Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DC42

Protein Details
Accession C5DC42    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-87ISKFYTRHSKKVKSIQIKIDACHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
479-487KKHTSKRKA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032710  NTF2-like_dom_sf  
IPR002075  NTF2_dom  
IPR018222  Nuclear_transport_factor_2_euk  
IPR039539  Ras_GTPase_bind_prot  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lth:KLTH0A07634g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02136  NTF2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50177  NTF2_DOMAIN  
PS50102  RRM  
CDD cd00780  NTF2  
Amino Acid Sequences MTDIDNIQEVGYAFLKTYYQRMHQDPFKVHHLYSTTAELTHVNYQMDFDYTADTLPTTKLTGKENISKFYTRHSKKVKSIQIKIDACDFQFTGSNNSSILILALGELCWANTPSYRFCQNFVLAPVPSNPKIYDVTNDVLRFIPYFPTLIRDGKTSSSNPGAVKDVRKDDYLKEPFCQHIDSEQNIAQKREDNMNNENNREIAEQQHFTDKPKLAEHEQKHDTEKPFQANDMGIVQEAEAGDIQKAEDFDGSEESPVALESNIIDEGVLPEKTNARSDLKKEAYTAEDAPVPSSAQFPSELNHNETTKVKSPEADKPALEPAKKMNWASKLAASESKDVPNATTKYIRAELAPVQPKKAPERKSVSPSGQLKDVKNYKKKQFYYVNKDGFYPVYVRGTGGVSDEQLVRALESEFGTVRKISSQETFAVIDFEDQRCQTEAIERGVLRINNVEVHMEPKTVRKANASTSSTSPSGQRFSKKHTSKRKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.14
4 0.2
5 0.23
6 0.29
7 0.35
8 0.41
9 0.49
10 0.53
11 0.59
12 0.59
13 0.59
14 0.6
15 0.56
16 0.5
17 0.47
18 0.44
19 0.39
20 0.36
21 0.35
22 0.29
23 0.25
24 0.26
25 0.22
26 0.23
27 0.24
28 0.24
29 0.2
30 0.19
31 0.2
32 0.2
33 0.21
34 0.18
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.14
46 0.17
47 0.21
48 0.27
49 0.32
50 0.4
51 0.42
52 0.45
53 0.47
54 0.47
55 0.44
56 0.47
57 0.52
58 0.48
59 0.55
60 0.59
61 0.64
62 0.69
63 0.79
64 0.79
65 0.79
66 0.82
67 0.81
68 0.81
69 0.75
70 0.67
71 0.63
72 0.54
73 0.44
74 0.39
75 0.3
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.21
81 0.21
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.14
86 0.13
87 0.07
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.1
99 0.13
100 0.16
101 0.21
102 0.28
103 0.28
104 0.29
105 0.33
106 0.32
107 0.32
108 0.31
109 0.31
110 0.24
111 0.24
112 0.26
113 0.27
114 0.26
115 0.25
116 0.23
117 0.22
118 0.24
119 0.24
120 0.23
121 0.21
122 0.22
123 0.25
124 0.24
125 0.23
126 0.21
127 0.21
128 0.19
129 0.15
130 0.15
131 0.11
132 0.12
133 0.11
134 0.14
135 0.16
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.19
140 0.21
141 0.24
142 0.22
143 0.23
144 0.23
145 0.26
146 0.24
147 0.24
148 0.26
149 0.25
150 0.28
151 0.29
152 0.31
153 0.29
154 0.31
155 0.31
156 0.3
157 0.37
158 0.41
159 0.37
160 0.34
161 0.34
162 0.34
163 0.34
164 0.32
165 0.22
166 0.21
167 0.23
168 0.23
169 0.24
170 0.24
171 0.28
172 0.28
173 0.29
174 0.24
175 0.23
176 0.24
177 0.28
178 0.29
179 0.29
180 0.34
181 0.41
182 0.43
183 0.41
184 0.39
185 0.32
186 0.29
187 0.26
188 0.2
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.23
194 0.22
195 0.24
196 0.3
197 0.28
198 0.26
199 0.28
200 0.3
201 0.29
202 0.37
203 0.37
204 0.39
205 0.4
206 0.4
207 0.41
208 0.44
209 0.41
210 0.38
211 0.39
212 0.34
213 0.31
214 0.3
215 0.27
216 0.21
217 0.2
218 0.15
219 0.11
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.1
259 0.11
260 0.13
261 0.15
262 0.17
263 0.2
264 0.23
265 0.32
266 0.32
267 0.32
268 0.31
269 0.3
270 0.28
271 0.27
272 0.25
273 0.17
274 0.16
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.14
287 0.16
288 0.18
289 0.22
290 0.21
291 0.22
292 0.24
293 0.28
294 0.29
295 0.31
296 0.28
297 0.28
298 0.31
299 0.38
300 0.42
301 0.4
302 0.33
303 0.31
304 0.39
305 0.4
306 0.36
307 0.29
308 0.27
309 0.3
310 0.33
311 0.32
312 0.3
313 0.3
314 0.34
315 0.35
316 0.33
317 0.29
318 0.28
319 0.32
320 0.29
321 0.28
322 0.26
323 0.26
324 0.24
325 0.23
326 0.22
327 0.25
328 0.24
329 0.23
330 0.25
331 0.23
332 0.26
333 0.28
334 0.27
335 0.21
336 0.22
337 0.24
338 0.29
339 0.37
340 0.33
341 0.34
342 0.36
343 0.39
344 0.45
345 0.49
346 0.46
347 0.46
348 0.53
349 0.58
350 0.62
351 0.66
352 0.6
353 0.62
354 0.62
355 0.55
356 0.55
357 0.52
358 0.47
359 0.49
360 0.54
361 0.55
362 0.59
363 0.66
364 0.68
365 0.73
366 0.74
367 0.74
368 0.76
369 0.76
370 0.77
371 0.78
372 0.76
373 0.66
374 0.65
375 0.57
376 0.47
377 0.38
378 0.3
379 0.22
380 0.19
381 0.18
382 0.17
383 0.16
384 0.16
385 0.15
386 0.15
387 0.14
388 0.11
389 0.13
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.12
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.13
405 0.14
406 0.15
407 0.17
408 0.2
409 0.22
410 0.22
411 0.24
412 0.25
413 0.22
414 0.21
415 0.18
416 0.18
417 0.19
418 0.19
419 0.2
420 0.19
421 0.21
422 0.22
423 0.22
424 0.2
425 0.23
426 0.26
427 0.26
428 0.31
429 0.29
430 0.29
431 0.34
432 0.34
433 0.28
434 0.27
435 0.25
436 0.22
437 0.23
438 0.23
439 0.18
440 0.21
441 0.21
442 0.2
443 0.19
444 0.24
445 0.32
446 0.34
447 0.36
448 0.39
449 0.42
450 0.49
451 0.58
452 0.55
453 0.5
454 0.49
455 0.52
456 0.46
457 0.43
458 0.39
459 0.34
460 0.36
461 0.39
462 0.44
463 0.44
464 0.52
465 0.61
466 0.67
467 0.72