Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A550CIN9

Protein Details
Accession A0A550CIN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-92AVSAISSKKRKRQPTTRTGRPKRSRRITAETPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-85KKRKRQPTTRTGRPKRSRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16449  RING-HC  
Amino Acid Sequences MSENGGDDAPLPAPITSRNREPRSRAASLVRAARSATSSRSRSRASSLTSIDLTDDTSSAVSAISSKKRKRQPTTRTGRPKRSRRITAETPDADIAFAAEGASEIAGPSGLSAEVSSSNAVFDLSFGSGDGDEVHPLPAQPDDYDEVETLPDIGLGTPPPADSSNKGKGKQRAIATPEPSETDAPGAATVDAPPPSPKAQTSLAEYTCPICFFAPTNATLTPCGHICCGSCLFTAVKTAMIRSAHTPEGLEARCPVCRAVIPGWDGYGGGVIGLKLRSKVTIDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.24
3 0.27
4 0.36
5 0.46
6 0.53
7 0.6
8 0.65
9 0.69
10 0.69
11 0.68
12 0.64
13 0.6
14 0.59
15 0.57
16 0.58
17 0.49
18 0.41
19 0.39
20 0.35
21 0.32
22 0.27
23 0.28
24 0.29
25 0.33
26 0.37
27 0.42
28 0.44
29 0.43
30 0.47
31 0.46
32 0.43
33 0.45
34 0.42
35 0.4
36 0.38
37 0.35
38 0.3
39 0.25
40 0.2
41 0.14
42 0.11
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.07
50 0.12
51 0.2
52 0.29
53 0.35
54 0.44
55 0.53
56 0.63
57 0.71
58 0.77
59 0.79
60 0.81
61 0.86
62 0.88
63 0.9
64 0.9
65 0.91
66 0.9
67 0.9
68 0.9
69 0.9
70 0.88
71 0.84
72 0.83
73 0.81
74 0.77
75 0.75
76 0.65
77 0.57
78 0.48
79 0.4
80 0.31
81 0.22
82 0.16
83 0.07
84 0.06
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.02
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.05
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.11
150 0.18
151 0.27
152 0.31
153 0.34
154 0.39
155 0.45
156 0.49
157 0.52
158 0.49
159 0.46
160 0.47
161 0.51
162 0.47
163 0.43
164 0.38
165 0.33
166 0.32
167 0.26
168 0.2
169 0.14
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.12
182 0.13
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.2
187 0.22
188 0.27
189 0.3
190 0.29
191 0.28
192 0.28
193 0.26
194 0.23
195 0.21
196 0.16
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.19
204 0.19
205 0.2
206 0.21
207 0.2
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.17
221 0.19
222 0.15
223 0.17
224 0.15
225 0.16
226 0.19
227 0.19
228 0.2
229 0.21
230 0.25
231 0.23
232 0.23
233 0.23
234 0.2
235 0.27
236 0.26
237 0.23
238 0.22
239 0.23
240 0.24
241 0.24
242 0.23
243 0.18
244 0.19
245 0.23
246 0.23
247 0.26
248 0.27
249 0.26
250 0.27
251 0.24
252 0.23
253 0.18
254 0.15
255 0.09
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.16