Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CF58

Protein Details
Accession A0A550CF58    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-33VQPVQPVRRSERVRRQKEAGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, cyto_nucl 5.5, nucl 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Amino Acid Sequences MTRRRAAKRQGTPVQPVQPVRRSERVRRQKEAGAHRAAQEATERAAKIADRKSDGQSDSSSTSHTSEETASTSSDEEEKDTLSGRDLTYGHLRAIGALAATISAQGNIDGSTPRPPREPLIRISPLGEMCVITLFDNGNGTVQDMHVMGRTAAAAVVVGLEIVMGLQPDTLHLDTRLNRVFVEIAIHTAYDRFKCAFFPKIEDLQRLLRALRQQPITSAEGDRLLRRRDEFLHHEKVFPRAVRQFHFVPFSTWSENIPITCRTAVDEQEYRTYRAPFTAGPNNNEEALPIIKMHCSPYFVVWQAYVALSKPGTQAPVYVQHEARGDQFARASFPRSSVLLLAQNAVQSLLPGSTLVSQVEALLGSHRIQDATDLADQQRKKVEGNIRINEDEARSLAALRAPLRIGWQLFSETLFEDAGKNLFNGDTDPRLLIDYYPDLRGNLCTSDDALDVFSGVAEHMPSEARVDDIKTTPRTSRRTRPARLPRSESYLRKCWIRRCVDPKAVPGSHPSYPVVDTVYAKILAINAKTSELAALIQDERSEIVATEIEPVLIQHSQFDALTTLYQRHGDARKLLELYSKVADGEYQTDQIRDPWGSITTLLAAQKDRALTQQWALWMIKRDPERGLKLLMPARDTGKRREKPEEELALLEQVTEASKEAGHFLEYLVLQRRSSSRELHSRLANLLVDNLLDSAGDASTLRLWQAKARSFATSHDVSFLRYFAATTPESRTKQDRLKAAFFLQRSDLYDCAAVRERLPAQSQWAALFAVEIAILDGKVITDKPSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.73
3 0.7
4 0.68
5 0.66
6 0.66
7 0.65
8 0.66
9 0.66
10 0.7
11 0.75
12 0.78
13 0.79
14 0.8
15 0.79
16 0.77
17 0.78
18 0.78
19 0.75
20 0.72
21 0.66
22 0.6
23 0.58
24 0.51
25 0.43
26 0.36
27 0.29
28 0.24
29 0.26
30 0.24
31 0.2
32 0.23
33 0.23
34 0.27
35 0.32
36 0.36
37 0.37
38 0.4
39 0.45
40 0.5
41 0.5
42 0.45
43 0.41
44 0.38
45 0.36
46 0.33
47 0.3
48 0.24
49 0.24
50 0.21
51 0.19
52 0.17
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.15
70 0.18
71 0.15
72 0.19
73 0.18
74 0.22
75 0.27
76 0.28
77 0.25
78 0.25
79 0.24
80 0.2
81 0.21
82 0.17
83 0.1
84 0.08
85 0.08
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.18
99 0.22
100 0.24
101 0.27
102 0.29
103 0.34
104 0.43
105 0.46
106 0.42
107 0.48
108 0.5
109 0.48
110 0.47
111 0.44
112 0.35
113 0.31
114 0.27
115 0.17
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.16
161 0.19
162 0.26
163 0.28
164 0.25
165 0.25
166 0.25
167 0.25
168 0.2
169 0.2
170 0.14
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.12
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.17
182 0.21
183 0.26
184 0.25
185 0.31
186 0.33
187 0.4
188 0.43
189 0.43
190 0.42
191 0.39
192 0.4
193 0.36
194 0.31
195 0.26
196 0.3
197 0.32
198 0.35
199 0.34
200 0.32
201 0.32
202 0.36
203 0.35
204 0.3
205 0.26
206 0.2
207 0.21
208 0.22
209 0.24
210 0.25
211 0.26
212 0.27
213 0.28
214 0.3
215 0.3
216 0.35
217 0.39
218 0.42
219 0.49
220 0.46
221 0.48
222 0.46
223 0.47
224 0.45
225 0.37
226 0.36
227 0.32
228 0.36
229 0.35
230 0.39
231 0.37
232 0.35
233 0.38
234 0.32
235 0.29
236 0.28
237 0.28
238 0.26
239 0.24
240 0.22
241 0.2
242 0.2
243 0.19
244 0.18
245 0.16
246 0.16
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.2
253 0.22
254 0.21
255 0.29
256 0.3
257 0.3
258 0.31
259 0.31
260 0.26
261 0.24
262 0.24
263 0.18
264 0.23
265 0.29
266 0.3
267 0.31
268 0.34
269 0.33
270 0.32
271 0.3
272 0.24
273 0.17
274 0.14
275 0.11
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.12
281 0.11
282 0.13
283 0.13
284 0.15
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.15
289 0.14
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.07
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.2
304 0.22
305 0.23
306 0.23
307 0.24
308 0.25
309 0.24
310 0.23
311 0.18
312 0.16
313 0.14
314 0.15
315 0.13
316 0.15
317 0.15
318 0.17
319 0.14
320 0.15
321 0.16
322 0.15
323 0.15
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.08
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.18
366 0.17
367 0.17
368 0.22
369 0.28
370 0.33
371 0.42
372 0.43
373 0.43
374 0.43
375 0.43
376 0.37
377 0.3
378 0.21
379 0.13
380 0.1
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.12
392 0.11
393 0.1
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.1
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.13
428 0.12
429 0.11
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.08
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.07
453 0.08
454 0.09
455 0.11
456 0.16
457 0.18
458 0.2
459 0.24
460 0.31
461 0.37
462 0.42
463 0.5
464 0.56
465 0.63
466 0.66
467 0.72
468 0.76
469 0.79
470 0.79
471 0.76
472 0.68
473 0.66
474 0.69
475 0.64
476 0.59
477 0.56
478 0.52
479 0.51
480 0.54
481 0.53
482 0.55
483 0.55
484 0.57
485 0.57
486 0.64
487 0.66
488 0.64
489 0.62
490 0.6
491 0.55
492 0.47
493 0.44
494 0.4
495 0.32
496 0.31
497 0.27
498 0.21
499 0.21
500 0.21
501 0.17
502 0.14
503 0.13
504 0.13
505 0.14
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.11
512 0.12
513 0.1
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.09
518 0.08
519 0.07
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.09
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.09
540 0.08
541 0.07
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.08
547 0.08
548 0.09
549 0.1
550 0.11
551 0.11
552 0.12
553 0.12
554 0.18
555 0.21
556 0.23
557 0.27
558 0.28
559 0.3
560 0.3
561 0.3
562 0.29
563 0.26
564 0.26
565 0.23
566 0.2
567 0.16
568 0.15
569 0.15
570 0.12
571 0.14
572 0.13
573 0.14
574 0.14
575 0.15
576 0.15
577 0.16
578 0.18
579 0.14
580 0.14
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.11
587 0.13
588 0.13
589 0.13
590 0.13
591 0.13
592 0.15
593 0.15
594 0.15
595 0.15
596 0.18
597 0.18
598 0.19
599 0.2
600 0.19
601 0.22
602 0.22
603 0.23
604 0.25
605 0.24
606 0.28
607 0.29
608 0.31
609 0.32
610 0.39
611 0.41
612 0.38
613 0.39
614 0.35
615 0.39
616 0.41
617 0.38
618 0.32
619 0.29
620 0.31
621 0.36
622 0.37
623 0.41
624 0.47
625 0.52
626 0.56
627 0.64
628 0.63
629 0.63
630 0.69
631 0.65
632 0.56
633 0.51
634 0.46
635 0.37
636 0.33
637 0.25
638 0.15
639 0.1
640 0.09
641 0.08
642 0.07
643 0.06
644 0.07
645 0.08
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.1
650 0.1
651 0.13
652 0.12
653 0.16
654 0.22
655 0.23
656 0.22
657 0.25
658 0.28
659 0.29
660 0.33
661 0.34
662 0.35
663 0.44
664 0.49
665 0.52
666 0.53
667 0.5
668 0.48
669 0.45
670 0.39
671 0.29
672 0.25
673 0.19
674 0.15
675 0.13
676 0.12
677 0.08
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.06
685 0.08
686 0.08
687 0.09
688 0.12
689 0.13
690 0.18
691 0.26
692 0.31
693 0.35
694 0.37
695 0.39
696 0.37
697 0.4
698 0.41
699 0.35
700 0.3
701 0.29
702 0.28
703 0.27
704 0.27
705 0.24
706 0.19
707 0.16
708 0.16
709 0.13
710 0.18
711 0.16
712 0.18
713 0.25
714 0.32
715 0.35
716 0.39
717 0.44
718 0.47
719 0.55
720 0.59
721 0.6
722 0.59
723 0.62
724 0.61
725 0.61
726 0.6
727 0.52
728 0.48
729 0.43
730 0.39
731 0.38
732 0.37
733 0.31
734 0.26
735 0.28
736 0.25
737 0.26
738 0.29
739 0.26
740 0.24
741 0.3
742 0.3
743 0.32
744 0.36
745 0.32
746 0.33
747 0.36
748 0.37
749 0.31
750 0.3
751 0.25
752 0.21
753 0.19
754 0.13
755 0.09
756 0.07
757 0.06
758 0.05
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.06
763 0.05
764 0.08
765 0.08