FuNGI

C5E2D0

Protein Details

Accession

C5E2D0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
523-550	RDTSLGKVAKKRRVHKNRKFPKDFDAER	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
528-576	GKVAKKRRVHKNRKFPKDFDAEREPNPERWLPLKDRSDFRPKKKLAAKQ
592-603	ISKKNRTKKGKK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, mito_nucl 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	lth:KLTH0H03938g -
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72

Amino Acid Sequences

MKDLTSLLSDLNVQYNSNKHFEAAKVCKELIEAGVEDKISVLGQWLVSLIKSDCYKQGWDLLNQYDQELKGLYHLERLYIFYKLGYTKSFEKLYDELKDIEQANSFENRGLLHVRAQFCFKNGKFEEAVKIYQLLATHNEQQLDNETELACNERAAVGSTYQSGYESLLVTSLNEDSYDLLFNESLIALRRGDLDLSLKYLNQASSLAAQEGSDDDQNAIELQKAYVLQASGEKSEAKDILNDLVSKTMAGSTMHLLAQNNLKSFHDFSKYTTNVSLLLRELDVAKLSGKVSSLGHEQQQIILNNVLFLNLFNGCGIQSKKSLVSKTLANYRKTIANVVLEPYSTQAKKMFNRTMSAMSCGTGGSVFGSIVLTVQLQVLEKNFDGAIVLCESYLNKNSDSVNYEHRVVCYILLQLYRESGRSSSSNRLLEHLFAIVKDNNVKEDPEFWRFVAFNLLAQGFGSKAEDMFAKLQRISPELQLFNSSSEQHDVLSSDLDSLVSSVDVESLKKLGAAPFEGQRTRMRDTSLGKVAKKRRVHKNRKFPKDFDAEREPNPERWLPLKDRSDFRPKKKLAAKQTQGSAISRKSEQSLDISKKNRTKKGKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.25
3	0.28
4	0.31
5	0.3
6	0.26
7	0.29
8	0.32
9	0.39
10	0.4
11	0.43
12	0.44
13	0.44
14	0.43
15	0.4
16	0.38
17	0.29
18	0.25
19	0.18
20	0.15
21	0.17
22	0.16
23	0.15
24	0.14
25	0.12
26	0.09
27	0.08
28	0.08
29	0.08
30	0.08
31	0.08
32	0.09
33	0.09
34	0.09
35	0.12
36	0.11
37	0.14
38	0.16
39	0.18
40	0.22
41	0.25
42	0.27
43	0.26
44	0.34
45	0.33
46	0.35
47	0.39
48	0.38
49	0.4
50	0.38
51	0.37
52	0.32
53	0.28
54	0.25
55	0.21
56	0.17
57	0.15
58	0.18
59	0.17
60	0.19
61	0.19
62	0.2
63	0.2
64	0.23
65	0.23
66	0.21
67	0.21
68	0.15
69	0.18
70	0.18
71	0.2
72	0.19
73	0.22
74	0.25
75	0.3
76	0.33
77	0.3
78	0.32
79	0.33
80	0.36
81	0.35
82	0.33
83	0.3
84	0.28
85	0.31
86	0.28
87	0.26
88	0.24
89	0.21
90	0.21
91	0.22
92	0.21
93	0.18
94	0.17
95	0.16
96	0.15
97	0.17
98	0.15
99	0.19
100	0.24
101	0.26
102	0.27
103	0.31
104	0.29
105	0.29
106	0.38
107	0.33
108	0.37
109	0.36
110	0.39
111	0.37
112	0.39
113	0.43
114	0.37
115	0.37
116	0.28
117	0.27
118	0.22
119	0.21
120	0.2
121	0.15
122	0.15
123	0.17
124	0.22
125	0.23
126	0.25
127	0.23
128	0.24
129	0.27
130	0.26
131	0.23
132	0.19
133	0.17
134	0.15
135	0.16
136	0.18
137	0.13
138	0.09
139	0.09
140	0.08
141	0.08
142	0.11
143	0.11
144	0.09
145	0.1
146	0.12
147	0.12
148	0.12
149	0.12
150	0.09
151	0.09
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.08
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.07
164	0.08
165	0.09
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.07
172	0.07
173	0.08
174	0.09
175	0.08
176	0.08
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.1
181	0.11
182	0.1
183	0.13
184	0.13
185	0.12
186	0.12
187	0.14
188	0.13
189	0.11
190	0.11
191	0.09
192	0.11
193	0.12
194	0.11
195	0.09
196	0.09
197	0.08
198	0.09
199	0.09
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.08
215	0.07
216	0.1
217	0.11
218	0.1
219	0.11
220	0.11
221	0.11
222	0.13
223	0.13
224	0.1
225	0.1
226	0.11
227	0.12
228	0.12
229	0.13
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.09
234	0.08
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.07
239	0.07
240	0.09
241	0.09
242	0.11
243	0.1
244	0.11
245	0.16
246	0.17
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.17
251	0.19
252	0.2
253	0.2
254	0.18
255	0.2
256	0.29
257	0.29
258	0.28
259	0.26
260	0.24
261	0.22
262	0.22
263	0.2
264	0.11
265	0.11
266	0.1
267	0.09
268	0.09
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.08
278	0.08
279	0.09
280	0.12
281	0.12
282	0.14
283	0.16
284	0.15
285	0.16
286	0.2
287	0.19
288	0.17
289	0.16
290	0.15
291	0.13
292	0.13
293	0.11
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.1
306	0.12
307	0.15
308	0.18
309	0.19
310	0.18
311	0.19
312	0.21
313	0.23
314	0.31
315	0.34
316	0.32
317	0.33
318	0.32
319	0.33
320	0.31
321	0.3
322	0.22
323	0.18
324	0.17
325	0.17
326	0.16
327	0.12
328	0.12
329	0.12
330	0.14
331	0.12
332	0.13
333	0.15
334	0.2
335	0.24
336	0.32
337	0.36
338	0.34
339	0.36
340	0.37
341	0.38
342	0.33
343	0.32
344	0.25
345	0.19
346	0.18
347	0.15
348	0.13
349	0.08
350	0.07
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.08
370	0.07
371	0.08
372	0.07
373	0.08
374	0.07
375	0.07
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.09
380	0.13
381	0.14
382	0.13
383	0.15
384	0.16
385	0.19
386	0.22
387	0.21
388	0.23
389	0.24
390	0.27
391	0.26
392	0.25
393	0.24
394	0.21
395	0.2
396	0.14
397	0.13
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.11
402	0.13
403	0.14
404	0.13
405	0.13
406	0.11
407	0.14
408	0.16
409	0.19
410	0.25
411	0.31
412	0.34
413	0.33
414	0.36
415	0.34
416	0.32
417	0.28
418	0.22
419	0.16
420	0.12
421	0.16
422	0.14
423	0.15
424	0.18
425	0.17
426	0.18
427	0.19
428	0.2
429	0.17
430	0.22
431	0.25
432	0.26
433	0.27
434	0.24
435	0.27
436	0.26
437	0.25
438	0.26
439	0.21
440	0.17
441	0.18
442	0.18
443	0.15
444	0.15
445	0.14
446	0.08
447	0.08
448	0.09
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.1
454	0.14
455	0.17
456	0.19
457	0.19
458	0.23
459	0.24
460	0.26
461	0.26
462	0.27
463	0.3
464	0.28
465	0.28
466	0.28
467	0.27
468	0.27
469	0.27
470	0.23
471	0.18
472	0.2
473	0.19
474	0.16
475	0.16
476	0.14
477	0.13
478	0.13
479	0.11
480	0.09
481	0.09
482	0.08
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.07
490	0.07
491	0.08
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.1
496	0.12
497	0.12
498	0.14
499	0.17
500	0.19
501	0.23
502	0.29
503	0.3
504	0.31
505	0.34
506	0.37
507	0.39
508	0.38
509	0.37
510	0.37
511	0.4
512	0.46
513	0.49
514	0.5
515	0.49
516	0.56
517	0.61
518	0.64
519	0.69
520	0.7
521	0.73
522	0.78
523	0.85
524	0.87
525	0.9
526	0.92
527	0.94
528	0.93
529	0.85
530	0.83
531	0.82
532	0.75
533	0.72
534	0.71
535	0.65
536	0.6
537	0.64
538	0.58
539	0.51
540	0.52
541	0.47
542	0.4
543	0.41
544	0.45
545	0.43
546	0.49
547	0.54
548	0.56
549	0.58
550	0.62
551	0.68
552	0.7
553	0.73
554	0.74
555	0.68
556	0.72
557	0.75
558	0.78
559	0.77
560	0.79
561	0.79
562	0.75
563	0.78
564	0.74
565	0.68
566	0.62
567	0.58
568	0.51
569	0.47
570	0.41
571	0.39
572	0.36
573	0.35
574	0.34
575	0.34
576	0.4
577	0.43
578	0.49
579	0.52
580	0.58
581	0.64
582	0.71
583	0.74

C5E2D0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer