FuNGI

A0A550CIQ8

Protein Details

Accession

A0A550CIQ8

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
37-59	AAEENYKKQRQREAKERETKILQ	Hydrophilic
87-116	DDTLLWVKRSKKQEKELKRRRLQEQEELEK	Hydrophilic
263-288	KEGDVGFKKPKKKRKHQVRKVTAEDI	Basic
668-695	LGKKQGQEKDKGKKKKEGKQQQQIAAAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
62-68	IAKIKNK
94-107	KRSKKQEKELKRRR
270-281	KKPKKKRKHQVR
325-345	RSRRAKLNKAKKLKPEELAKK
592-613	HRFHGKGSGKAKTEKRLRKIAE
670-686	KKQGQEKDKGKKKKEGK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MSMEESISLAETNAIREKLGLKLLTDDGAPADTKDQAAEENYKKQRQREAKERETKILQERIAKIKNKRELNSALKGRTLGDGKGEDDTLLWVKRSKKQEKELKRRRLQEQEELEKQVQQEYSERDLTGLKVSHDFEELEEGEDRILTLKDSRILDNEEDELQNVEMAEHERTQKNNDLKIKKADYTGYDDEEFKEGHVGLKRAVLAKYDEDMNGETGFRLGSGAKKSSEAARADQEQAGASLNKSLLSIDYEKTFSTDDYLKEGDVGFKKPKKKRKHQVRKVTAEDIGIQPEDSMDVDIKPIARERNLDANFVDDDELQAALARSRRAKLNKAKKLKPEELAKKIAEERALEEAEAQRLIQAEEMEAVNGDEGGLTFDDTTEFVRAVGLNPVLERKPKVEPREVPIKPSRDVSMAPPASEVEDVPMTEVDTSAAVKEEPEEDEMAMLDDIEAAWKQDEVKTENAAAADEVGTQSEQTFKSMASTLGILRQTGLIATPNADQQERERTQLQQNLWLADQRRRVTQREMDRLASRGQPKDQAQREYENRLREQQEAREQLETFKHYKPDVNIVYYDEFGRALTPKEAWKALSHRFHGKGSGKAKTEKRLRKIAEERKQEAMVSGDTPTSMGRAFQARQEKAGQAHFVLSVGNRGAVPQAEGAFLDTQPLGKKQGQEKDKGKKKKEGKQQQQIAAATGGFMTLPAPQASPGPRAGFSRIGTMAEADRSGSGTPVGDRSKVHFGLKRKAEGEHEATPPPKARQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.2
4	0.21
5	0.22
6	0.28
7	0.26
8	0.21
9	0.25
10	0.26
11	0.26
12	0.24
13	0.2
14	0.15
15	0.15
16	0.15
17	0.12
18	0.12
19	0.12
20	0.13
21	0.13
22	0.12
23	0.13
24	0.17
25	0.24
26	0.28
27	0.36
28	0.44
29	0.52
30	0.57
31	0.61
32	0.67
33	0.69
34	0.74
35	0.75
36	0.78
37	0.8
38	0.85
39	0.84
40	0.81
41	0.75
42	0.72
43	0.7
44	0.67
45	0.6
46	0.58
47	0.59
48	0.61
49	0.64
50	0.65
51	0.65
52	0.68
53	0.73
54	0.73
55	0.7
56	0.68
57	0.69
58	0.69
59	0.7
60	0.68
61	0.61
62	0.54
63	0.52
64	0.45
65	0.42
66	0.37
67	0.27
68	0.25
69	0.25
70	0.24
71	0.25
72	0.24
73	0.18
74	0.16
75	0.18
76	0.17
77	0.17
78	0.17
79	0.2
80	0.25
81	0.33
82	0.43
83	0.5
84	0.56
85	0.65
86	0.74
87	0.81
88	0.87
89	0.9
90	0.91
91	0.9
92	0.89
93	0.88
94	0.88
95	0.83
96	0.82
97	0.81
98	0.78
99	0.74
100	0.71
101	0.63
102	0.54
103	0.48
104	0.42
105	0.33
106	0.26
107	0.26
108	0.26
109	0.3
110	0.3
111	0.29
112	0.26
113	0.26
114	0.25
115	0.25
116	0.22
117	0.18
118	0.2
119	0.22
120	0.22
121	0.22
122	0.21
123	0.16
124	0.2
125	0.19
126	0.17
127	0.16
128	0.15
129	0.14
130	0.13
131	0.13
132	0.09
133	0.09
134	0.08
135	0.09
136	0.11
137	0.17
138	0.19
139	0.2
140	0.22
141	0.26
142	0.26
143	0.25
144	0.25
145	0.22
146	0.2
147	0.19
148	0.17
149	0.13
150	0.13
151	0.1
152	0.08
153	0.07
154	0.09
155	0.1
156	0.12
157	0.17
158	0.2
159	0.21
160	0.26
161	0.33
162	0.37
163	0.43
164	0.5
165	0.5
166	0.52
167	0.59
168	0.59
169	0.53
170	0.5
171	0.45
172	0.39
173	0.42
174	0.4
175	0.35
176	0.32
177	0.3
178	0.29
179	0.27
180	0.24
181	0.16
182	0.15
183	0.12
184	0.15
185	0.18
186	0.18
187	0.17
188	0.19
189	0.21
190	0.22
191	0.22
192	0.2
193	0.18
194	0.19
195	0.2
196	0.19
197	0.17
198	0.16
199	0.16
200	0.15
201	0.13
202	0.12
203	0.1
204	0.09
205	0.08
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.1
210	0.13
211	0.16
212	0.17
213	0.18
214	0.19
215	0.22
216	0.28
217	0.26
218	0.25
219	0.27
220	0.29
221	0.3
222	0.29
223	0.26
224	0.2
225	0.18
226	0.17
227	0.13
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.07
235	0.11
236	0.13
237	0.12
238	0.14
239	0.14
240	0.14
241	0.15
242	0.15
243	0.12
244	0.13
245	0.15
246	0.14
247	0.16
248	0.17
249	0.16
250	0.16
251	0.16
252	0.18
253	0.17
254	0.2
255	0.24
256	0.29
257	0.39
258	0.47
259	0.56
260	0.62
261	0.71
262	0.78
263	0.82
264	0.88
265	0.9
266	0.93
267	0.94
268	0.92
269	0.86
270	0.78
271	0.68
272	0.57
273	0.48
274	0.38
275	0.29
276	0.2
277	0.14
278	0.1
279	0.09
280	0.08
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.1
290	0.11
291	0.12
292	0.14
293	0.17
294	0.26
295	0.27
296	0.27
297	0.24
298	0.24
299	0.23
300	0.21
301	0.19
302	0.09
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.08
311	0.1
312	0.12
313	0.13
314	0.2
315	0.24
316	0.33
317	0.42
318	0.51
319	0.59
320	0.66
321	0.71
322	0.73
323	0.78
324	0.74
325	0.7
326	0.69
327	0.67
328	0.64
329	0.62
330	0.54
331	0.47
332	0.44
333	0.39
334	0.31
335	0.23
336	0.19
337	0.17
338	0.17
339	0.15
340	0.14
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.09
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.05
351	0.06
352	0.07
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.03
359	0.02
360	0.02
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.09
380	0.1
381	0.11
382	0.12
383	0.12
384	0.2
385	0.25
386	0.3
387	0.36
388	0.38
389	0.41
390	0.51
391	0.48
392	0.47
393	0.47
394	0.46
395	0.39
396	0.38
397	0.34
398	0.25
399	0.26
400	0.23
401	0.26
402	0.23
403	0.22
404	0.21
405	0.2
406	0.19
407	0.18
408	0.15
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.05
425	0.06
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.06
434	0.05
435	0.04
436	0.03
437	0.03
438	0.04
439	0.04
440	0.03
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.07
445	0.11
446	0.13
447	0.15
448	0.16
449	0.16
450	0.17
451	0.16
452	0.14
453	0.11
454	0.09
455	0.07
456	0.06
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.04
461	0.05
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.09
466	0.09
467	0.1
468	0.11
469	0.12
470	0.09
471	0.1
472	0.09
473	0.13
474	0.13
475	0.11
476	0.11
477	0.11
478	0.1
479	0.09
480	0.09
481	0.06
482	0.06
483	0.08
484	0.08
485	0.1
486	0.11
487	0.12
488	0.12
489	0.13
490	0.23
491	0.23
492	0.25
493	0.25
494	0.28
495	0.35
496	0.4
497	0.38
498	0.35
499	0.35
500	0.33
501	0.32
502	0.32
503	0.28
504	0.28
505	0.34
506	0.29
507	0.35
508	0.37
509	0.41
510	0.44
511	0.5
512	0.53
513	0.55
514	0.57
515	0.53
516	0.51
517	0.49
518	0.45
519	0.43
520	0.39
521	0.33
522	0.32
523	0.35
524	0.38
525	0.46
526	0.49
527	0.49
528	0.47
529	0.52
530	0.53
531	0.55
532	0.55
533	0.52
534	0.48
535	0.49
536	0.48
537	0.46
538	0.46
539	0.44
540	0.48
541	0.47
542	0.46
543	0.42
544	0.4
545	0.38
546	0.38
547	0.35
548	0.3
549	0.29
550	0.3
551	0.29
552	0.33
553	0.32
554	0.38
555	0.36
556	0.35
557	0.32
558	0.32
559	0.32
560	0.28
561	0.26
562	0.17
563	0.14
564	0.12
565	0.12
566	0.1
567	0.11
568	0.12
569	0.13
570	0.16
571	0.2
572	0.21
573	0.21
574	0.25
575	0.29
576	0.36
577	0.42
578	0.43
579	0.47
580	0.49
581	0.49
582	0.52
583	0.5
584	0.5
585	0.48
586	0.51
587	0.47
588	0.53
589	0.57
590	0.58
591	0.65
592	0.65
593	0.66
594	0.69
595	0.68
596	0.71
597	0.76
598	0.77
599	0.76
600	0.77
601	0.73
602	0.69
603	0.66
604	0.56
605	0.46
606	0.38
607	0.3
608	0.21
609	0.18
610	0.13
611	0.12
612	0.12
613	0.11
614	0.09
615	0.08
616	0.07
617	0.09
618	0.14
619	0.15
620	0.21
621	0.31
622	0.31
623	0.34
624	0.37
625	0.38
626	0.37
627	0.4
628	0.35
629	0.26
630	0.27
631	0.23
632	0.2
633	0.17
634	0.14
635	0.13
636	0.12
637	0.12
638	0.1
639	0.11
640	0.12
641	0.11
642	0.12
643	0.11
644	0.12
645	0.11
646	0.12
647	0.13
648	0.13
649	0.12
650	0.13
651	0.11
652	0.12
653	0.14
654	0.16
655	0.2
656	0.21
657	0.28
658	0.35
659	0.44
660	0.48
661	0.56
662	0.63
663	0.69
664	0.76
665	0.8
666	0.79
667	0.8
668	0.84
669	0.84
670	0.86
671	0.86
672	0.87
673	0.88
674	0.89
675	0.86
676	0.83
677	0.74
678	0.65
679	0.55
680	0.43
681	0.33
682	0.23
683	0.16
684	0.08
685	0.07
686	0.06
687	0.06
688	0.08
689	0.09
690	0.09
691	0.1
692	0.15
693	0.18
694	0.21
695	0.24
696	0.25
697	0.26
698	0.29
699	0.33
700	0.34
701	0.32
702	0.34
703	0.31
704	0.29
705	0.27
706	0.26
707	0.24
708	0.2
709	0.19
710	0.15
711	0.14
712	0.14
713	0.14
714	0.12
715	0.11
716	0.11
717	0.12
718	0.18
719	0.21
720	0.22
721	0.23
722	0.28
723	0.36
724	0.38
725	0.43
726	0.42
727	0.47
728	0.55
729	0.61
730	0.63
731	0.56
732	0.57
733	0.56
734	0.57
735	0.56
736	0.52
737	0.48
738	0.47
739	0.46
740	0.47

A0A550CIQ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer