Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DJ67

Protein Details
Accession C5DJ67    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-313EKELHRKRYPDYKYIPRKSRAGKRQRKDGCEFCKRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-304HRKRYPDYKYIPRKSRAGKRQRK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG lth:KLTH0F13926g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MNQHDYTRMASPASVQLPSISTLLRSVDHDHVTGNPFSAAGPRPSLGPGPSPAQLPVVLPAWGSGAHAAPMHPGVRPPAHLHFPPAHVQRPPTPHSHLHSQSTPRATGDDLSGVPRSHALTPLAPHMLAPLLAPLAPLAPLTPPPALGRVSTSSSVPSSGSSSMSGPSSVHSCSEDVSAAHMHSHSRSHSTDAAAAAPLKCVCRNNTKTGHHIPRPRNAFILFRQHLHQQLFAKQSSYCENAEASFKTNSQISREIGQRWRELTDDDRRHWQDLAAKEKELHRKRYPDYKYIPRKSRAGKRQRKDGCEFCKRGGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.2
4 0.2
5 0.22
6 0.2
7 0.14
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.19
14 0.23
15 0.25
16 0.25
17 0.24
18 0.26
19 0.28
20 0.26
21 0.22
22 0.17
23 0.15
24 0.14
25 0.18
26 0.18
27 0.17
28 0.19
29 0.18
30 0.19
31 0.21
32 0.23
33 0.2
34 0.2
35 0.21
36 0.22
37 0.23
38 0.23
39 0.22
40 0.21
41 0.2
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.13
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.15
62 0.16
63 0.18
64 0.22
65 0.24
66 0.29
67 0.29
68 0.32
69 0.31
70 0.32
71 0.38
72 0.38
73 0.37
74 0.34
75 0.37
76 0.38
77 0.42
78 0.42
79 0.39
80 0.4
81 0.41
82 0.43
83 0.49
84 0.47
85 0.45
86 0.48
87 0.47
88 0.47
89 0.45
90 0.41
91 0.32
92 0.29
93 0.25
94 0.21
95 0.17
96 0.14
97 0.11
98 0.12
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.17
110 0.16
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.11
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.11
172 0.1
173 0.14
174 0.15
175 0.17
176 0.19
177 0.19
178 0.2
179 0.19
180 0.18
181 0.15
182 0.15
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.13
188 0.15
189 0.17
190 0.27
191 0.31
192 0.37
193 0.45
194 0.47
195 0.52
196 0.6
197 0.65
198 0.62
199 0.67
200 0.64
201 0.64
202 0.67
203 0.61
204 0.54
205 0.47
206 0.44
207 0.4
208 0.45
209 0.38
210 0.34
211 0.35
212 0.35
213 0.39
214 0.36
215 0.36
216 0.28
217 0.33
218 0.35
219 0.34
220 0.32
221 0.26
222 0.27
223 0.27
224 0.27
225 0.22
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.21
230 0.2
231 0.19
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.2
236 0.21
237 0.22
238 0.25
239 0.24
240 0.28
241 0.31
242 0.36
243 0.4
244 0.43
245 0.42
246 0.39
247 0.39
248 0.35
249 0.34
250 0.35
251 0.39
252 0.41
253 0.4
254 0.48
255 0.5
256 0.51
257 0.49
258 0.45
259 0.41
260 0.42
261 0.48
262 0.41
263 0.39
264 0.4
265 0.46
266 0.54
267 0.55
268 0.56
269 0.56
270 0.62
271 0.67
272 0.74
273 0.74
274 0.73
275 0.74
276 0.76
277 0.79
278 0.81
279 0.83
280 0.79
281 0.81
282 0.81
283 0.83
284 0.83
285 0.84
286 0.84
287 0.84
288 0.89
289 0.89
290 0.87
291 0.86
292 0.85
293 0.84
294 0.84
295 0.79