
501	0.06
502	0.05
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.08
507	0.08
508	0.13
509	0.21
510	0.31
511	0.4
512	0.51
513	0.61
514	0.7
515	0.81
516	0.87
517	0.9
518	0.92
519	0.93
520	0.93
521	0.93
522	0.89
523	0.87
524	0.79
525	0.7
526	0.59
527	0.47
528	0.37
529	0.26
530	0.18
531	0.09
532	0.05
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.03
541	0.04
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.07
546	0.08
547	0.1
548	0.15
549	0.17
550	0.26
551	0.35
552	0.35
553	0.44
554	0.49
555	0.57
556	0.63
557	0.7
558	0.71
559	0.74
560	0.85
561	0.87
562	0.89
563	0.83
564	0.82
565	0.82
566	0.78
567	0.78
568	0.77
569	0.78
570	0.8
571	0.85
572	0.84
573	0.84
574	0.84
575	0.78
576	0.76
577	0.72
578	0.64
579	0.6
580	0.56
581	0.57
582	0.54
583	0.52

A0A550BWM4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer