Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CM49

Protein Details
Accession A0A550CM49    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-32AKVTTLIRRRLKARRLPASMIQKRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MSMFNYDEAKVTTLIRRRLKARRLPASMIQKRVEAYTFVASKLLEHAAKAYSLMGEDTSRRDEFAAACASELERWADFVVEGQAEDAGKTSNDEHKCALPATLSRGRRPLLEEYFKLNAYPNTGDKQAMADQEGGTYRQIHIWFQNRRARAKAQGINLQPRSLPPSSSTTTIFDQAWQAAAVNAHGESDELDLPGLKSEQRDEYHESGLWDTDNSGGLAIHIPLSSSVDVHHRHDHIASTPSRSRRDPRPPVYMDDLTTSFDAMTVRDAKSKLAPDAPKGYAARDAITYICPKAPLPSFVSDELLPRAPPKIVTRLDITTRKLAGLPKGKPAVRRTRLPSVSPSSSRSSSKLSDRVPSLTFSDDSDDSSSPSPESLPAPELYSSPPPAFSYSPLPPSPPSISIATGLTTSDLSITRWREDPGAEGDDEDDFWDRGYRFNHDADFDTSLLAQAKTRFTMPASKSSRPARTTERTITPPMPAASPVPPHPPISSPAPSTFMETMSDADAEALLAELFGEGTANVDDGTIMLLGREEVALDDLDVDHANAGKLEIQSGSWSDIEWPPRAPLFSFGPVQTTLAAASPEEGKANEQQQAGNAAPTAAELSVESASSTQVTMGWDPQQIPSMNGSAFGKSFTPSAFDGIIASNWNLESQAEYTPNPSTLFGKPGLEVNVISTLSMPEASSSDAALPKASSVFTFDTSSTQTPFSFGSSPAVEGETTPKASAFGPSAVPSRTQAVSTSPPAAAPPSSETFGSALPQSPLSFTTLTAWSSTASAAMSGPTTTATTTRAISSKPESSSSTFAFGKSPSTNFSFGAPSSQATEAKPAPTPVAFGTSSVNNSFDFSATVSTARSSNASSSFTFGVGSQGAFNFAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.45
3 0.5
4 0.57
5 0.66
6 0.73
7 0.76
8 0.79
9 0.8
10 0.79
11 0.79
12 0.79
13 0.8
14 0.78
15 0.75
16 0.66
17 0.58
18 0.53
19 0.49
20 0.42
21 0.32
22 0.28
23 0.28
24 0.28
25 0.25
26 0.26
27 0.23
28 0.22
29 0.23
30 0.25
31 0.18
32 0.17
33 0.19
34 0.18
35 0.19
36 0.19
37 0.16
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.11
42 0.12
43 0.14
44 0.17
45 0.22
46 0.21
47 0.21
48 0.22
49 0.23
50 0.21
51 0.24
52 0.25
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.2
57 0.18
58 0.18
59 0.16
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.1
77 0.13
78 0.2
79 0.23
80 0.25
81 0.27
82 0.29
83 0.31
84 0.3
85 0.28
86 0.22
87 0.22
88 0.28
89 0.34
90 0.35
91 0.37
92 0.42
93 0.42
94 0.41
95 0.43
96 0.44
97 0.45
98 0.48
99 0.46
100 0.47
101 0.49
102 0.46
103 0.42
104 0.37
105 0.29
106 0.27
107 0.28
108 0.26
109 0.26
110 0.27
111 0.27
112 0.24
113 0.26
114 0.25
115 0.23
116 0.21
117 0.2
118 0.18
119 0.2
120 0.21
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.14
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.25
129 0.33
130 0.39
131 0.47
132 0.53
133 0.54
134 0.58
135 0.6
136 0.58
137 0.57
138 0.6
139 0.57
140 0.56
141 0.58
142 0.6
143 0.65
144 0.62
145 0.54
146 0.45
147 0.41
148 0.41
149 0.34
150 0.29
151 0.22
152 0.26
153 0.28
154 0.3
155 0.3
156 0.27
157 0.28
158 0.29
159 0.27
160 0.21
161 0.21
162 0.18
163 0.17
164 0.14
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.12
186 0.18
187 0.2
188 0.24
189 0.3
190 0.32
191 0.33
192 0.34
193 0.32
194 0.27
195 0.25
196 0.21
197 0.14
198 0.12
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.09
215 0.14
216 0.17
217 0.21
218 0.26
219 0.24
220 0.26
221 0.26
222 0.27
223 0.24
224 0.28
225 0.26
226 0.27
227 0.32
228 0.37
229 0.4
230 0.43
231 0.46
232 0.5
233 0.59
234 0.63
235 0.64
236 0.67
237 0.66
238 0.66
239 0.67
240 0.59
241 0.49
242 0.41
243 0.35
244 0.28
245 0.25
246 0.2
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.08
251 0.1
252 0.12
253 0.13
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.22
258 0.24
259 0.23
260 0.27
261 0.28
262 0.29
263 0.34
264 0.34
265 0.34
266 0.32
267 0.31
268 0.28
269 0.26
270 0.23
271 0.18
272 0.18
273 0.13
274 0.15
275 0.16
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.2
284 0.22
285 0.24
286 0.24
287 0.26
288 0.22
289 0.22
290 0.21
291 0.18
292 0.15
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.14
297 0.16
298 0.22
299 0.22
300 0.25
301 0.27
302 0.29
303 0.35
304 0.37
305 0.36
306 0.32
307 0.31
308 0.29
309 0.28
310 0.28
311 0.29
312 0.33
313 0.32
314 0.34
315 0.39
316 0.41
317 0.44
318 0.49
319 0.53
320 0.5
321 0.55
322 0.55
323 0.59
324 0.6
325 0.57
326 0.55
327 0.51
328 0.5
329 0.45
330 0.43
331 0.37
332 0.37
333 0.36
334 0.32
335 0.3
336 0.29
337 0.32
338 0.35
339 0.32
340 0.34
341 0.34
342 0.35
343 0.32
344 0.3
345 0.26
346 0.21
347 0.19
348 0.16
349 0.17
350 0.14
351 0.14
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.14
356 0.13
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.14
370 0.15
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.15
375 0.15
376 0.14
377 0.17
378 0.18
379 0.22
380 0.21
381 0.22
382 0.2
383 0.24
384 0.24
385 0.2
386 0.2
387 0.17
388 0.17
389 0.16
390 0.16
391 0.13
392 0.11
393 0.1
394 0.08
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.14
404 0.15
405 0.15
406 0.15
407 0.16
408 0.15
409 0.15
410 0.14
411 0.13
412 0.12
413 0.11
414 0.11
415 0.09
416 0.07
417 0.05
418 0.05
419 0.08
420 0.08
421 0.11
422 0.12
423 0.15
424 0.16
425 0.18
426 0.19
427 0.17
428 0.19
429 0.18
430 0.19
431 0.15
432 0.13
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.19
445 0.19
446 0.27
447 0.32
448 0.34
449 0.39
450 0.44
451 0.49
452 0.43
453 0.45
454 0.43
455 0.43
456 0.47
457 0.46
458 0.44
459 0.41
460 0.43
461 0.4
462 0.33
463 0.3
464 0.25
465 0.2
466 0.17
467 0.15
468 0.14
469 0.15
470 0.15
471 0.18
472 0.19
473 0.2
474 0.2
475 0.2
476 0.2
477 0.24
478 0.25
479 0.22
480 0.21
481 0.24
482 0.23
483 0.25
484 0.23
485 0.18
486 0.16
487 0.15
488 0.14
489 0.11
490 0.11
491 0.07
492 0.07
493 0.06
494 0.05
495 0.04
496 0.03
497 0.02
498 0.02
499 0.02
500 0.02
501 0.02
502 0.02
503 0.02
504 0.02
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.04
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.04
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.07
536 0.07
537 0.08
538 0.08
539 0.07
540 0.08
541 0.09
542 0.11
543 0.08
544 0.08
545 0.1
546 0.13
547 0.16
548 0.16
549 0.16
550 0.16
551 0.17
552 0.17
553 0.15
554 0.16
555 0.17
556 0.18
557 0.2
558 0.18
559 0.2
560 0.19
561 0.19
562 0.16
563 0.12
564 0.1
565 0.08
566 0.09
567 0.06
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.09
574 0.12
575 0.15
576 0.18
577 0.18
578 0.18
579 0.18
580 0.22
581 0.2
582 0.17
583 0.14
584 0.1
585 0.09
586 0.09
587 0.08
588 0.05
589 0.05
590 0.04
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.05
600 0.06
601 0.07
602 0.08
603 0.1
604 0.12
605 0.14
606 0.14
607 0.15
608 0.19
609 0.18
610 0.18
611 0.18
612 0.18
613 0.16
614 0.17
615 0.17
616 0.13
617 0.13
618 0.12
619 0.11
620 0.1
621 0.11
622 0.1
623 0.12
624 0.11
625 0.13
626 0.12
627 0.12
628 0.12
629 0.12
630 0.12
631 0.1
632 0.1
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.07
637 0.07
638 0.08
639 0.08
640 0.11
641 0.12
642 0.12
643 0.15
644 0.16
645 0.17
646 0.17
647 0.16
648 0.17
649 0.17
650 0.2
651 0.19
652 0.19
653 0.18
654 0.2
655 0.21
656 0.19
657 0.17
658 0.15
659 0.17
660 0.16
661 0.15
662 0.12
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.08
667 0.06
668 0.07
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.1
673 0.12
674 0.12
675 0.12
676 0.11
677 0.11
678 0.11
679 0.11
680 0.09
681 0.11
682 0.13
683 0.15
684 0.16
685 0.16
686 0.18
687 0.21
688 0.23
689 0.2
690 0.2
691 0.17
692 0.17
693 0.17
694 0.18
695 0.16
696 0.15
697 0.18
698 0.17
699 0.18
700 0.17
701 0.17
702 0.14
703 0.13
704 0.17
705 0.16
706 0.16
707 0.15
708 0.15
709 0.15
710 0.15
711 0.17
712 0.15
713 0.14
714 0.15
715 0.17
716 0.2
717 0.2
718 0.21
719 0.2
720 0.21
721 0.2
722 0.19
723 0.18
724 0.2
725 0.24
726 0.26
727 0.27
728 0.23
729 0.22
730 0.23
731 0.23
732 0.19
733 0.16
734 0.18
735 0.18
736 0.2
737 0.2
738 0.2
739 0.19
740 0.19
741 0.19
742 0.15
743 0.14
744 0.14
745 0.16
746 0.15
747 0.14
748 0.15
749 0.16
750 0.16
751 0.14
752 0.17
753 0.17
754 0.18
755 0.17
756 0.17
757 0.14
758 0.14
759 0.14
760 0.11
761 0.08
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.08
766 0.07
767 0.08
768 0.08
769 0.08
770 0.09
771 0.1
772 0.11
773 0.12
774 0.14
775 0.17
776 0.18
777 0.18
778 0.23
779 0.28
780 0.32
781 0.32
782 0.35
783 0.35
784 0.37
785 0.41
786 0.38
787 0.37
788 0.32
789 0.3
790 0.29
791 0.25
792 0.27
793 0.26
794 0.26
795 0.25
796 0.28
797 0.3
798 0.28
799 0.3
800 0.27
801 0.24
802 0.27
803 0.24
804 0.21
805 0.22
806 0.25
807 0.24
808 0.22
809 0.28
810 0.26
811 0.27
812 0.29
813 0.27
814 0.27
815 0.25
816 0.26
817 0.21
818 0.24
819 0.21
820 0.2
821 0.22
822 0.21
823 0.24
824 0.24
825 0.24
826 0.19
827 0.21
828 0.21
829 0.18
830 0.15
831 0.13
832 0.14
833 0.14
834 0.14
835 0.13
836 0.14
837 0.14
838 0.15
839 0.15
840 0.15
841 0.18
842 0.21
843 0.24
844 0.23
845 0.26
846 0.25
847 0.24
848 0.22
849 0.18
850 0.18
851 0.16
852 0.15
853 0.13
854 0.13