Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CKS1

Protein Details
Accession A0A550CKS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-30IQCPSSSSSKKGKAKQGPITFSHydrophilic
339-364TAIQTSSVDEKRKKKRKKQRLQAPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-359KRKKKRKKQRL
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_mito 10.833, mito_nucl 9.333, cyto 7.5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016195  Pol/histidinol_Pase-like  
IPR002738  RNase_P_p30  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01876  RNase_P_p30  
Amino Acid Sequences MYFDLNVPIQCPSSSSSKKGKAKQGPITFSAAEINAIEARIELLVHLGYTVLAFTQTLHKKIDPKVNANILDVLIPQLRSRPGVLFLKRLNVILDSDSEKGFGLTSNNQSFLNSYDILGLVPTSLTTFNLACLTHSQPSPLTAHIITVPVTLPRVPFYMKHTPVRTALKNGAVFELTYVGALGGRNDEVLVDAGAAEDGTSAKKNWWAAARELARVTKGKGILVSSGACSDADIRAPRDVSNLISIVGLPQNLAHDTSTVVPKSLLIRAQTRKTYRAVLSEPKVVIPGAASLPSLPAQSLSTIAQDLSTPQNDVSTAASAPEASVARGKRPREDVEDGTAIQTSSVDEKRKKKRKKQRLQAPAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.35
3 0.42
4 0.51
5 0.6
6 0.67
7 0.75
8 0.75
9 0.8
10 0.84
11 0.83
12 0.78
13 0.73
14 0.69
15 0.59
16 0.49
17 0.42
18 0.32
19 0.23
20 0.18
21 0.17
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.08
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.05
42 0.15
43 0.19
44 0.22
45 0.25
46 0.28
47 0.35
48 0.42
49 0.51
50 0.48
51 0.49
52 0.54
53 0.58
54 0.56
55 0.51
56 0.46
57 0.36
58 0.3
59 0.24
60 0.19
61 0.14
62 0.13
63 0.12
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.17
68 0.16
69 0.2
70 0.28
71 0.3
72 0.34
73 0.34
74 0.38
75 0.37
76 0.36
77 0.31
78 0.24
79 0.23
80 0.17
81 0.18
82 0.15
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.13
92 0.2
93 0.21
94 0.22
95 0.22
96 0.22
97 0.22
98 0.21
99 0.2
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.08
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.12
120 0.15
121 0.16
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.17
126 0.18
127 0.15
128 0.15
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.13
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.18
145 0.27
146 0.3
147 0.36
148 0.36
149 0.37
150 0.41
151 0.46
152 0.4
153 0.35
154 0.34
155 0.32
156 0.32
157 0.3
158 0.25
159 0.2
160 0.18
161 0.14
162 0.12
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.02
184 0.02
185 0.03
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.09
191 0.09
192 0.12
193 0.17
194 0.19
195 0.2
196 0.28
197 0.29
198 0.28
199 0.29
200 0.27
201 0.24
202 0.23
203 0.22
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.14
210 0.15
211 0.14
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.09
220 0.11
221 0.12
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.11
245 0.15
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.16
251 0.18
252 0.19
253 0.18
254 0.26
255 0.32
256 0.38
257 0.45
258 0.47
259 0.47
260 0.47
261 0.51
262 0.45
263 0.44
264 0.43
265 0.44
266 0.44
267 0.46
268 0.43
269 0.37
270 0.35
271 0.29
272 0.24
273 0.16
274 0.14
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.16
301 0.16
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.16
312 0.17
313 0.25
314 0.32
315 0.35
316 0.39
317 0.45
318 0.5
319 0.53
320 0.59
321 0.54
322 0.54
323 0.54
324 0.47
325 0.41
326 0.36
327 0.28
328 0.21
329 0.17
330 0.12
331 0.15
332 0.2
333 0.27
334 0.35
335 0.45
336 0.56
337 0.67
338 0.77
339 0.82
340 0.88
341 0.91
342 0.94
343 0.95
344 0.95