Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CAW4

Protein Details
Accession A0A550CAW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MTRRSKSKMRARYTYNASHHHydrophilic
222-247ISPATRKERERRKKALFKRYSYRCRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-237TRKERERRKKAL
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10.5, cyto_nucl 7, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
Amino Acid Sequences MTRRSKSKMRARYTYNASHHPAPAYRNLLSTELWHSIFSYCLPATLFAVRDSCRMFRDIVDHRNGILLARAPLLLPCPPPDPRKYMRLEGPFTSRVMRDFFGITNSRAPGLYGSATYTRLLFLPGKCYMCKKITEGPPASIHSKLYLCSSSNNLENLMTVTCRSEVDVLHSHRDSLPAHVMKPDRFIVPWLPRIAYTRARRRAGVLIHDLKSARREYKMEVISPATRKERERRKKALFKRYSYRCRLSKVLFTFQCYIDDWSRKLARFEKGTTCAKSRRLDESALIKRRIPASIMHEPTTRSRRSVIRRPQGLQHIATLQLRSAALSKLRSSRRKCDHCGVVVSALRLDAHVAQYHPGQLPESRPDVETGELKYRCELCEENPLKWYTALSVQAHQYHKYVLLLVPASSFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.76
3 0.73
4 0.7
5 0.65
6 0.6
7 0.55
8 0.51
9 0.45
10 0.46
11 0.44
12 0.39
13 0.37
14 0.36
15 0.34
16 0.31
17 0.3
18 0.27
19 0.26
20 0.25
21 0.23
22 0.22
23 0.2
24 0.2
25 0.18
26 0.18
27 0.14
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.17
32 0.19
33 0.2
34 0.16
35 0.2
36 0.2
37 0.23
38 0.25
39 0.26
40 0.25
41 0.25
42 0.25
43 0.23
44 0.3
45 0.34
46 0.38
47 0.42
48 0.4
49 0.39
50 0.39
51 0.38
52 0.3
53 0.25
54 0.19
55 0.14
56 0.15
57 0.14
58 0.12
59 0.13
60 0.15
61 0.15
62 0.14
63 0.16
64 0.19
65 0.24
66 0.3
67 0.34
68 0.39
69 0.41
70 0.48
71 0.5
72 0.53
73 0.56
74 0.58
75 0.58
76 0.54
77 0.55
78 0.49
79 0.45
80 0.41
81 0.33
82 0.28
83 0.26
84 0.23
85 0.19
86 0.18
87 0.18
88 0.2
89 0.22
90 0.21
91 0.22
92 0.22
93 0.21
94 0.2
95 0.19
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.13
108 0.15
109 0.15
110 0.18
111 0.22
112 0.25
113 0.25
114 0.29
115 0.31
116 0.3
117 0.32
118 0.31
119 0.36
120 0.41
121 0.49
122 0.47
123 0.45
124 0.45
125 0.46
126 0.43
127 0.36
128 0.28
129 0.22
130 0.21
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.15
135 0.16
136 0.19
137 0.19
138 0.2
139 0.2
140 0.18
141 0.16
142 0.15
143 0.15
144 0.12
145 0.1
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.13
154 0.19
155 0.21
156 0.24
157 0.24
158 0.25
159 0.24
160 0.26
161 0.22
162 0.17
163 0.23
164 0.2
165 0.2
166 0.24
167 0.26
168 0.24
169 0.26
170 0.25
171 0.19
172 0.18
173 0.19
174 0.21
175 0.23
176 0.26
177 0.24
178 0.23
179 0.23
180 0.26
181 0.28
182 0.3
183 0.34
184 0.4
185 0.47
186 0.48
187 0.48
188 0.47
189 0.48
190 0.42
191 0.38
192 0.35
193 0.32
194 0.31
195 0.32
196 0.3
197 0.26
198 0.27
199 0.25
200 0.21
201 0.18
202 0.18
203 0.2
204 0.28
205 0.29
206 0.27
207 0.25
208 0.26
209 0.27
210 0.28
211 0.29
212 0.24
213 0.25
214 0.28
215 0.36
216 0.45
217 0.52
218 0.6
219 0.65
220 0.72
221 0.79
222 0.85
223 0.87
224 0.84
225 0.8
226 0.81
227 0.81
228 0.81
229 0.78
230 0.76
231 0.69
232 0.65
233 0.64
234 0.57
235 0.55
236 0.51
237 0.52
238 0.45
239 0.45
240 0.43
241 0.38
242 0.36
243 0.29
244 0.28
245 0.24
246 0.26
247 0.23
248 0.27
249 0.3
250 0.29
251 0.33
252 0.34
253 0.35
254 0.37
255 0.4
256 0.4
257 0.42
258 0.47
259 0.45
260 0.45
261 0.45
262 0.47
263 0.48
264 0.45
265 0.46
266 0.43
267 0.42
268 0.41
269 0.45
270 0.48
271 0.5
272 0.48
273 0.42
274 0.43
275 0.43
276 0.39
277 0.31
278 0.26
279 0.27
280 0.35
281 0.37
282 0.36
283 0.36
284 0.37
285 0.43
286 0.46
287 0.4
288 0.32
289 0.33
290 0.4
291 0.47
292 0.56
293 0.59
294 0.62
295 0.67
296 0.68
297 0.7
298 0.7
299 0.66
300 0.57
301 0.48
302 0.4
303 0.36
304 0.35
305 0.28
306 0.2
307 0.17
308 0.16
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.16
313 0.18
314 0.22
315 0.28
316 0.37
317 0.46
318 0.51
319 0.59
320 0.66
321 0.72
322 0.76
323 0.77
324 0.75
325 0.71
326 0.68
327 0.6
328 0.55
329 0.49
330 0.42
331 0.33
332 0.26
333 0.21
334 0.16
335 0.16
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.14
340 0.15
341 0.17
342 0.2
343 0.2
344 0.19
345 0.19
346 0.2
347 0.23
348 0.27
349 0.29
350 0.27
351 0.26
352 0.28
353 0.28
354 0.28
355 0.27
356 0.25
357 0.31
358 0.3
359 0.3
360 0.34
361 0.34
362 0.31
363 0.33
364 0.32
365 0.26
366 0.36
367 0.38
368 0.35
369 0.38
370 0.39
371 0.36
372 0.34
373 0.31
374 0.23
375 0.25
376 0.3
377 0.27
378 0.3
379 0.34
380 0.4
381 0.43
382 0.42
383 0.38
384 0.33
385 0.33
386 0.3
387 0.27
388 0.21
389 0.24
390 0.23
391 0.22