Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CWI2

Protein Details
Accession A0A550CWI2    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-65LTKATVARLRKRRAYTKFKWVKGHAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 9, nucl 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR026960  RVT-Znf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00075  RNase_H  
PF13966  zf-RVT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50879  RNASE_H_1  
Amino Acid Sequences MVPLQRGLSIETDSKWTIGELTNLLKCHEDTGYIGKTNVALTKATVARLRKRRAYTKFKWVKGHAGHAGNEDADRLAGEGARRDIPDEVDMNTEPSLRITGAKLPMITQALAYKAIRLRKEKQGTTRRPTATNLAQILSDTEDAFGVKLTHESVWKAIRSPIIGLECQYFLWMLTHDAYKVGTYWLKGSFNADQKRRAECAKCGAIETMHHILFDCEYTGQDLVWRLTEQLWGHTKKRWTKQSLGTVVAAGCNPHKTDKGRPMAGANRLWTILMSESAKLIWNLRCERVIQNENEEFSAAEVERRWYATIEYRLTEDRRSTSRSLGKQALDPSLVVSTWKPVINGFQSLPPEWTGDTGVLVGIKRGCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.19
7 0.17
8 0.22
9 0.25
10 0.26
11 0.26
12 0.26
13 0.24
14 0.24
15 0.21
16 0.17
17 0.16
18 0.22
19 0.26
20 0.25
21 0.25
22 0.23
23 0.23
24 0.23
25 0.24
26 0.18
27 0.15
28 0.14
29 0.21
30 0.22
31 0.24
32 0.28
33 0.32
34 0.4
35 0.49
36 0.57
37 0.58
38 0.65
39 0.72
40 0.77
41 0.81
42 0.78
43 0.8
44 0.82
45 0.8
46 0.8
47 0.74
48 0.74
49 0.67
50 0.68
51 0.64
52 0.58
53 0.52
54 0.46
55 0.43
56 0.34
57 0.29
58 0.22
59 0.14
60 0.1
61 0.09
62 0.07
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.1
67 0.12
68 0.15
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.17
73 0.19
74 0.17
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.15
88 0.17
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.2
93 0.21
94 0.19
95 0.15
96 0.13
97 0.13
98 0.15
99 0.14
100 0.15
101 0.17
102 0.22
103 0.27
104 0.31
105 0.36
106 0.43
107 0.52
108 0.54
109 0.6
110 0.66
111 0.7
112 0.72
113 0.75
114 0.68
115 0.62
116 0.59
117 0.56
118 0.49
119 0.45
120 0.39
121 0.3
122 0.27
123 0.25
124 0.23
125 0.18
126 0.14
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.11
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.17
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.08
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.09
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.15
176 0.18
177 0.25
178 0.31
179 0.32
180 0.36
181 0.38
182 0.41
183 0.4
184 0.4
185 0.35
186 0.31
187 0.36
188 0.33
189 0.3
190 0.28
191 0.26
192 0.22
193 0.2
194 0.22
195 0.18
196 0.15
197 0.14
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.08
203 0.05
204 0.05
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.13
216 0.12
217 0.16
218 0.22
219 0.25
220 0.27
221 0.31
222 0.38
223 0.43
224 0.52
225 0.56
226 0.55
227 0.59
228 0.66
229 0.71
230 0.68
231 0.62
232 0.53
233 0.45
234 0.39
235 0.32
236 0.23
237 0.14
238 0.11
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.17
243 0.2
244 0.28
245 0.37
246 0.44
247 0.44
248 0.44
249 0.47
250 0.49
251 0.51
252 0.46
253 0.38
254 0.31
255 0.29
256 0.28
257 0.22
258 0.17
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.16
268 0.16
269 0.22
270 0.26
271 0.28
272 0.29
273 0.3
274 0.34
275 0.38
276 0.41
277 0.36
278 0.4
279 0.41
280 0.4
281 0.38
282 0.34
283 0.25
284 0.19
285 0.2
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.14
294 0.17
295 0.23
296 0.29
297 0.3
298 0.29
299 0.31
300 0.35
301 0.37
302 0.38
303 0.34
304 0.32
305 0.34
306 0.38
307 0.38
308 0.42
309 0.48
310 0.5
311 0.53
312 0.55
313 0.52
314 0.52
315 0.53
316 0.48
317 0.4
318 0.35
319 0.29
320 0.24
321 0.22
322 0.18
323 0.15
324 0.14
325 0.17
326 0.19
327 0.17
328 0.17
329 0.24
330 0.26
331 0.3
332 0.28
333 0.29
334 0.32
335 0.33
336 0.33
337 0.28
338 0.26
339 0.22
340 0.22
341 0.19
342 0.15
343 0.14
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.13