Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CJI6

Protein Details
Accession A0A550CJI6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-41LEALEKRKQKREVIANRRKSEVHydrophilic
319-346LPLPVPPPRPNEKRKNKKKIQEQTPAVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-337PRPNEKRKNKKK
Subcellular Location(s) cyto 7.5, cyto_nucl 7, plas 6, nucl 5.5, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPVDPRDFHARNLDANDPNLEALEKRKQKREVIANRRKSEVNTLKEEGNRLFRAGDYYAAISCYTQALNVAGNKPDPVLFSNTAAGCLKVEMYPQAERTARTALRGDHKNVKARYRRGMARMGMKRYRGAIVDFKTLIAHGHGSDEVRKALRDAEKALDDGLNTLSDEDYASDDYAYPGFDQPMDDDLEQDQSGTSDCEHAGNGIACRAYNHSGCSRGSKSCPFSHKPDKKSVRDDLGKNVCMRFLLNSCKTGAEKCAYSHTRAYLPEWGWWHNPETLEANRRFLAMYDGVRPDEVIFTDMFFDTGSAIPYEGEAATWLPLPVPPPRPNEKRKNKKKIQEQTPAVSSDVFVMLVVLEDDGFWHEIHDHLLKALRSKTTLKQATAKAQVQALLATPGLAGILVVDAGIARKANASIADELAAYVKRGGTVVIGGQFSNHITPKEMKTLTQKFGLPWTMGDYHRTTHARNPGSATVQRNPSLPKSYSMKAVHIAGADSAAALYGPTDNSRIESHVFAPEKIGKLTQYPAVHTRVGQGYLGYIGDVNGENDSTAPVLAMLGLLDAPLPSVQPAPSQPQPSTTPKASTSSSTAAPKVSTSSSTTAPRASTSSASTVPTALPSSSSSTTASSDKTIAIIALSGMLDMFESIHAHLVTSLKDKAKVVSVTTLAQAKKVLQAPAPAGVLIVDAAVTEKKYKDFVPSLVSYVGNGGSLVFAGAFSSFARPLNMNKLWKAFGMGWEAASYHRMEFEKELDHATVARNPSLPTKYSMKALQLKNIGSSGLYSEGLPESPIVHKRIRSGYLGYVGDVNGENETTPCVLAMLGLLDAELLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.41
4 0.33
5 0.3
6 0.26
7 0.23
8 0.17
9 0.19
10 0.28
11 0.35
12 0.41
13 0.5
14 0.57
15 0.63
16 0.72
17 0.77
18 0.78
19 0.8
20 0.84
21 0.85
22 0.82
23 0.79
24 0.71
25 0.64
26 0.64
27 0.62
28 0.58
29 0.55
30 0.54
31 0.55
32 0.55
33 0.56
34 0.5
35 0.48
36 0.42
37 0.36
38 0.34
39 0.3
40 0.31
41 0.27
42 0.24
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.11
52 0.09
53 0.1
54 0.1
55 0.14
56 0.18
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.22
61 0.22
62 0.22
63 0.2
64 0.19
65 0.22
66 0.22
67 0.23
68 0.28
69 0.27
70 0.29
71 0.27
72 0.24
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.11
77 0.13
78 0.13
79 0.17
80 0.2
81 0.21
82 0.27
83 0.28
84 0.28
85 0.29
86 0.34
87 0.31
88 0.31
89 0.33
90 0.33
91 0.4
92 0.46
93 0.49
94 0.5
95 0.56
96 0.61
97 0.63
98 0.67
99 0.67
100 0.68
101 0.71
102 0.69
103 0.7
104 0.67
105 0.69
106 0.65
107 0.66
108 0.67
109 0.66
110 0.64
111 0.59
112 0.57
113 0.51
114 0.48
115 0.4
116 0.36
117 0.35
118 0.33
119 0.37
120 0.34
121 0.32
122 0.29
123 0.27
124 0.24
125 0.17
126 0.15
127 0.09
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.17
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.18
137 0.23
138 0.27
139 0.27
140 0.28
141 0.3
142 0.3
143 0.3
144 0.31
145 0.24
146 0.19
147 0.17
148 0.15
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.15
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.15
176 0.14
177 0.13
178 0.11
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.15
196 0.17
197 0.17
198 0.2
199 0.21
200 0.25
201 0.26
202 0.31
203 0.31
204 0.31
205 0.35
206 0.38
207 0.41
208 0.44
209 0.51
210 0.49
211 0.55
212 0.62
213 0.66
214 0.64
215 0.7
216 0.73
217 0.72
218 0.75
219 0.72
220 0.7
221 0.69
222 0.66
223 0.65
224 0.63
225 0.58
226 0.53
227 0.47
228 0.38
229 0.3
230 0.28
231 0.21
232 0.18
233 0.24
234 0.24
235 0.25
236 0.26
237 0.27
238 0.28
239 0.26
240 0.26
241 0.2
242 0.19
243 0.19
244 0.27
245 0.27
246 0.3
247 0.31
248 0.29
249 0.3
250 0.3
251 0.31
252 0.29
253 0.27
254 0.28
255 0.28
256 0.28
257 0.27
258 0.27
259 0.27
260 0.23
261 0.22
262 0.2
263 0.22
264 0.23
265 0.3
266 0.29
267 0.29
268 0.27
269 0.27
270 0.25
271 0.21
272 0.21
273 0.16
274 0.16
275 0.17
276 0.19
277 0.19
278 0.18
279 0.18
280 0.15
281 0.13
282 0.11
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.06
308 0.08
309 0.12
310 0.19
311 0.24
312 0.29
313 0.38
314 0.47
315 0.55
316 0.65
317 0.71
318 0.76
319 0.82
320 0.87
321 0.87
322 0.88
323 0.9
324 0.89
325 0.88
326 0.87
327 0.8
328 0.73
329 0.67
330 0.59
331 0.48
332 0.37
333 0.27
334 0.18
335 0.13
336 0.09
337 0.06
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.02
344 0.02
345 0.03
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.08
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.11
357 0.11
358 0.15
359 0.17
360 0.16
361 0.17
362 0.21
363 0.24
364 0.31
365 0.34
366 0.33
367 0.37
368 0.39
369 0.42
370 0.45
371 0.43
372 0.34
373 0.31
374 0.3
375 0.24
376 0.21
377 0.15
378 0.1
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.02
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.02
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.07
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.07
426 0.09
427 0.12
428 0.14
429 0.2
430 0.2
431 0.2
432 0.29
433 0.34
434 0.34
435 0.34
436 0.34
437 0.28
438 0.31
439 0.3
440 0.21
441 0.16
442 0.17
443 0.17
444 0.17
445 0.19
446 0.17
447 0.16
448 0.21
449 0.23
450 0.2
451 0.23
452 0.31
453 0.3
454 0.3
455 0.32
456 0.29
457 0.31
458 0.34
459 0.33
460 0.29
461 0.31
462 0.31
463 0.3
464 0.3
465 0.29
466 0.3
467 0.27
468 0.27
469 0.28
470 0.28
471 0.34
472 0.33
473 0.31
474 0.28
475 0.28
476 0.25
477 0.2
478 0.19
479 0.11
480 0.1
481 0.08
482 0.06
483 0.05
484 0.03
485 0.03
486 0.02
487 0.03
488 0.03
489 0.04
490 0.04
491 0.06
492 0.06
493 0.08
494 0.09
495 0.11
496 0.12
497 0.13
498 0.14
499 0.19
500 0.2
501 0.18
502 0.21
503 0.22
504 0.22
505 0.21
506 0.21
507 0.14
508 0.15
509 0.17
510 0.2
511 0.18
512 0.19
513 0.22
514 0.25
515 0.25
516 0.23
517 0.25
518 0.21
519 0.21
520 0.18
521 0.14
522 0.11
523 0.11
524 0.11
525 0.07
526 0.05
527 0.04
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.06
536 0.05
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.03
545 0.03
546 0.03
547 0.03
548 0.03
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.04
553 0.05
554 0.06
555 0.08
556 0.1
557 0.16
558 0.2
559 0.24
560 0.24
561 0.27
562 0.32
563 0.37
564 0.4
565 0.37
566 0.35
567 0.34
568 0.37
569 0.34
570 0.31
571 0.29
572 0.26
573 0.27
574 0.27
575 0.26
576 0.23
577 0.22
578 0.2
579 0.18
580 0.17
581 0.15
582 0.16
583 0.17
584 0.2
585 0.24
586 0.24
587 0.24
588 0.23
589 0.23
590 0.21
591 0.21
592 0.19
593 0.17
594 0.19
595 0.19
596 0.2
597 0.19
598 0.17
599 0.15
600 0.15
601 0.14
602 0.11
603 0.11
604 0.11
605 0.15
606 0.16
607 0.17
608 0.17
609 0.17
610 0.19
611 0.2
612 0.19
613 0.16
614 0.16
615 0.15
616 0.14
617 0.13
618 0.1
619 0.09
620 0.07
621 0.06
622 0.06
623 0.05
624 0.05
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.05
632 0.05
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.1
637 0.11
638 0.12
639 0.15
640 0.2
641 0.19
642 0.22
643 0.23
644 0.23
645 0.28
646 0.28
647 0.26
648 0.26
649 0.25
650 0.24
651 0.26
652 0.3
653 0.24
654 0.23
655 0.22
656 0.19
657 0.23
658 0.26
659 0.26
660 0.23
661 0.26
662 0.27
663 0.29
664 0.28
665 0.22
666 0.17
667 0.15
668 0.13
669 0.09
670 0.07
671 0.04
672 0.03
673 0.05
674 0.06
675 0.06
676 0.09
677 0.11
678 0.12
679 0.15
680 0.16
681 0.23
682 0.25
683 0.27
684 0.31
685 0.31
686 0.33
687 0.32
688 0.31
689 0.24
690 0.21
691 0.19
692 0.12
693 0.11
694 0.08
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.05
703 0.05
704 0.08
705 0.09
706 0.1
707 0.13
708 0.14
709 0.18
710 0.26
711 0.32
712 0.35
713 0.37
714 0.4
715 0.4
716 0.38
717 0.39
718 0.31
719 0.28
720 0.29
721 0.26
722 0.22
723 0.21
724 0.21
725 0.18
726 0.19
727 0.16
728 0.11
729 0.15
730 0.15
731 0.17
732 0.19
733 0.22
734 0.24
735 0.24
736 0.26
737 0.22
738 0.22
739 0.21
740 0.21
741 0.23
742 0.22
743 0.23
744 0.22
745 0.23
746 0.29
747 0.32
748 0.31
749 0.31
750 0.35
751 0.35
752 0.38
753 0.41
754 0.42
755 0.47
756 0.48
757 0.52
758 0.52
759 0.5
760 0.47
761 0.44
762 0.36
763 0.27
764 0.24
765 0.18
766 0.15
767 0.14
768 0.12
769 0.13
770 0.14
771 0.14
772 0.14
773 0.12
774 0.11
775 0.17
776 0.22
777 0.25
778 0.29
779 0.32
780 0.38
781 0.45
782 0.47
783 0.45
784 0.44
785 0.44
786 0.46
787 0.44
788 0.38
789 0.33
790 0.28
791 0.26
792 0.23
793 0.18
794 0.12
795 0.12
796 0.11
797 0.1
798 0.12
799 0.11
800 0.1
801 0.09
802 0.08
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.07
807 0.06
808 0.06
809 0.05