Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C7D4

Protein Details
Accession A0A550C7D4    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-148SDAVDKPDKPRTRPPKPQHARADQDPNAHydrophilic
316-339EELAMKKQKRKKDIRLEKKSKAAEBasic
650-675DASAGKKRKFGKPQRVRQTKVIRQAEHydrophilic
792-839VDDKRRKYKSDDSDRPSKRRRTTDEDDTKVRKGGKRDRRDSKSDVKSDBasic
874-895ANPIGSVIGRKRKERKNKGSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-336KKQKRKKDIRLEKKSK
654-666GKKRKFGKPQRVR
795-813KRRKYKSDDSDRPSKRRRT
819-831TKVRKGGKRDRRD
882-895GRKRKERKNKGSKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSTLGKRKERDGGELDGQTDDKGPSKSTLFVSNLPYTATSVDLQTLFSDIAPVRSAFVVTQQGTGVSKGVGYVAYAIKEDAQLAYDKIALEGIKLNSRNLRVEWAGTKKHQEKDKDDTKSSDAVDKPDKPRTRPPKPQHARADQDPNAIRTIVISGLPPSIDQKTLWKKVRKYEGAESVQWPAMVEGKEDKSTGAFINAAKATKAVSKLHAHVFKGSLLSVTLKKRLDSLLAKPVKPGKDQPAAPTHASRLIVRNLPFDITEQDLRAIFLPHGPIHTVTIPEGKKGFAFVWMVSKKDAERAIEQCNGMKVTAGIAEELAMKKQKRKKDIRLEKKSKAAEAPEEDGEEDEDVEMEEENVEADHALSSKKKERVIAVDWALSKDRWEEEKAKLGEDEKSASGSDSDSDSDDEDSDSHLGVHDRDDDESEDDSDADHAEGDEEVPVKPTLPATDIGTTLFVRNVPYDATEDDMRTLFRAFGSLRYARITMDPETGRSRGTGFACFWNKEDADKVIEQSDILRAETTGAQPALKPNPFSMPSLLTPDPSSSLAQSLVLHGRTLDVVRAVTRDTADKLRDEGLKRREKADKRNAYLLREGVILPSSPRPPRSPPRPPRHACVHAFNDEVKAGGRAPLSADELEQRDEHADADAADASAGKKRKFGKPQRVRQTKVIRQAERVDAVTGRARSKGYGFIEMSTHADALRVLRWANNNSELAPLWRTWWLEEVRDLANAERKKPAGERDDTRLKRLNDELQTGSAAQKARGSLIVEFSIENVQVVKRRQERTTAGGKDGVDDKRRKYKSDDSDRPSKRRRTTDEDDTKVRKGGKRDRRDSKSDVKSDPTKSATGDVDDTPRKKARATEGATTPSENTPQKVANPIGSVIGRKRKERKNKGSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.46
3 0.39
4 0.36
5 0.29
6 0.26
7 0.21
8 0.19
9 0.19
10 0.2
11 0.22
12 0.23
13 0.27
14 0.28
15 0.33
16 0.33
17 0.36
18 0.4
19 0.39
20 0.38
21 0.35
22 0.33
23 0.26
24 0.24
25 0.21
26 0.16
27 0.13
28 0.16
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.15
33 0.13
34 0.11
35 0.15
36 0.12
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.12
44 0.16
45 0.22
46 0.21
47 0.22
48 0.2
49 0.22
50 0.22
51 0.23
52 0.19
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.1
57 0.08
58 0.07
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.16
79 0.18
80 0.23
81 0.24
82 0.28
83 0.31
84 0.35
85 0.37
86 0.33
87 0.36
88 0.31
89 0.34
90 0.38
91 0.39
92 0.42
93 0.43
94 0.52
95 0.53
96 0.59
97 0.62
98 0.63
99 0.62
100 0.66
101 0.72
102 0.69
103 0.66
104 0.63
105 0.59
106 0.56
107 0.5
108 0.48
109 0.4
110 0.39
111 0.43
112 0.46
113 0.48
114 0.54
115 0.58
116 0.57
117 0.66
118 0.7
119 0.73
120 0.77
121 0.8
122 0.82
123 0.85
124 0.89
125 0.88
126 0.87
127 0.84
128 0.8
129 0.81
130 0.72
131 0.71
132 0.64
133 0.56
134 0.47
135 0.4
136 0.32
137 0.22
138 0.21
139 0.14
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.23
151 0.31
152 0.41
153 0.49
154 0.55
155 0.58
156 0.66
157 0.77
158 0.74
159 0.71
160 0.7
161 0.71
162 0.67
163 0.65
164 0.57
165 0.5
166 0.44
167 0.37
168 0.29
169 0.19
170 0.19
171 0.16
172 0.16
173 0.17
174 0.19
175 0.2
176 0.2
177 0.2
178 0.16
179 0.18
180 0.17
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.17
185 0.18
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.17
191 0.21
192 0.18
193 0.22
194 0.26
195 0.29
196 0.38
197 0.41
198 0.39
199 0.37
200 0.36
201 0.32
202 0.29
203 0.25
204 0.17
205 0.13
206 0.15
207 0.18
208 0.2
209 0.25
210 0.25
211 0.25
212 0.27
213 0.27
214 0.3
215 0.29
216 0.31
217 0.35
218 0.4
219 0.4
220 0.42
221 0.47
222 0.44
223 0.43
224 0.44
225 0.42
226 0.44
227 0.46
228 0.47
229 0.48
230 0.49
231 0.47
232 0.43
233 0.36
234 0.32
235 0.32
236 0.29
237 0.26
238 0.26
239 0.29
240 0.28
241 0.29
242 0.25
243 0.25
244 0.24
245 0.2
246 0.18
247 0.17
248 0.17
249 0.15
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.1
256 0.1
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.15
264 0.14
265 0.12
266 0.19
267 0.18
268 0.19
269 0.19
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.17
274 0.13
275 0.14
276 0.12
277 0.2
278 0.21
279 0.22
280 0.21
281 0.22
282 0.2
283 0.23
284 0.25
285 0.19
286 0.22
287 0.25
288 0.29
289 0.31
290 0.31
291 0.27
292 0.27
293 0.25
294 0.2
295 0.16
296 0.12
297 0.09
298 0.1
299 0.09
300 0.07
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.13
307 0.14
308 0.22
309 0.28
310 0.35
311 0.44
312 0.53
313 0.62
314 0.69
315 0.79
316 0.83
317 0.88
318 0.9
319 0.85
320 0.83
321 0.74
322 0.65
323 0.57
324 0.49
325 0.42
326 0.37
327 0.34
328 0.27
329 0.25
330 0.23
331 0.2
332 0.17
333 0.12
334 0.08
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.05
351 0.07
352 0.11
353 0.18
354 0.22
355 0.24
356 0.27
357 0.29
358 0.34
359 0.36
360 0.38
361 0.33
362 0.31
363 0.3
364 0.28
365 0.27
366 0.21
367 0.18
368 0.13
369 0.14
370 0.13
371 0.17
372 0.19
373 0.21
374 0.29
375 0.29
376 0.28
377 0.27
378 0.26
379 0.25
380 0.22
381 0.21
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.12
386 0.11
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.11
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.11
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.07
461 0.06
462 0.08
463 0.07
464 0.09
465 0.14
466 0.14
467 0.15
468 0.16
469 0.17
470 0.15
471 0.16
472 0.17
473 0.14
474 0.17
475 0.17
476 0.18
477 0.2
478 0.2
479 0.19
480 0.16
481 0.16
482 0.15
483 0.16
484 0.16
485 0.15
486 0.21
487 0.24
488 0.25
489 0.25
490 0.24
491 0.23
492 0.21
493 0.22
494 0.16
495 0.16
496 0.16
497 0.16
498 0.13
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.12
503 0.1
504 0.1
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.13
515 0.18
516 0.18
517 0.18
518 0.17
519 0.22
520 0.23
521 0.24
522 0.22
523 0.19
524 0.19
525 0.24
526 0.23
527 0.19
528 0.18
529 0.18
530 0.18
531 0.16
532 0.16
533 0.1
534 0.11
535 0.1
536 0.11
537 0.1
538 0.1
539 0.12
540 0.11
541 0.11
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.12
556 0.16
557 0.17
558 0.17
559 0.18
560 0.21
561 0.25
562 0.26
563 0.32
564 0.38
565 0.45
566 0.45
567 0.49
568 0.55
569 0.57
570 0.65
571 0.67
572 0.67
573 0.63
574 0.71
575 0.69
576 0.63
577 0.59
578 0.49
579 0.39
580 0.3
581 0.26
582 0.17
583 0.15
584 0.12
585 0.1
586 0.13
587 0.17
588 0.19
589 0.22
590 0.25
591 0.33
592 0.43
593 0.51
594 0.58
595 0.64
596 0.72
597 0.79
598 0.79
599 0.78
600 0.77
601 0.75
602 0.68
603 0.65
604 0.6
605 0.52
606 0.5
607 0.44
608 0.36
609 0.28
610 0.24
611 0.17
612 0.13
613 0.1
614 0.11
615 0.1
616 0.09
617 0.1
618 0.11
619 0.13
620 0.13
621 0.13
622 0.14
623 0.15
624 0.16
625 0.15
626 0.14
627 0.13
628 0.13
629 0.13
630 0.1
631 0.09
632 0.07
633 0.09
634 0.08
635 0.07
636 0.06
637 0.07
638 0.07
639 0.11
640 0.16
641 0.15
642 0.2
643 0.26
644 0.35
645 0.46
646 0.56
647 0.62
648 0.69
649 0.79
650 0.85
651 0.9
652 0.85
653 0.84
654 0.85
655 0.81
656 0.8
657 0.79
658 0.71
659 0.66
660 0.66
661 0.6
662 0.52
663 0.45
664 0.36
665 0.27
666 0.27
667 0.27
668 0.25
669 0.22
670 0.21
671 0.21
672 0.21
673 0.22
674 0.27
675 0.24
676 0.28
677 0.27
678 0.26
679 0.26
680 0.26
681 0.27
682 0.2
683 0.18
684 0.11
685 0.11
686 0.1
687 0.11
688 0.11
689 0.11
690 0.1
691 0.14
692 0.19
693 0.22
694 0.25
695 0.28
696 0.28
697 0.27
698 0.28
699 0.25
700 0.22
701 0.21
702 0.17
703 0.15
704 0.17
705 0.17
706 0.16
707 0.22
708 0.22
709 0.22
710 0.23
711 0.25
712 0.22
713 0.23
714 0.23
715 0.19
716 0.25
717 0.26
718 0.26
719 0.28
720 0.28
721 0.3
722 0.34
723 0.39
724 0.39
725 0.44
726 0.46
727 0.5
728 0.6
729 0.58
730 0.6
731 0.6
732 0.53
733 0.51
734 0.52
735 0.52
736 0.46
737 0.49
738 0.45
739 0.38
740 0.38
741 0.33
742 0.29
743 0.24
744 0.2
745 0.16
746 0.17
747 0.16
748 0.16
749 0.18
750 0.19
751 0.17
752 0.19
753 0.19
754 0.18
755 0.17
756 0.17
757 0.16
758 0.14
759 0.12
760 0.1
761 0.12
762 0.17
763 0.2
764 0.28
765 0.35
766 0.4
767 0.42
768 0.49
769 0.52
770 0.53
771 0.6
772 0.54
773 0.49
774 0.48
775 0.45
776 0.4
777 0.42
778 0.41
779 0.4
780 0.42
781 0.46
782 0.52
783 0.55
784 0.56
785 0.57
786 0.61
787 0.63
788 0.7
789 0.73
790 0.7
791 0.78
792 0.83
793 0.85
794 0.84
795 0.83
796 0.81
797 0.81
798 0.82
799 0.8
800 0.8
801 0.82
802 0.83
803 0.8
804 0.79
805 0.74
806 0.68
807 0.63
808 0.61
809 0.55
810 0.54
811 0.58
812 0.6
813 0.67
814 0.75
815 0.81
816 0.82
817 0.85
818 0.83
819 0.83
820 0.82
821 0.78
822 0.72
823 0.69
824 0.69
825 0.66
826 0.65
827 0.58
828 0.5
829 0.44
830 0.44
831 0.38
832 0.34
833 0.32
834 0.28
835 0.32
836 0.38
837 0.38
838 0.41
839 0.44
840 0.43
841 0.43
842 0.47
843 0.49
844 0.51
845 0.55
846 0.56
847 0.56
848 0.6
849 0.59
850 0.54
851 0.46
852 0.39
853 0.41
854 0.35
855 0.32
856 0.31
857 0.32
858 0.34
859 0.38
860 0.39
861 0.35
862 0.35
863 0.33
864 0.33
865 0.32
866 0.34
867 0.35
868 0.42
869 0.43
870 0.5
871 0.59
872 0.65
873 0.75
874 0.81
875 0.85