FuNGI

A0A550CVL1

Protein Details

Accession

A0A550CVL1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
390-416	VDGPVKTPTPHRKERNQKKKAPVSEVR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
399-409	PHRKERNQKKK

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR006225 PsdUridine_synth_RluC/D IPR006145 PsdUridine_synth_RsuA/RluA
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis
Pfam	View protein in Pfam PF00849 PseudoU_synth_2
CDD	cd02557 PseudoU_synth_ScRIB2

Amino Acid Sequences

MAGMESAVNTRNICTTPGLKKIKPYWYPFCTMAKERWIGREILEVVSTEFRDRSMEFYRYALESGVTTINGKVAHPQTIVRNGDRIENMVHRHEPPVTSTPVKLLLHDKERGFIVVNKPGSIPVHAAGRYNRNSLIHILMNDMGFKKVHTVNRLDRLTSGLMIIPLNVDLARSLTKEFIEGSIRKEYVARVRGNFPDEEITCEEPLLTVDRQMGLNIVHPEGRHAKTVFNKIRYDAHTNSSVVHCKPFTGRSHQLRVHLQFLGYPIANDPVYSTPKIWGDNLGKGGIDVTPSDQRAAPAPPEHLKSLTEAIGSPESLAQAHGPADPQAPARKLLPRETGEDIGMGSPVPLSSEAITVITHLRNMKDEDEDWGRWRDVVFRARGKLVPGPVDGPVKTPTPHRKERNQKKKAPVSEVRAPAVATEDAVAEVTGAEATSVGAESACDTPTGAQPAAATSASTDAPLSAAIEGAVPPEVAAQLPPTTTDPSPAADEASQEPPKPADQVTVEEIIAANEPIPTGAKVLHDDGLYCAECYLPLHPDPKPESLYIFLHALRYTTSLGEFETEMPEWAAEEFVWDQSAACSVS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.27
3	0.32
4	0.42
5	0.49
6	0.48
7	0.56
8	0.62
9	0.68
10	0.69
11	0.7
12	0.7
13	0.67
14	0.7
15	0.66
16	0.64
17	0.61
18	0.56
19	0.54
20	0.52
21	0.52
22	0.49
23	0.51
24	0.47
25	0.41
26	0.38
27	0.4
28	0.34
29	0.3
30	0.28
31	0.22
32	0.21
33	0.23
34	0.23
35	0.18
36	0.16
37	0.15
38	0.17
39	0.17
40	0.21
41	0.24
42	0.27
43	0.26
44	0.27
45	0.29
46	0.28
47	0.28
48	0.22
49	0.16
50	0.13
51	0.14
52	0.14
53	0.12
54	0.12
55	0.11
56	0.14
57	0.13
58	0.13
59	0.19
60	0.2
61	0.23
62	0.23
63	0.26
64	0.3
65	0.38
66	0.42
67	0.36
68	0.38
69	0.35
70	0.39
71	0.36
72	0.32
73	0.28
74	0.28
75	0.3
76	0.31
77	0.34
78	0.3
79	0.32
80	0.32
81	0.29
82	0.3
83	0.31
84	0.31
85	0.3
86	0.29
87	0.29
88	0.34
89	0.33
90	0.3
91	0.31
92	0.33
93	0.36
94	0.42
95	0.4
96	0.35
97	0.36
98	0.34
99	0.3
100	0.28
101	0.29
102	0.3
103	0.31
104	0.29
105	0.29
106	0.3
107	0.29
108	0.25
109	0.21
110	0.15
111	0.2
112	0.2
113	0.23
114	0.25
115	0.32
116	0.33
117	0.34
118	0.35
119	0.31
120	0.32
121	0.31
122	0.31
123	0.24
124	0.21
125	0.21
126	0.2
127	0.19
128	0.19
129	0.17
130	0.14
131	0.12
132	0.12
133	0.15
134	0.19
135	0.23
136	0.26
137	0.33
138	0.39
139	0.48
140	0.5
141	0.46
142	0.4
143	0.39
144	0.35
145	0.28
146	0.22
147	0.13
148	0.12
149	0.12
150	0.11
151	0.08
152	0.07
153	0.07
154	0.06
155	0.05
156	0.04
157	0.06
158	0.07
159	0.08
160	0.09
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.11
165	0.12
166	0.17
167	0.17
168	0.2
169	0.24
170	0.24
171	0.24
172	0.24
173	0.25
174	0.27
175	0.33
176	0.32
177	0.3
178	0.34
179	0.37
180	0.38
181	0.35
182	0.29
183	0.27
184	0.24
185	0.25
186	0.24
187	0.23
188	0.2
189	0.2
190	0.18
191	0.13
192	0.13
193	0.13
194	0.1
195	0.08
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.11
201	0.08
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.15
208	0.21
209	0.22
210	0.22
211	0.21
212	0.25
213	0.3
214	0.4
215	0.43
216	0.42
217	0.42
218	0.4
219	0.45
220	0.45
221	0.46
222	0.37
223	0.34
224	0.32
225	0.31
226	0.31
227	0.28
228	0.27
229	0.21
230	0.22
231	0.18
232	0.16
233	0.18
234	0.22
235	0.23
236	0.28
237	0.36
238	0.39
239	0.47
240	0.48
241	0.51
242	0.52
243	0.51
244	0.45
245	0.37
246	0.31
247	0.24
248	0.23
249	0.2
250	0.14
251	0.11
252	0.09
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.09
257	0.1
258	0.13
259	0.14
260	0.14
261	0.14
262	0.16
263	0.17
264	0.16
265	0.19
266	0.18
267	0.2
268	0.21
269	0.19
270	0.17
271	0.16
272	0.16
273	0.1
274	0.08
275	0.06
276	0.07
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.12
283	0.13
284	0.12
285	0.11
286	0.14
287	0.16
288	0.18
289	0.18
290	0.17
291	0.17
292	0.16
293	0.17
294	0.14
295	0.12
296	0.1
297	0.11
298	0.11
299	0.1
300	0.09
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.08
313	0.1
314	0.13
315	0.13
316	0.14
317	0.16
318	0.2
319	0.22
320	0.27
321	0.31
322	0.3
323	0.33
324	0.35
325	0.34
326	0.29
327	0.26
328	0.21
329	0.15
330	0.13
331	0.08
332	0.05
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.09
345	0.08
346	0.1
347	0.11
348	0.12
349	0.13
350	0.16
351	0.16
352	0.16
353	0.17
354	0.19
355	0.22
356	0.23
357	0.23
358	0.24
359	0.22
360	0.21
361	0.21
362	0.21
363	0.22
364	0.27
365	0.3
366	0.32
367	0.34
368	0.36
369	0.37
370	0.35
371	0.32
372	0.29
373	0.26
374	0.22
375	0.21
376	0.22
377	0.23
378	0.21
379	0.19
380	0.19
381	0.18
382	0.18
383	0.25
384	0.33
385	0.38
386	0.48
387	0.53
388	0.61
389	0.71
390	0.81
391	0.85
392	0.85
393	0.85
394	0.86
395	0.88
396	0.84
397	0.82
398	0.79
399	0.75
400	0.73
401	0.68
402	0.59
403	0.5
404	0.43
405	0.34
406	0.29
407	0.21
408	0.13
409	0.09
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.07
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.05
428	0.06
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.11
434	0.15
435	0.13
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.16
440	0.14
441	0.11
442	0.08
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.09
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.06
462	0.05
463	0.06
464	0.07
465	0.08
466	0.08
467	0.1
468	0.12
469	0.16
470	0.15
471	0.18
472	0.18
473	0.19
474	0.22
475	0.2
476	0.2
477	0.17
478	0.19
479	0.19
480	0.26
481	0.26
482	0.24
483	0.25
484	0.25
485	0.25
486	0.26
487	0.23
488	0.21
489	0.2
490	0.24
491	0.26
492	0.26
493	0.24
494	0.22
495	0.22
496	0.17
497	0.16
498	0.12
499	0.08
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.1
507	0.12
508	0.14
509	0.17
510	0.19
511	0.18
512	0.18
513	0.18
514	0.22
515	0.2
516	0.18
517	0.15
518	0.13
519	0.13
520	0.14
521	0.15
522	0.14
523	0.17
524	0.21
525	0.23
526	0.31
527	0.35
528	0.39
529	0.4
530	0.36
531	0.36
532	0.36
533	0.36
534	0.31
535	0.3
536	0.25
537	0.25
538	0.24
539	0.21
540	0.18
541	0.19
542	0.17
543	0.16
544	0.16
545	0.14
546	0.14
547	0.15
548	0.15
549	0.14
550	0.16
551	0.16
552	0.15
553	0.15
554	0.14
555	0.13
556	0.12
557	0.12
558	0.08
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.12
563	0.11
564	0.11
565	0.11

A0A550CVL1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer