Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DF56

Protein Details
Accession C5DF56    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
282-301RMKVRTRQYAKKQVKWIKKMHydrophilic
391-427GEKSWNIHLKSRRHRSNLSRIKKRENLELWKKKKAKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-426KSRRHRSNLSRIKKRENLELWKKKKAK
Subcellular Location(s) mito 19.5, mito_nucl 13.5, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG lth:KLTH0D12386g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MLRWISQKLAMSAVPRPKVIVIAGTTGVGKSQLSIQLASRVSGEVINSDSMQVYKDIPIITNKHPIEERENVAHHVMNHVSWDEEYFLHRFEKECLNAIKDIHSRGKIPIIVGGTHYYLQILLEKRIEKKTRALLPEEQAILDSNEPHQLYSMLKEVDPDIASKYHPNDIRRVRRMLEIYFTTGQKPSQAFSEQKQSLVFDTLFLWVYSSPEVLEGRLDKRVDAMMESGALNEIRQLHEYYNSCNYSVDKCENGVWQVIGFKEFLPWLENADGSSFCDSVDRMKVRTRQYAKKQVKWIKKMLLPDVKSHLYALDATDLNHWDENVSQRAFSIADSFISNRIIEEPFVPPSLEDVVKNNDTESNSPKTAGDWSRQQCDICRDKDDNPLVAIGEKSWNIHLKSRRHRSNLSRIKKRENLELWKKKKAKEICADEKEAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.34
3 0.35
4 0.32
5 0.32
6 0.3
7 0.27
8 0.2
9 0.2
10 0.21
11 0.2
12 0.19
13 0.17
14 0.16
15 0.12
16 0.1
17 0.08
18 0.11
19 0.15
20 0.17
21 0.18
22 0.19
23 0.26
24 0.26
25 0.26
26 0.23
27 0.19
28 0.18
29 0.18
30 0.17
31 0.11
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.21
46 0.26
47 0.29
48 0.37
49 0.35
50 0.37
51 0.39
52 0.4
53 0.41
54 0.42
55 0.42
56 0.38
57 0.4
58 0.38
59 0.37
60 0.35
61 0.29
62 0.27
63 0.23
64 0.17
65 0.17
66 0.15
67 0.14
68 0.12
69 0.13
70 0.11
71 0.11
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.18
79 0.25
80 0.24
81 0.29
82 0.3
83 0.31
84 0.33
85 0.32
86 0.35
87 0.31
88 0.34
89 0.34
90 0.33
91 0.32
92 0.32
93 0.36
94 0.31
95 0.28
96 0.27
97 0.22
98 0.21
99 0.21
100 0.2
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.12
105 0.1
106 0.1
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.18
111 0.21
112 0.25
113 0.34
114 0.38
115 0.36
116 0.41
117 0.47
118 0.5
119 0.5
120 0.51
121 0.48
122 0.47
123 0.48
124 0.42
125 0.34
126 0.27
127 0.24
128 0.2
129 0.15
130 0.12
131 0.09
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.16
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.15
145 0.15
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.14
151 0.16
152 0.19
153 0.23
154 0.24
155 0.32
156 0.41
157 0.5
158 0.52
159 0.53
160 0.49
161 0.5
162 0.51
163 0.44
164 0.38
165 0.3
166 0.29
167 0.29
168 0.27
169 0.23
170 0.21
171 0.2
172 0.19
173 0.18
174 0.14
175 0.15
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.3
180 0.26
181 0.27
182 0.27
183 0.24
184 0.21
185 0.21
186 0.19
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.23
229 0.22
230 0.21
231 0.21
232 0.22
233 0.19
234 0.22
235 0.22
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.18
240 0.17
241 0.15
242 0.12
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.17
268 0.18
269 0.18
270 0.25
271 0.31
272 0.36
273 0.46
274 0.5
275 0.53
276 0.62
277 0.71
278 0.73
279 0.74
280 0.79
281 0.79
282 0.82
283 0.79
284 0.76
285 0.72
286 0.67
287 0.64
288 0.63
289 0.62
290 0.54
291 0.5
292 0.49
293 0.43
294 0.4
295 0.35
296 0.26
297 0.19
298 0.17
299 0.14
300 0.13
301 0.11
302 0.12
303 0.14
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.14
308 0.1
309 0.12
310 0.16
311 0.19
312 0.18
313 0.16
314 0.16
315 0.17
316 0.17
317 0.16
318 0.14
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.14
326 0.11
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.14
331 0.15
332 0.15
333 0.16
334 0.16
335 0.13
336 0.15
337 0.18
338 0.17
339 0.15
340 0.17
341 0.22
342 0.24
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.24
347 0.27
348 0.29
349 0.29
350 0.28
351 0.29
352 0.28
353 0.25
354 0.31
355 0.31
356 0.31
357 0.35
358 0.39
359 0.43
360 0.46
361 0.46
362 0.44
363 0.49
364 0.52
365 0.45
366 0.47
367 0.46
368 0.47
369 0.55
370 0.55
371 0.48
372 0.41
373 0.38
374 0.32
375 0.29
376 0.27
377 0.18
378 0.17
379 0.16
380 0.16
381 0.2
382 0.25
383 0.26
384 0.34
385 0.41
386 0.47
387 0.58
388 0.67
389 0.72
390 0.74
391 0.81
392 0.82
393 0.86
394 0.86
395 0.86
396 0.86
397 0.84
398 0.86
399 0.84
400 0.79
401 0.78
402 0.76
403 0.77
404 0.77
405 0.81
406 0.77
407 0.81
408 0.83
409 0.78
410 0.78
411 0.76
412 0.76
413 0.75
414 0.79
415 0.79
416 0.8