FuNGI

A0A550CSX5

Protein Details

Accession

A0A550CSX5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-108	APALSHAERRRQKKKEKLEAKAAAA	Hydrophilic
401-423	SAQKREKQGKPSKEEVKEKRKVA	Basic
463-488	GDNGWPKRDARPTRPMPQGRQRPGAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
92-110	RRRQKKKEKLEAKAAAAVE
113-117	STKKR
280-300	RPAKDKAKKPEPGEQPKPWIR
356-426	RGAPHRAAEKDAEGRPAHVHKGKSAGYDRTKPKNPGSNKAAAKEASAQKREKQGKPSKEEVKEKRKVAAGL

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MSSSSSSSSASSTPDRKLSQKRKLAEAEDDSSSEAGGSSSSPSSSGSDSDSSPPSDADSDSDSEFDDASDEDDAVMHDDGDDEAPALSHAERRRQKKKEKLEAKAAAAVEGSSTKKRKLENGDVAPPTAAATTKRQNSVWVGNMLFKTTQDDLRGFFKEAGEVTRINMPIKASGRPGGAQENRGYAYVDFATPEGKAAAIALSEQPLIGRRLLIKDGDDFAGRPAPPGQDLTQMTAKTHSKTARRILSMQKQPPAPTLFLGNLSFETTEDDIRQLFEAHRPAKDKAKKPEPGEQPKPWIRKVRMATFEDSGKCKGFAFVDFETKELAEEALINPKNHHLNGRALQVQFAGAEAVRRGAPHRAAEKDAEGRPAHVHKGKSAGYDRTKPKNPGSNKAAAKEASAQKREKQGKPSKEEVKEKRKVAAGLRGNWSRDGASREEGSGHVDVGGKDARKADKYAARDEGDNGWPKRDARPTRPMPQGRQRPGAALAGAQRQSAAIVPSQGKKLTF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.41
3	0.48
4	0.58
5	0.65
6	0.67
7	0.71
8	0.71
9	0.73
10	0.77
11	0.73
12	0.7
13	0.66
14	0.59
15	0.53
16	0.48
17	0.41
18	0.33
19	0.28
20	0.19
21	0.13
22	0.09
23	0.07
24	0.07
25	0.08
26	0.09
27	0.09
28	0.1
29	0.11
30	0.13
31	0.14
32	0.15
33	0.16
34	0.17
35	0.19
36	0.23
37	0.24
38	0.24
39	0.23
40	0.22
41	0.21
42	0.2
43	0.19
44	0.17
45	0.17
46	0.18
47	0.17
48	0.18
49	0.16
50	0.15
51	0.14
52	0.12
53	0.09
54	0.07
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.07
59	0.07
60	0.08
61	0.09
62	0.09
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.08
68	0.08
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.07
74	0.07
75	0.12
76	0.16
77	0.26
78	0.34
79	0.44
80	0.54
81	0.63
82	0.73
83	0.78
84	0.86
85	0.87
86	0.89
87	0.87
88	0.87
89	0.84
90	0.76
91	0.7
92	0.59
93	0.48
94	0.38
95	0.3
96	0.2
97	0.16
98	0.16
99	0.18
100	0.2
101	0.24
102	0.28
103	0.31
104	0.38
105	0.45
106	0.52
107	0.56
108	0.6
109	0.64
110	0.61
111	0.59
112	0.5
113	0.41
114	0.31
115	0.21
116	0.16
117	0.1
118	0.15
119	0.22
120	0.27
121	0.3
122	0.29
123	0.32
124	0.36
125	0.39
126	0.37
127	0.33
128	0.29
129	0.3
130	0.3
131	0.28
132	0.24
133	0.19
134	0.19
135	0.17
136	0.19
137	0.18
138	0.18
139	0.19
140	0.23
141	0.25
142	0.22
143	0.21
144	0.19
145	0.18
146	0.18
147	0.18
148	0.16
149	0.14
150	0.14
151	0.17
152	0.18
153	0.17
154	0.17
155	0.16
156	0.19
157	0.21
158	0.21
159	0.19
160	0.21
161	0.21
162	0.21
163	0.22
164	0.25
165	0.25
166	0.26
167	0.25
168	0.25
169	0.25
170	0.24
171	0.23
172	0.15
173	0.15
174	0.12
175	0.11
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.06
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.04
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.07
194	0.09
195	0.08
196	0.09
197	0.09
198	0.12
199	0.13
200	0.14
201	0.13
202	0.13
203	0.14
204	0.14
205	0.13
206	0.11
207	0.11
208	0.14
209	0.13
210	0.12
211	0.12
212	0.12
213	0.13
214	0.15
215	0.14
216	0.17
217	0.17
218	0.19
219	0.21
220	0.21
221	0.2
222	0.23
223	0.23
224	0.18
225	0.23
226	0.25
227	0.26
228	0.32
229	0.39
230	0.4
231	0.41
232	0.44
233	0.47
234	0.51
235	0.55
236	0.53
237	0.5
238	0.46
239	0.45
240	0.44
241	0.38
242	0.3
243	0.22
244	0.19
245	0.15
246	0.15
247	0.15
248	0.11
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.07
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.07
262	0.08
263	0.11
264	0.17
265	0.18
266	0.21
267	0.24
268	0.26
269	0.34
270	0.42
271	0.46
272	0.49
273	0.57
274	0.61
275	0.61
276	0.69
277	0.69
278	0.71
279	0.71
280	0.64
281	0.64
282	0.64
283	0.65
284	0.61
285	0.6
286	0.52
287	0.53
288	0.56
289	0.55
290	0.55
291	0.54
292	0.51
293	0.44
294	0.46
295	0.39
296	0.36
297	0.3
298	0.23
299	0.21
300	0.18
301	0.18
302	0.15
303	0.14
304	0.17
305	0.16
306	0.22
307	0.21
308	0.22
309	0.21
310	0.19
311	0.18
312	0.13
313	0.11
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.14
318	0.17
319	0.17
320	0.17
321	0.21
322	0.25
323	0.25
324	0.27
325	0.22
326	0.27
327	0.3
328	0.34
329	0.35
330	0.32
331	0.31
332	0.28
333	0.25
334	0.18
335	0.14
336	0.1
337	0.05
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.09
344	0.14
345	0.17
346	0.22
347	0.27
348	0.28
349	0.31
350	0.32
351	0.34
352	0.35
353	0.33
354	0.34
355	0.29
356	0.27
357	0.29
358	0.3
359	0.32
360	0.31
361	0.31
362	0.27
363	0.33
364	0.34
365	0.36
366	0.38
367	0.4
368	0.42
369	0.5
370	0.56
371	0.59
372	0.64
373	0.64
374	0.66
375	0.67
376	0.66
377	0.67
378	0.66
379	0.66
380	0.62
381	0.59
382	0.56
383	0.47
384	0.43
385	0.41
386	0.43
387	0.42
388	0.45
389	0.46
390	0.46
391	0.56
392	0.63
393	0.61
394	0.64
395	0.65
396	0.69
397	0.73
398	0.78
399	0.77
400	0.77
401	0.82
402	0.81
403	0.82
404	0.8
405	0.75
406	0.71
407	0.66
408	0.62
409	0.57
410	0.57
411	0.53
412	0.51
413	0.57
414	0.56
415	0.53
416	0.5
417	0.45
418	0.37
419	0.33
420	0.31
421	0.26
422	0.26
423	0.25
424	0.25
425	0.25
426	0.24
427	0.24
428	0.2
429	0.17
430	0.14
431	0.15
432	0.14
433	0.17
434	0.2
435	0.17
436	0.19
437	0.23
438	0.27
439	0.27
440	0.3
441	0.35
442	0.37
443	0.41
444	0.46
445	0.48
446	0.45
447	0.44
448	0.44
449	0.41
450	0.41
451	0.46
452	0.4
453	0.36
454	0.38
455	0.38
456	0.44
457	0.49
458	0.51
459	0.51
460	0.61
461	0.66
462	0.71
463	0.8
464	0.81
465	0.8
466	0.82
467	0.84
468	0.81
469	0.8
470	0.72
471	0.66
472	0.6
473	0.54
474	0.44
475	0.36
476	0.33
477	0.33
478	0.32
479	0.29
480	0.26
481	0.22
482	0.22
483	0.21
484	0.18
485	0.12
486	0.17
487	0.22
488	0.26
489	0.31

A0A550CSX5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer