FuNGI

A0A550CS30

Protein Details

Accession

A0A550CS30

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
37-73	ERPADSSFKPRVKKRARQRKRTKTDKPKPQDDDQNLF	Hydrophilic
380-404	ETRGKASSSKPRERKPEVRKPEIHI	Basic
439-467	DDMSGRHNRSRRSRQNNRDKRGRGRDEED	Basic
484-511	DSRAREKRGGYQKPSSKPPRNPPRSSGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
45-64	KPRVKKRARQRKRTKTDKPK
383-405	GKASSSKPRERKPEVRKPEIHIK
447-461	RSRRSRQNNRDKRGR
487-520	AREKRGGYQKPSSKPPRNPPRSSGGAPRSRGNGP

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MSATGTATMLKGEVIDLTGDDDDADMDEEHPLSEAEERPADSSFKPRVKKRARQRKRTKTDKPKPQDDDQNLFVLDSQPAEVPSHLALKAPIVESKESTLLLPEHVIVLDENVEILRPPTPEKMDDDFEVEYLSFADDSTRGMPRYFAPEEDMKRTIVCKNCGAEGDHDTRSCTVKICMTCGARNEHYTSGCPVNKSCFACGLRGHLVSDCPNKYSRNPAKFGDTCHRCDSRLHISQECPLMWRQYSYKSFSERDETLKARAKLENAQFGQGGEAYIARDEFCYQCGEAGHWGDHCSQSGKRKYPEPSAFSNEHILSGPFAETQLDRPKASRPATRSAYNDTREYSVGKAAKKKSMAANRDHAQRQSDRIDEDDWFARQETRGKASSSKPRERKPEVRKPEIHIKGVSRRDRDEELLQPSRMGYDGRQATGRYDGDSDDDMSGRHNRSRRSRQNNRDKRGRGRDEEDDWDLHIRVDDLPQPYEDSRAREKRGGYQKPSSKPPRNPPRSSGGAPRSRGNGPAAASGSGTANRPRYKGGYTRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.07
4	0.09
5	0.09
6	0.09
7	0.09
8	0.08
9	0.08
10	0.08
11	0.09
12	0.07
13	0.08
14	0.09
15	0.09
16	0.09
17	0.1
18	0.09
19	0.09
20	0.12
21	0.14
22	0.17
23	0.19
24	0.2
25	0.21
26	0.22
27	0.24
28	0.22
29	0.28
30	0.33
31	0.39
32	0.46
33	0.53
34	0.62
35	0.7
36	0.79
37	0.82
38	0.84
39	0.88
40	0.9
41	0.94
42	0.95
43	0.95
44	0.96
45	0.96
46	0.96
47	0.95
48	0.95
49	0.94
50	0.93
51	0.89
52	0.86
53	0.86
54	0.82
55	0.78
56	0.69
57	0.62
58	0.51
59	0.44
60	0.36
61	0.27
62	0.2
63	0.14
64	0.12
65	0.1
66	0.11
67	0.12
68	0.12
69	0.12
70	0.13
71	0.15
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.14
76	0.17
77	0.16
78	0.17
79	0.17
80	0.19
81	0.19
82	0.21
83	0.21
84	0.19
85	0.18
86	0.18
87	0.15
88	0.15
89	0.14
90	0.12
91	0.11
92	0.1
93	0.11
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.07
98	0.07
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.08
104	0.09
105	0.11
106	0.16
107	0.19
108	0.21
109	0.27
110	0.3
111	0.31
112	0.31
113	0.31
114	0.26
115	0.23
116	0.22
117	0.16
118	0.12
119	0.09
120	0.09
121	0.06
122	0.05
123	0.06
124	0.06
125	0.07
126	0.1
127	0.13
128	0.13
129	0.13
130	0.15
131	0.16
132	0.23
133	0.23
134	0.21
135	0.22
136	0.28
137	0.31
138	0.35
139	0.35
140	0.28
141	0.27
142	0.29
143	0.3
144	0.3
145	0.3
146	0.29
147	0.29
148	0.31
149	0.32
150	0.31
151	0.29
152	0.28
153	0.29
154	0.27
155	0.25
156	0.25
157	0.24
158	0.25
159	0.22
160	0.19
161	0.16
162	0.19
163	0.19
164	0.21
165	0.25
166	0.25
167	0.27
168	0.29
169	0.33
170	0.3
171	0.31
172	0.32
173	0.29
174	0.27
175	0.26
176	0.26
177	0.27
178	0.27
179	0.26
180	0.24
181	0.25
182	0.3
183	0.3
184	0.28
185	0.28
186	0.27
187	0.28
188	0.28
189	0.29
190	0.26
191	0.25
192	0.25
193	0.19
194	0.19
195	0.21
196	0.27
197	0.22
198	0.21
199	0.23
200	0.24
201	0.25
202	0.35
203	0.39
204	0.4
205	0.43
206	0.42
207	0.48
208	0.47
209	0.5
210	0.5
211	0.45
212	0.42
213	0.44
214	0.44
215	0.37
216	0.37
217	0.38
218	0.36
219	0.39
220	0.39
221	0.36
222	0.36
223	0.38
224	0.39
225	0.33
226	0.26
227	0.2
228	0.19
229	0.16
230	0.17
231	0.15
232	0.2
233	0.24
234	0.27
235	0.29
236	0.31
237	0.32
238	0.32
239	0.35
240	0.3
241	0.3
242	0.3
243	0.28
244	0.29
245	0.34
246	0.33
247	0.31
248	0.31
249	0.29
250	0.31
251	0.33
252	0.35
253	0.28
254	0.28
255	0.26
256	0.24
257	0.22
258	0.16
259	0.13
260	0.06
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.07
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.11
277	0.1
278	0.09
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.11
283	0.12
284	0.14
285	0.22
286	0.29
287	0.33
288	0.35
289	0.41
290	0.45
291	0.52
292	0.56
293	0.52
294	0.49
295	0.49
296	0.48
297	0.43
298	0.43
299	0.33
300	0.27
301	0.23
302	0.18
303	0.12
304	0.11
305	0.1
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.1
311	0.18
312	0.2
313	0.2
314	0.21
315	0.25
316	0.32
317	0.36
318	0.37
319	0.34
320	0.4
321	0.44
322	0.48
323	0.46
324	0.46
325	0.49
326	0.46
327	0.44
328	0.37
329	0.34
330	0.31
331	0.29
332	0.23
333	0.21
334	0.23
335	0.24
336	0.3
337	0.32
338	0.36
339	0.37
340	0.39
341	0.42
342	0.47
343	0.49
344	0.47
345	0.52
346	0.52
347	0.58
348	0.57
349	0.51
350	0.46
351	0.43
352	0.42
353	0.38
354	0.35
355	0.29
356	0.28
357	0.27
358	0.24
359	0.24
360	0.21
361	0.18
362	0.16
363	0.16
364	0.15
365	0.16
366	0.21
367	0.22
368	0.24
369	0.26
370	0.27
371	0.32
372	0.38
373	0.47
374	0.5
375	0.57
376	0.61
377	0.66
378	0.73
379	0.78
380	0.81
381	0.81
382	0.82
383	0.82
384	0.83
385	0.8
386	0.77
387	0.79
388	0.74
389	0.67
390	0.6
391	0.56
392	0.56
393	0.6
394	0.6
395	0.54
396	0.51
397	0.52
398	0.52
399	0.51
400	0.47
401	0.43
402	0.44
403	0.45
404	0.42
405	0.37
406	0.33
407	0.3
408	0.25
409	0.21
410	0.13
411	0.17
412	0.2
413	0.21
414	0.23
415	0.23
416	0.24
417	0.29
418	0.28
419	0.21
420	0.2
421	0.19
422	0.19
423	0.2
424	0.2
425	0.15
426	0.14
427	0.13
428	0.15
429	0.2
430	0.21
431	0.25
432	0.29
433	0.36
434	0.47
435	0.58
436	0.66
437	0.71
438	0.79
439	0.85
440	0.91
441	0.94
442	0.93
443	0.92
444	0.89
445	0.89
446	0.89
447	0.86
448	0.83
449	0.78
450	0.76
451	0.7
452	0.68
453	0.61
454	0.5
455	0.43
456	0.38
457	0.32
458	0.25
459	0.2
460	0.15
461	0.13
462	0.15
463	0.19
464	0.19
465	0.2
466	0.21
467	0.24
468	0.24
469	0.29
470	0.29
471	0.3
472	0.37
473	0.44
474	0.49
475	0.5
476	0.52
477	0.56
478	0.63
479	0.67
480	0.64
481	0.67
482	0.7
483	0.73
484	0.81
485	0.82
486	0.81
487	0.81
488	0.85
489	0.86
490	0.87
491	0.86
492	0.81
493	0.78
494	0.76
495	0.71
496	0.7
497	0.68
498	0.67
499	0.63
500	0.62
501	0.59
502	0.53
503	0.52
504	0.45
505	0.39
506	0.32
507	0.35
508	0.32
509	0.28
510	0.26
511	0.24
512	0.22
513	0.2
514	0.21
515	0.22
516	0.29
517	0.32
518	0.34
519	0.38
520	0.4
521	0.45

A0A550CS30

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer