Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5DII4

Protein Details
Accession C5DII4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-212QDTYQRAPSSKKPKKPFDANNVLKMIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019364  Mediatior_Med8_fun/met  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG lth:KLTH0E12760g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10232  Med8  
Amino Acid Sequences MSQGPVPDTGVGVADSQADYDFSHVPAQALDAVRMRLAQLTHSQAKLKDEMARADLPQWHSLQAQVSIILTQLQSLTSTIHHFEETLDSTVVYPLANFPTTAHEGLLTTLLRKKNIPEVDEWINDAKETSGIDINTASHEDIKTALRSDEELTKWALDFLKQEHSNYSYHGFYTARELSAGASPDTQDTYQRAPSSKKPKKPFDANNVLKMIHQGTFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.08
7 0.1
8 0.11
9 0.11
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.12
14 0.14
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.13
24 0.13
25 0.13
26 0.16
27 0.23
28 0.26
29 0.28
30 0.31
31 0.3
32 0.33
33 0.33
34 0.3
35 0.29
36 0.28
37 0.28
38 0.29
39 0.28
40 0.26
41 0.26
42 0.28
43 0.25
44 0.26
45 0.24
46 0.22
47 0.2
48 0.21
49 0.2
50 0.17
51 0.14
52 0.11
53 0.11
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.08
80 0.05
81 0.05
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.11
87 0.13
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.08
95 0.07
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.21
102 0.24
103 0.24
104 0.22
105 0.26
106 0.28
107 0.28
108 0.28
109 0.21
110 0.18
111 0.17
112 0.15
113 0.1
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.12
135 0.14
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.17
143 0.15
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.22
148 0.23
149 0.23
150 0.25
151 0.26
152 0.26
153 0.26
154 0.27
155 0.19
156 0.18
157 0.2
158 0.17
159 0.15
160 0.21
161 0.21
162 0.18
163 0.17
164 0.17
165 0.16
166 0.19
167 0.2
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.17
176 0.2
177 0.25
178 0.27
179 0.3
180 0.33
181 0.43
182 0.51
183 0.58
184 0.64
185 0.69
186 0.76
187 0.82
188 0.87
189 0.88
190 0.87
191 0.88
192 0.85
193 0.82
194 0.74
195 0.65
196 0.54
197 0.48
198 0.39