Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550C336

Protein Details
Accession A0A550C336    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-36SAQEPASKRRRIDKKSHSRSSSPYTHydrophilic
67-126ETDHKGKSRAPEKGRYERERDWDRGKKRQRSRSRSRDRYDDRDRREHDRPRRNREYNYVNBasic
642-666AEELQPPRPRSRRPSVERQSSRAKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-25KRRRIDK
64-118KRPETDHKGKSRAPEKGRYERERDWDRGKKRQRSRSRSRDRYDDRDRREHDRPRR
591-599SKKKRGGSK
649-669RPRSRRPSVERQSSRAKTERK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR002058  PAP_assoc  
IPR002934  Polymerase_NTP_transf_dom  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0031123  P:RNA 3'-end processing  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01909  NTP_transf_2  
PF03828  PAP_assoc  
CDD cd05402  NT_PAP_TUTase  
Amino Acid Sequences MVSSVPSPPSSSAQEPASKRRRIDKKSHSRSSSPYTRQTAATITSNDDFISFADDPVLPAHLPKRPETDHKGKSRAPEKGRYERERDWDRGKKRQRSRSRSRDRYDDRDRREHDRPRRNREYNYVNDPAEYAANQRHQIAQQAPWVSGLDLASCQDAAELLHTEIKAFDAWISPTPAEDEVRSMIVLVIAKIIKDKFPDAEVRPFGSYGTKLYLPHGDIDLVVQSNTLEQNNKKTVLQRLADLIRSARLSSGKVQVIGARVPIIKFVTSAEYGRFQIDISINQFSGIVSSDIINGFQRGMQCPTAIRALVLILKLYLSQRQMNEVYTGGLGSYSIVCLVVSFLQMHPKIRNGEIDPEKNLGVLLLEFLELYGKYHNYEEVGISLRHGGQYFSKRIRGWFNYNKPRALSVEDPCDPENDVSSGSYNYFKVRQTMAGAHDILTSAAFVKTSMLNAQHNRTYASLRHGETHAADFSMLSSIVHIPQDIINHRRLVQEIYDDGRLHQLLGLAPPIVPSADTDLKQSTAAPPSTAPMNPPPPPPSSSSRARAVENTWRTADTDVSDPEVVEVERHSKRRHADDEDEDEGGRYGIGSKKKRGGSKAKTVAAIYVSDDEDSDGPLPHERSRNGKHGADVVINVDDSGYAEELQPPRPRSRRPSVERQSSRAKTERKRAYWSSLAAESGNVDEEDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.44
3 0.52
4 0.57
5 0.57
6 0.59
7 0.65
8 0.71
9 0.72
10 0.78
11 0.78
12 0.8
13 0.85
14 0.91
15 0.87
16 0.82
17 0.81
18 0.79
19 0.79
20 0.75
21 0.73
22 0.69
23 0.64
24 0.6
25 0.55
26 0.48
27 0.42
28 0.39
29 0.32
30 0.31
31 0.29
32 0.28
33 0.25
34 0.22
35 0.18
36 0.13
37 0.18
38 0.14
39 0.13
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.16
44 0.18
45 0.11
46 0.13
47 0.18
48 0.2
49 0.23
50 0.26
51 0.33
52 0.36
53 0.45
54 0.52
55 0.58
56 0.63
57 0.69
58 0.73
59 0.69
60 0.73
61 0.73
62 0.73
63 0.7
64 0.7
65 0.71
66 0.74
67 0.8
68 0.78
69 0.77
70 0.74
71 0.77
72 0.74
73 0.72
74 0.72
75 0.71
76 0.72
77 0.75
78 0.78
79 0.79
80 0.82
81 0.86
82 0.87
83 0.88
84 0.92
85 0.92
86 0.93
87 0.93
88 0.9
89 0.9
90 0.87
91 0.86
92 0.86
93 0.85
94 0.81
95 0.81
96 0.78
97 0.75
98 0.77
99 0.77
100 0.77
101 0.78
102 0.8
103 0.8
104 0.87
105 0.86
106 0.83
107 0.81
108 0.8
109 0.76
110 0.74
111 0.69
112 0.58
113 0.51
114 0.46
115 0.37
116 0.29
117 0.22
118 0.17
119 0.17
120 0.2
121 0.21
122 0.22
123 0.24
124 0.24
125 0.3
126 0.3
127 0.27
128 0.29
129 0.29
130 0.28
131 0.26
132 0.26
133 0.2
134 0.18
135 0.15
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.1
158 0.12
159 0.15
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.14
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.16
183 0.15
184 0.18
185 0.24
186 0.25
187 0.32
188 0.32
189 0.32
190 0.31
191 0.3
192 0.28
193 0.24
194 0.21
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.17
200 0.2
201 0.19
202 0.19
203 0.18
204 0.15
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.12
216 0.13
217 0.21
218 0.24
219 0.26
220 0.26
221 0.29
222 0.35
223 0.38
224 0.38
225 0.32
226 0.34
227 0.34
228 0.33
229 0.3
230 0.23
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.16
238 0.22
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.21
243 0.21
244 0.2
245 0.17
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.13
250 0.12
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.12
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.07
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.1
305 0.13
306 0.13
307 0.17
308 0.18
309 0.18
310 0.18
311 0.16
312 0.14
313 0.11
314 0.1
315 0.06
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.11
331 0.12
332 0.14
333 0.14
334 0.17
335 0.19
336 0.19
337 0.22
338 0.18
339 0.26
340 0.29
341 0.3
342 0.28
343 0.28
344 0.27
345 0.23
346 0.22
347 0.13
348 0.08
349 0.06
350 0.05
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.11
376 0.17
377 0.22
378 0.24
379 0.28
380 0.28
381 0.31
382 0.38
383 0.38
384 0.42
385 0.47
386 0.54
387 0.6
388 0.63
389 0.62
390 0.55
391 0.52
392 0.44
393 0.39
394 0.34
395 0.26
396 0.29
397 0.29
398 0.3
399 0.29
400 0.28
401 0.24
402 0.19
403 0.17
404 0.11
405 0.1
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.11
411 0.1
412 0.12
413 0.14
414 0.14
415 0.16
416 0.17
417 0.17
418 0.18
419 0.21
420 0.22
421 0.22
422 0.22
423 0.19
424 0.18
425 0.17
426 0.14
427 0.11
428 0.08
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.09
437 0.11
438 0.17
439 0.2
440 0.24
441 0.25
442 0.25
443 0.26
444 0.25
445 0.25
446 0.22
447 0.25
448 0.26
449 0.25
450 0.27
451 0.26
452 0.27
453 0.25
454 0.25
455 0.2
456 0.14
457 0.13
458 0.1
459 0.1
460 0.09
461 0.08
462 0.05
463 0.06
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.14
471 0.17
472 0.2
473 0.21
474 0.23
475 0.25
476 0.25
477 0.25
478 0.23
479 0.2
480 0.2
481 0.19
482 0.2
483 0.22
484 0.21
485 0.2
486 0.21
487 0.2
488 0.17
489 0.15
490 0.14
491 0.11
492 0.12
493 0.12
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.12
502 0.15
503 0.16
504 0.18
505 0.19
506 0.2
507 0.2
508 0.2
509 0.18
510 0.19
511 0.19
512 0.18
513 0.17
514 0.18
515 0.21
516 0.2
517 0.2
518 0.21
519 0.27
520 0.29
521 0.33
522 0.35
523 0.36
524 0.38
525 0.4
526 0.39
527 0.38
528 0.43
529 0.44
530 0.48
531 0.47
532 0.47
533 0.45
534 0.44
535 0.48
536 0.45
537 0.43
538 0.37
539 0.35
540 0.34
541 0.32
542 0.29
543 0.21
544 0.2
545 0.17
546 0.19
547 0.18
548 0.17
549 0.16
550 0.16
551 0.14
552 0.11
553 0.11
554 0.16
555 0.21
556 0.27
557 0.29
558 0.34
559 0.41
560 0.49
561 0.55
562 0.55
563 0.57
564 0.59
565 0.64
566 0.6
567 0.55
568 0.46
569 0.39
570 0.31
571 0.23
572 0.15
573 0.08
574 0.09
575 0.14
576 0.23
577 0.28
578 0.35
579 0.43
580 0.49
581 0.56
582 0.62
583 0.68
584 0.68
585 0.73
586 0.76
587 0.72
588 0.68
589 0.62
590 0.55
591 0.46
592 0.37
593 0.28
594 0.22
595 0.18
596 0.15
597 0.15
598 0.14
599 0.13
600 0.13
601 0.12
602 0.11
603 0.11
604 0.16
605 0.19
606 0.23
607 0.3
608 0.31
609 0.4
610 0.45
611 0.53
612 0.55
613 0.54
614 0.51
615 0.5
616 0.5
617 0.43
618 0.37
619 0.3
620 0.25
621 0.22
622 0.19
623 0.14
624 0.11
625 0.09
626 0.1
627 0.09
628 0.08
629 0.09
630 0.15
631 0.18
632 0.24
633 0.31
634 0.34
635 0.43
636 0.5
637 0.58
638 0.61
639 0.7
640 0.75
641 0.76
642 0.83
643 0.84
644 0.87
645 0.85
646 0.83
647 0.82
648 0.77
649 0.76
650 0.74
651 0.73
652 0.71
653 0.75
654 0.8
655 0.75
656 0.79
657 0.77
658 0.76
659 0.73
660 0.67
661 0.62
662 0.54
663 0.49
664 0.4
665 0.35
666 0.27
667 0.21
668 0.19